导读:本文包含了肝脏蛋白质组学论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:青鱼,嗜水气单胞菌,肝脏,iTRAQ
肝脏蛋白质组学论文文献综述
刘问[1]（2019）在《嗜水气单胞菌感染青鱼肝脏的蛋白质组学分析》一文中研究指出采用同重同位素标记相对与绝对定量(iTRAQ)结合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术,分析嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染青鱼(Mylopharyngodon piceus)后青鱼肝脏组织的差异表达蛋白。以致病性嗜水气单胞菌菌株BCK0712注射感染健康青鱼,24h后采集感染组和对照组青鱼肝脏,开展蛋白质组学分析。通过数据库检索,共鉴定到4475个肝脏组织蛋白,从中筛选到188个差异表达蛋白,其中表达上调的蛋白70个,表达下调的蛋白118个。经生物信息学分析,表明这些差异表达蛋白主要参与了补体和凝血级联反应、剪接体、细胞内吞作用、氧化磷酸化、碳代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、色氨酸代谢等通路。组织病理分析表明,青鱼感染嗜水气单胞菌后肝脏出现了明显的病理变化,主要表现为肝细胞边界不分明、细胞核固缩、肝板排列紊乱、有出血现象等。研究结果为进一步深入探究嗜水气单胞菌的致病机制提供了理论基础。(本文来源于《水生生物学报》期刊2019年02期）
田雪文[2]（2018）在《基于iTRAQ的低氧运动肥胖大鼠肝脏蛋白质组学及Wnt/β-catenin信号通路的作用机制研究》一文中研究指出研究目的:低氧运动能够改善脂代谢,降低血脂水平,抑制脂肪酸合成,促进脂肪酸分解和氧化,具有明显的降体重、减体脂的作用。本研究采用iTRAQ蛋白质组学技术高通量、高效率地鉴定及筛选低氧运动环境下肥胖大鼠肝脏组织中差异蛋白的表达情况,从整体水平上对影响低氧运动脂肪代谢的差异蛋白和信号通路进行系统研究。通过蛋白质组学发现Wnt/β-catenin信号通路可能参与了低氧运动的脂肪代谢,因此在mRNA和蛋白水平验证Wnt/β-catenin信号通路在低氧运动脂肪形成中的作用,并开展DNA甲基化的研究,从而进一步完善低氧运动影响脂肪形成和脂肪代谢的理论体系。研究方法:本研究构建了肥胖大鼠模型,分为常氧安静组、低氧安静组,常氧运动组,低氧运动组,低氧浓度13.6%(相当于海拔3500米),运动组用水平跑台进行耐力训练,训练强度常氧组25 m/min,低氧组20 m/min,持续运动1h/d、5d/w,共4周。采用iTRAQ蛋白质组学技术对低氧安静组和常氧安静组,低氧运动组和常氧运动组的肥胖大鼠肝脏组织中的差异表达蛋白进行了筛选。通过WB验证PPAR信号通路、Wnt信号通路、脂肪酸分解等蛋白信号通路相关蛋白FABP4、CacyBP/SIP、ACAA1蛋白的表达变化情况。通过Real time PCR和WB检测Wnt/β-catenin信号通路相关分子mRNA和蛋白变化情况。采用简化表达亚硫酸盐测序RRBS技术对低氧运动组与常氧运动组的DNA进行高通量测序分析,分析并筛选出两组标本的Wnt/β-catenin信号通路相关基因DNA的CpG岛和DMR情况。研究结果:结果一:1.低氧和运动降低了肥胖大鼠体重、脂体比、Lee'S指数、TC、TG和LDL-C,可以改善肥胖大鼠的血脂水平,降低体脂,低氧运动的效果最为显着。2.常氧安静组和低氧安静组之间有70个蛋白质表达存在显着性差异,其中,33个蛋白质上调表达,37个蛋白质下调表达。低氧运动组和常氧运动组有110个显着差异表达的蛋白质,其中,61个蛋白质上调表达,49个蛋白质下调表达。