大蜡螟触角转录组及嗅觉相关基因分析

大蜡螟触角转录组及嗅觉相关基因分析

论文摘要

【目的】大蜡螟Galleria mellonella Linnaeus是世界范围内蜂群中普遍存在的害虫,给世界养蜂业带来了巨大的危害。本研究旨在建立大蜡螟触角转录组数据库,挖掘大蜡螟嗅觉相关基因,为今后利用嗅觉基因靶标防治大蜡螟提供分子生物学信息数据。【方法】利用高通量测序平台(Illumina HiSeqTM 2500)对大蜡螟触角进行转录组测序和组装,通过筛选转录组数据库,鉴定出嗅觉相关基因。【结果】成功构建了大蜡螟触角转录组,经序列拼接获得188 278条unigenes,平均长度为781 bp,N50为1 161 bp。使用BLAST软件将大蜡螟触角unigenes序列与7大公共数据库比对,共注释到108 047条unigenes,其中NR数据库注释的unigenes最多,为78 746条,占41.82%,且NR注释的大蜡螟unigenes中与家蚕Bombyx mori类似基因最多,为18.4%。将unigenes与GO数据库比对发现,共有69 794条unigenes注释到GO数据库中,按照其所参与的生物过程、细胞组分和分子功能对其进行GO功能分类,共含有55个亚类,其中参与结合和催化功能及代谢过程的unigenes比例较大;KEGG代谢途径分析表明,14699条unigenes形成231条代谢通路,其中被注释在信号传导通路中的unigenes最多,为2 401条,占16.33%。进一步基因注释分析,鉴定得到226个候选嗅觉相关基因,包括52个气味结合蛋白(Odorant binding proteins,OBPs)基因,36个化学感受蛋白(Chemosensory proteins,CSPs)基因,80个气味受体(Odorant receptors,ORs)基因,56个离子型受体(Ionotropic receptors,IRs)基因和2个感觉神经元膜蛋白(Sensory neuron membrane proteins,SNMPs)基因;通过比较雌、雄大蜡螟转录组鉴定出114个差异表达基因,包括5个嗅觉相关基因(OBP8、OBP17、CSP3、CSP34和OR15);114个差异表达基因中,66个基因在雌蛾触角中高表达,48个基因在雄蛾触角中高表达。【结论】本研究获得了大蜡螟触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究大蜡螟的基因功能及嗅觉感受机制奠定分子基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 供试虫源
  •   1.2 样品cDNA文库构建与测序
  •   1.3 转录组的拼接组装与注释
  •   1.4 嗅觉相关基因的鉴定及序列分析
  •   1.5 差异表达基因分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 大蜡螟触角转录组测序统计与数据组装
  •   2.2 unigene功能注释
  •   2.3 嗅觉相关蛋白基因的鉴定与序列分析
  •   2.4 差异表达基因分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 杨爽,赵慧婷,徐凯,郭丽娜,杜亚丽,李新宇,苏文婷,冯宇佳,龙登隆,姜玉锁

    关键词: 大蜡螟,触角转录组,高通量测序,基因注释,嗅觉相关基因,差异表达基因

    来源: 应用昆虫学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 蚕蜂与野生动物保护

    单位: 云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所,山西农业大学动物科技学院,山西农业大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金应急管理项目(31640080),国家蜂产业技术体系建设专项(CARS-44-SYZ 16)

    分类号: S895

    页码: 1279-1291

    总页数: 13

    文件大小: 2768K

    下载量: 170

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