芋[Colocasiaesculenta(L.) Schott]的倍性水平及基因组特征解析

论文摘要

采用流式细胞术,对2个芋[Colocasiaesculenta(L.) Schott]品种苏芋1号和香蕉芋的倍性水平和DNA含量进行了测定,2倍基因组DNA含量分别为7.71 pg和5.25 pg,倍性分别为三倍体和二倍体。同时通过HiSeq 2500测序,分别获得240.53 Gb和87.69 Gb数据,芋基因组大小为2.08～2.38 Gb,GC含量为42.57%～42.75%,杂合度为0.52%～2.29%。根据苏芋1号的基因组数据,组装得到基因组序列为2.27 Gb,Contig N50为359 bp;共注释获得24 302个基因,99.43%的基因可注释到6个公共数据库;筛选出928 987个SSR位点。

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类型: 期刊论文

作者: 殷剑美,王立,蒋璐,韩晓勇,郭文琦,李春宏,张培通

关键词: 流式细胞术,基因组测序,基因功能注释,倍型水平,基因组特征

来源: 江苏农业学报 2019年06期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 园艺

单位: 江苏省农业科学院经济作物研究所江苏省农业生物学重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31501776),江苏省农业生物学重点实验室项目(4911707Z201707)

分类号: S632.3

页码: 1284-1291

总页数: 8

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标签：流式细胞术论文;  基因组测序论文;  基因功能注释论文;  倍型水平论文;  基因组特征论文;