3.KEGG分析显示:在常氧安静组和低氧安静组,有14条信号通路发生了显着性变化,在常氧运动组和低氧运动组,有11条信号通路发生了显着性变化。4.FABP4低氧安静组、常氧运动组和低氧运动组比常氧安静组蛋白表达量显着性升高,CacyBP/SIP在低氧运动时表达量显着降低,ACAA1在低氧运动组表达量显着升高,这些蛋白可能参与了肥胖大鼠低氧及低氧运动下的脂肪代谢。结果二:1.低氧运动组比常氧运动组Wnt/β-catenin信号通路下游相关分子c-myc、β-catenin的mRNA表达量显着升高(p<0.05),APC、GSK3β的mRNA表达量显着降低(p<0.05),CCND1低氧运动比常氧运动表达没有显着性变化。2.低氧运动组比常氧运动组Wnt/β-catenin信号通路相关分子c-myc、β-catenin蛋白表达量显着升高(p<0.05)。结果叁:1.比较分析低氧运动肥胖大鼠和常氧运动肥胖大鼠全基因组DNA的CpG岛发生甲基化的基因有675个具有显着差异性,213个DMR差异区域,低氧运动组比常氧运动组的甲基化高1.1%。2.Wnt信号通路相关的基因,CpG启动子甲基化明显的位点包括:Fzd2、Fzd9、Wnt16、Wnt2b、Sfrp2、Sfrp1、Sox2、Sox1等,DMR甲基化明显的差异区域包括:cdc、Fzd10、Gsk-3β、PI3k、Wnt16、Wnt6。Wnt信号通路相关的基因CpG和DMR甲基化明显。研究结论:1、通过iTRAQ蛋白质组学分析:常氧安静组和低氧安静组有70个蛋白质有显着性差异,有14条信号通路发生了显着变化;低氧运动组和常氧运动组有110个蛋白质有显着性差异,有11条信号通路发生了显着变化。2、Wnt/β-catenin信号通路在低氧运动环境下肥胖大鼠脂肪形成中被激活,Wnt/β-catenin信号通路参与了低氧运动肥胖大鼠的脂肪形成和脂肪代谢。3、比较分析低氧运动肥胖大鼠和常氧运动肥胖大鼠全基因组DNA的CpG岛发生甲基化的基因有675个具有显着差异性,213个DMR差异区域。Wnt信号通路相关的基因CpG和DMR甲基化明显。(本文来源于《上海体育学院》期刊2018-04-09）
张立亚[3]（2018）在《亚甲减小鼠肝脏脂代谢相关的miRNA表达谱和蛋白质组学特征研究》一文中研究指出研究背景:亚临床甲状腺功能减退症(Subclinical hypothyroidism,SCH)简称为亚甲减或亚临床甲减,是多病因导致的一组综合征。其血清学特点是游离甲状腺素(FT4)在正常范围内而仅仅是促甲状腺激素(TSH)水平较正常范围升高。流行病学调查研究显示,近年来亚甲减发病率呈逐年上升趋势,西方发达国家的发病率约为4%-20%,在亚洲国家的发病率更高,高达17%-20%。尽管SCH临床症状轻微或不显着,但大量研究报道SCH经常伴有血脂紊乱,并且是冠心病和非酒精性脂肪肝的独立危险因素。在SCH的进程中常伴有不同程度的脂质代谢紊乱,但其分子机制尚不十分清楚,而肝脏在脂代谢进程中发挥了关键性作用,是脂质代谢的核心场所之一,因此肝脏可以作为研究亚甲减脂质代谢紊乱的靶器官。近些年来研究发现,MicroRNA(mmiRNA)是一类长度约21-23个核苷酸的短的非编码RNA,也被称为微小RNA。miRNA部分结合于互补的靶位点,主要在mRNA 3'非翻译区(3' UTRs),导致mRNA发生降解或翻译抑制。研究报道miRNA在包括非酒精性脂肪肝(Non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)等许多种肝脏疾病中进行差异调控,影响肝脏病理生理环境,且miRNA的种类及表达情况具有组织特异性,特定的miRNA反映出体内一些特定的病理及生理过程。然而,目前尚未研究报道miRNA在亚甲减肝脏脂质代谢紊乱中的作用。