云南部分地区猪流行性腹泻病毒S基因克隆与序列分析

云南部分地区猪流行性腹泻病毒S基因克隆与序列分析

论文摘要

为了解云南省不同地区猪流行性腹泻病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus,PEDV)S基因的核苷酸序列和氨基酸序列与疫苗毒株和早期分离株S基因的差异性,本实验分别从云南安宁、宣威、昆明、师宗、陆良、富民、临沧、曲靖8个地区采集疑似感染PEDV仔猪的小肠及粪便样品46份,采用RT-PCR方法进行PEDV S基因的扩增、测序分析。结果显示:云南安宁、宣威、临沧、富民的PEDV阳性率分别为83.33%、57.14%、100%、62.50%,46份样品中有21份样品为PEDV阳性,阳性检出率高达45.65%;将云南安宁、宣威、临沧、富民检测到的PEDV的S基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列与PEDV标准株CV777、韩国DR13株及其致弱株、国内早期的甘肃株、上海株、2010年至2012年的各地分离株进行比较分析,发现这次从云南检测到的PEDV毒株均为同一株毒株,此毒株与浙江株、黑龙江株、河南株、广东株、北京株、湖北株和福建株相似,与疫苗毒株和早期分离株的S基因相比发生了明显的变化。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 病料来源:
  •     1.1.2 主要试剂:
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 引物设计与合成:
  •     1.2.2 样品RNA的提取:
  •     1.2.3 PEDV S基因的RT-PCR扩增:
  •     1.2.4 PEDV S基因推导的氨基酸序列分析:
  •     1.2.5 PEDV S基因核苷酸序列同源性比对分析:
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PEDV S基因的RT-PCR扩增结果
  •   2.2 云南不同地区采集的样品检测结果
  •   2.3 PEDVS基因核苷酸序列及推导的氨基酸序列同源性比对分析结果
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 周玉照,张小苗,赵天智,普星星,张以芳

    关键词: 基因,氨基酸突变,同源性

    来源: 上海畜牧兽医通讯 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 大理农林职业技术学院动物科学系,建水县动物疫病预防控制中心,云南农业大学动物医学院

    分类号: S852.651

    DOI: 10.14170/j.cnki.cn31-1278/s.2019.01.003

    页码: 10-12

    总页数: 3

    文件大小: 283K

    下载量: 112

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