蛋白质组学研究的是在特定时间内特定的生物体或特定组织中表达蛋白的系统分析和记录。其在组织细胞的整体蛋白质水平上揭示生命活动的基本规律,获得对细胞生理、病理过程及调控网络的全面而深入的了解。蛋白质组学作为基因组学研究的拓展,在世界生命科学领域的科学研究中成为一个极其重要的组成部分。蛋白质组学在脂质代谢研究中具有广泛的应用,而基于质谱技术的第二代无凝胶同位素标签相对和绝对定量(Isobaric Tags For Relative And Absolute Quantitation,iTRAQ)蛋白质组学分析能给出更精确的蛋白质水平定量,分析结果灵敏、可靠,可以同时给出每一个蛋白的分子量和丰富的结构信息;此外液相色谱一串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)检测灵敏度高、界限低。是本课题非常合适的一种研究方法。近些年愈来愈多的研究发现,miRNA对脂代谢的调控作用通过庞大的调控网络得到实现。蛋白质组学已被广泛应用于miRNA调控的生物功能蛋白的鉴定和量化。然而尚未有研究报道亚甲减肝脏中脂代谢相关miRNA表达谱和蛋白质组的特征变化。研究目的:本研究旨在探索小鼠SCH模型中肝脏脂质代谢紊乱相关miRNA表达谱和蛋白质组学的特征变化,对差异表达的miRNA和蛋白质进行深入的生物信息学分析,构建SCH小鼠肝脏中miRNA和蛋白质之间的相互作用模块,以期对SCH小鼠肝脏脂代谢紊乱的发生发展有更加全面的了解和认识,为进一步探索SCH脂代谢紊乱的相关机制奠定分子基础。研究方法:1.小鼠SCH模型的建立:7周龄雄性C57BL/6小鼠适应性喂养一周后,随机分为两组,分别给予甲巯基咪唑(MMI,0.08mg/kg/d)饮水(亚甲减组)和普通饮水(对照组)。MMI喂养16周后,采用ELISA的方法检测小鼠血清促甲状腺激素(TSH)水平,采取I125标记放免法测定小鼠的血清中游离甲状腺素(FT4)水平评估小鼠的血清甲状腺功能。通过检测小鼠的血清肝功能指标谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)排除药物对肝脏产生的副作用。2.血清总胆固醇(TC)、甘油叁酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)以及高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)采用山东省立医院内分泌实验室全自动生化分析仪检测;肝组织TG和TC含量测定按照北京普利莱公司生产的检测试剂盒规范操作。肝脏油红0染色评估小鼠肝脏脂质沉积情况。3.实时荧光定量PCR(qPCR)检测小鼠肝脏中脂代谢相关miRNA表达谱的变化。4.iTRAQ试剂标记酶解蛋白联合/LC-MS/MS技术提取小鼠肝脏蛋白,并用软件ProteinPilotTM 4.5得到定量的蛋白质,设定SCH/CON蛋白质表达量>1.80或<0.56为筛选差异表达蛋白上调或下调的界限值。5.利用PANTHER和David分析差异蛋白的生物学功能及参与调节的信号通路。6.采用 Cluster version 3.0 和 Java Treeview 1.6 对 miRNA 表达谱和差异蛋白整体表达模式进行凝聚层次聚类分析。7.利用TargetScan和miRanda两种分析网站寻找差异表达的蛋白中miRNA的靶分子,结果进行重迭,构建miRNA-蛋白质调控模块。结果:1.小鼠SCH模型的建立:SCH的临床特点是血清TSH水平升高,而血清FT4没有超出正常范围。MMI(0.08mg/kg/d)饮水喂养16周后检测到小鼠SCH模型血清TSH水平较对照组小鼠增加明显(P<0.01),但是血清FT4水平在两组小鼠间无显着性差异(P>0.05)。上述变化符合SCH的临床特点和诊断标准。2.SCH小鼠脂质谱异常:血脂(TG、TC、LDL-C)在SCH组小鼠中显着高于对照组小鼠(P<0.05),而血清HDL-C水平在SCH组和对照组无显着差异(P>0.05)。SCH小鼠肝脏中TC及TG的含量也有明显增加(P<0.05);油红0染色显示:SCH小鼠肝脏中脂质聚集也增多。3.入选的 17 个 mi croRNAs 表达谱变化:miR-1 0b-5p、mi R-24-3p、miR-29a-3p、miR-30b-5p、miR-34a-5p、miR-125b-5p、miR-130a-5p 及 miR-199a-5p 在小鼠SCH小鼠肝脏中表达显着下调(P<0.05),差异有统计学意义。对17个脂代谢相关miRNAs分层凝聚聚类分析,结果显示:各组大部分个体可以聚在一起,9只SCH小鼠中8只可以聚在一起,7只对照组小鼠中6只可以聚在一起。4.小鼠肝脏蛋白质表达谱的变化:iTRAQ定量蛋白质组学研究结果显示,在SCH组和对照组中得到1969个蛋白的定量结果,设定SCH/CON蛋白质表达量>1.80或<0.56为显着差异表达的界限值,发现有36个蛋白发生了显着性的差异表达,其中表达上调的有22个,表达下调的有14个。GO分析结果显示,大多数蛋白与“新陈代谢”和“细胞过程”相关,并且是位于细胞及细胞器中的结合蛋白或具有催化活性的蛋白。我们进一步通过KEGG分子通路分析显示:大多数差异蛋白参与阿尔兹海默病、氧化磷酸化、帕金森病以及非酒精性脂肪肝等多条通路的调控。基于差异蛋白质的分层聚类显示:两组具有显着的分离,表明SCH小鼠和对照小鼠肝脏蛋白表现出明显不同。5.miRNA-蛋白质调控模块分析:本研究通过生物信息软件分析预测mmiRNA的靶分子,构建了 SCH小鼠肝脏脂代谢相关的差异miRNA和差异蛋白的调控模块。得到了 3个miRNA,5个蛋白以及5个miRNA-蛋白调控关系。其中miR-34a-5p调控的是 Aldh3a2 和 Txn;miR-130a-3p 调控的是 Eef1b 和 Psap;miR-24-5p 调控的是Selenbp2。结果提示这些miRNAs和蛋白可能参与SCH小鼠肝脏脂代谢紊乱的发生发展。结论及意义:1.小鼠SCH模型存在血脂异常和肝脂代谢紊乱。2.SCH小鼠肝脏miRNA表达谱发生变化:miR-10b-5p、miR-24-3p、miR-29a-3p、miR-30b-5p、miR-34a-5p、mmiR-125b-5p、miR-130a-5p 和miR-199a-5p表达显着下调。3.miR-34a-5p/Aldh3a2,mmiR-34a-5p/Txn,miR-130a-3p/Eef1b,miR-130a-3p/Psap,miR-24-5p/Selenbp2调控关系为SCH脂代谢紊乱发病机制提供分子理论基础。(本文来源于《山东大学》期刊2018-03-28）
吴优[4]（2017）在《CUMS抑郁模型小鼠肝脏的iTRAQ定量蛋白质组学研究》一文中研究指出研究背景抑郁症是一种高度流行且致残的精神疾病,对人们的生活质量和机体功能有重大损害。然而,我们对抑郁表型及其潜在的病理生理学机制之间的关系仍然知之甚少。现阶段对抑郁症的研究主要集中在脑区,脑与机体的联合探索可能会为抑郁症病因的全面理解提供新的线索。作为人体最大的内脏器官,肝脏在机体生物转化,合成,代谢等一系列生理和生化反应中发挥着重要的作用。但目前仍然没有用蛋白质组学方法对抑郁模型小鼠肝脏中蛋白表达进行评估的相关研究。目的本研究旨在用iTRAQ标记和LC-MS/MS联合的蛋白质组学技术鉴定CUMS抑郁模型小鼠肝脏的蛋白表达谱,用特定的筛选条件寻找相关的差异蛋白,初步分析这些差异蛋白及其所涉及通路的病理生理机制,探讨抑郁状态下肝脏结构功能改变与蛋白表达谱变化的关系,为诊治抑郁症提供新的思路和方向。方法经过环境适应和一周的糖水训练之后,我们随机地把40只正常的C57BL/6J雄性小鼠分为抑郁模型组和正常对照组(20:20)。20只模型组小鼠进行4周的慢性不可预知性温和刺激之后,将两组进行行为学评估,若模型成立,从每组中随机选取小鼠肝脏组织(10:10)进行itraq蛋白组学鉴定,对差异蛋白进行生物信息学分析,另每组选取6只小鼠肝脏组织对差异蛋白和通路进行免疫印迹法(Western blot,WB)验证。结果1.模型组CUMS之后对两组的体重,糖水偏好,强迫游泳,旷场试验等行为学数据进行统计学分析,有显着差异,证明造模成功。2.Itraq串联质谱鉴定出4000多种蛋白质,用特殊肽段大于等于2,1.2以上差异倍数,P值小于0.05叁个条件,筛选出66种最显着差异的蛋白质,用于进一步的生物信息学分析。3.通过信号网络分析(IPA),我们发现这66种差异蛋白与炎症反应,免疫调节,脂质代谢和NFκB信号通路等病理生理过程相关。4.此外,通过免疫印迹法(Western blot,WB)验证了与这些通路密切相关的四种蛋白质,血红蛋白(HPX),触珠蛋白(HP),细胞色素P4502A4(CYP2A4)和胆汁盐磺基转移酶1(SULT2A1),结果与itraq一致。结论我们的研究首次报道了CUMS抑郁模型小鼠中肝脏组织的蛋白表达谱,为以后研究抑郁症多层面的机制提供了如肝-脑轴等新的见解。(本文来源于《重庆医科大学》期刊2017-05-01）
秦雨萌[5]（2017）在《肝纤维化大鼠肝脏去细胞生物支架蛋白质组学研究》一文中研究指出【目的】基于器官去细胞生物支架制备技术,通过双向电泳(2-DE)电泳、LC-MS/MS技术比较正常大鼠与四氯化碳(CCL_4,carbon tetrachloride)诱导肝纤维化大鼠模型2W、4W、6W和8W组去细胞生物支架蛋白质,筛选差异蛋白,通过对模型形成过程大鼠肝脏生物支架蛋白质动态变化观察,为后续研究生物支架改变的目的基因调控,寻找诊断标准及制定合理的分级奠定实验基础。【方法】通过背部皮下注射CCL_4联合高脂饮食和乙醇共同诱导大鼠肝纤维化的形成,造模周期共8W。在此病理模型的基础上,利用去细胞生物支架制备技术,将肝纤维化大鼠型2W、4W、6W和8W与正常大鼠OW组制备成生物支架,进行蛋白质组学研究。首先利用HE和Masson染色观察肝脏的组织学改变和生物支架的组织学及超微结构改变,再结合血清学检测进一步对肝纤维化模型进行鉴定;其次利用免疫荧光染色对5组胶原蛋白Ⅳ和Ⅰ、层粘连蛋白(LN,Laminin)和纤维连接蛋白(FN,Fibronectin)观察细胞外基质(ECM,Extracellular Matrix)的主要成分,DNA定量和定性分析生物支架中残留DNA的浓度和片段长度,Elisa对ECM中残留的各种细胞因子含量进行检测,对肝纤维化生物支架的制备进行鉴定;最后利用LC-MS/MS技术对5组大鼠的生物支架进行全蛋白表达谱进行质谱鉴定,对鉴定到的蛋白质进行定量,依照5组内肽段峰面积强度的定量(Indensity based absolute quantification,or iBAQ)~([1])值之间的比值对特定的蛋白表达变化进行评定,总结肝纤维化在不同时期差异蛋白的表达谱。应用GO(Gene Ontology)功能分类分析和KEGG(Kyoto Engoolpedia of Genes and Genomes)信号通路的富集分析方法对鉴定到的差异蛋白进行表达分析。【结果】(1)利用CCL_4复合因素造模法成功的制备肝纤维化模型;(2)利用Triton X-100联合NaOH灌注法成功的制备肝纤维化生物支架;(3)肝纤维化的形成与表达上调的CYP4A10、CYP2C12和CYP2C6介导的亚油酸代谢与甾类激素生物合成、视黄素代谢与花生四烯酸代谢、炎性介质介导色氨酸信号通路与视黄素代谢、花生四烯酸代谢这4条信号通路密切相关。【结论】肝纤维化的形成是一个复杂的信号转导过程,CYP4A10、CYP2C12和CYP2C6可能是肝纤维化发生和发展过程中的关键蛋白,值得下一步深入探讨研究。(本文来源于《南华大学》期刊2017-05-01）
[6]（2016）在《Science:对肝脏线粒体功能进行系统蛋白质组学研究》一文中研究指出科学家们通过对小鼠开展大规模蛋白质组学研究获得脂肪和能量代谢的分子遗传背景方面的新认识。蛋白质组是一种生物体或某一种细胞、一种组织的基因组所表达的全部蛋白。在一项新的研究中,由瑞士联邦理工学院教授(ETHZurich)RuediAebersold领导的一个专门从事蛋白质组学研究的团队和由瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)教授JohanAuwerx领导的一个专门从事于线粒体生理学与肝脏疾病研究的团队合作开展这项突破性的研究项目。就这项研究而言,蛋白质组指的是小鼠肝脏中表(本文来源于《现代生物医学进展》期刊2016年21期）
雷萍,贾连群,陈阳,王俊岩,任路[7]（2016）在《基于iTRAQ技术的脾虚高脂血症大鼠肝脏蛋白质组学特征分析》一文中研究指出目的:通过i TRAQ技术分析脾虚高脂血症大鼠肝脏蛋白质组学差异,进一步探讨脾虚高脂血症的病理机制。方法:20只健康雄性SD大鼠随机分为空白对照组和脾虚高脂血症组,空白对照组给予普通饲料,脾虚高脂血症组通过高脂饲料结合劳倦过度加饮食不节造模。8周后检测大鼠血脂水平、肝脏形态学变化,并分离提取肝脏总蛋白,通过i TRAQ技术对脾虚高脂血症大鼠肝脏进行蛋白质组质谱检测。结果:脾虚高脂血症大鼠出现血脂代谢异常和肝脏形态学改变,并且蛋白质组结果分析得到305个上调蛋白和263个下调蛋白,共计568个差异蛋白。作者从中挑选出与脂类代谢相关的7个蛋白加以分析。结论:脾虚高脂血症时出现血脂紊乱以及肝脏形态学发生变化可能与7-脱氢胆固醇还原酶和固醇载体蛋白2上调和载脂蛋白AI、载脂蛋白AⅡ和载脂蛋白AV下调有关,与一些糖类代谢相关蛋白也有关。(本文来源于《辽宁中医杂志》期刊2016年07期）
刘雅丽,曾涛,杜雪,宋美娥,章晓伟[8]（2016）在《辅助和正常出壳鸭胚肝脏差异蛋白质组学分析》一文中研究指出本研究应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)技术结合质谱鉴定与生物信息学方法,研究鸭(Anas platyrhynchos domestica)胚胎(鸭胚)孵化过程中出现弱胚现象的分子调控机理,筛选辅助出壳鸭胚肝脏组织差异表达的蛋白。结果表明,共鉴定获得136个差异蛋白,与正常出壳组相比,辅助出壳组有76个蛋白表达上调,60个蛋白表达下调。基因本体(Gene Ontology,GO)注释和通路富集分析表明,这些差异蛋白主要与糖代谢、氧气运输、细胞骨架、应激反应以及氧化还原代谢等生物过程相关,其中辅助出壳组糖酵解通路中的4种酶和细胞呼吸通路中的3种酶表达均显着上调(P<0.05),参与肌动蛋白丝生物过程的7种蛋白也均表达上调,而参与氧气运输的3种血红蛋白和应激保护的3种热休克蛋白表达显着下调(P<0.05)。利用q RT-PCR检测顺乌头酸酶1(cytoplasmic aconitate hydratase 1,ACO1)、醛缩酶B(fructose-bisphosphate aldolase B,ALDOB)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶1(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 1,G3P1)和热休克71 k D同源蛋白(heat shock cognate 71 k D protein,HSPA8)4个基因m RNA水平的表达,结果仅ACO1 m RNA和蛋白质水平表达模式一致。结果表明,弱胚可能与糖代谢和呼吸代谢等生物过程变化有关,辅助出壳组能量和代谢率较低。研究结果为更好理解鸭胚孵化过程中出现弱胚现象的分子调控机理提供了蛋白质组学信息。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2016年09期）
戴建业,王初[9]（2016）在《基于化学蛋白质组学的黄芩苷抗肝脏脂肪化机制研究》一文中研究指出脂肪性肝病是世界最为常见的疾病之一。它不仅包括单纯性肝脏脂肪化,而且会进一步的发展为脂肪性肝炎、肝硬化、纤维化甚至肝癌。在脂肪性肝病的疾病进程中,肝脏脂肪化是其共同特征。然而现阶段主流医学并没有针对肝脏脂肪化的有效的治疗方法。随着传统中医药在世界健康体系中发挥了越来越重要的作用,其安全性和有效性得到越来越多的认可。在传统中药中,黄芩作为治疗肝脏疾病的常用药引起了大家的注意。现代药理学证明,黄芩具有抗脂肪肝、抗炎、抗氧化、抗纤维化等作用。黄芩苷作为黄芩中最主要活性成分,在其抗脂肪肝的疗效中发挥着重要作用。虽然已有大量研究对于黄芩苷作用机制进行了探讨,但是对于其直接作用靶点的系统研究未见报道。因此,我们利用化学蛋白质组学的方法对于黄芩苷抗脂质化的机制进行了系统研究。最终发现,黄芩苷是通过调节脂肪酸β氧化发挥其抗脂质化作用的。(本文来源于《中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十八分会：化学生物学》期刊2016-07-01）
刘春朋[10]（2015）在《日粮硒缺乏对鸡肝脏蛋白质组学及自噬变化的影响》一文中研究指出硒(Selenium,Se)是动物机体必须的一种微量元素,对动物的生长、发育、繁殖等方面都起到极其重要的作用。肝脏是畜禽缺硒性疾病的主要靶器官之一。硒缺乏时,肝代谢功能紊乱,导致肝细胞损伤,甚至坏死。大量研究从氧化应激、凋亡和炎症等不同角度对缺硒性肝损伤进行探讨,但其确切机制还不清楚。因此,进一步对缺硒鸡肝脏组织的损伤机制进行探讨,将进一步丰富这一领域的研究内容。本试验在建立鸡缺硒性肝组织损伤模型基础上,对肝脏组织进行显微和超微结构观察;检测了氧化应激相关因子(GSH-Px、GSH、MDA、NO和iNOS)的含量和/或酶活性,实时定量 PCR法检测了21 种硒蛋白(Gpx1、Gpx2、Gpx3、Gpx4、Sepn1、Sepp1、Selo、Sepx1、Selu、Txnrd1、Txnrd2、Txnrd3、Dio1、Dio2、Dio3、SPS2、Seli、Selm、SelPb、Sep15 和Sels)、热休克蛋白基因家族(Hsp27、Hsp40、Hsp60、Hsp70和Hsp90)mRNA的表达量;运用蛋白质组学技术对硒缺乏鸡肝脏组织进行蛋白组水平检测,分析出上调或下调蛋白,筛选出自噬相关通路;通过PCR法检测自噬相关基因(LC3-1、LC3-2、ATG5、Dynein、TOR和Beclin1)mRNA的表达量和蛋白免疫印迹法检测(LC3-1、LC3-2、Dynein和Beclin1)蛋白含量,进而验证筛选出的自噬通路,旨在从自噬角度阐明鸡缺硒性肝损伤的发病机制,为防治缺硒性肝损伤提供理论依据,也为比较医学提供借鉴。本研究结果如下:(1)病理组织学观察到饲喂低硒日粮的鸡肝细胞内发生炎性浸润、肝组织结构发生破坏,甚至出现肝组织坏死,超微结构观察到低硒时鸡肝细胞亚细胞结构(线粒体和内质网)受损明显,同时还在肝细胞内发现了自噬,证明自噬参与硒缺乏性肝损伤的病理过程。(2)试验组肝组织中GSH-Px活性和GSH含量随着时间延长,呈逐渐下降趋势,而MDA和NO含量及iNOS活性呈逐渐升高趋势,与对照组相比差异显着(P<0.05),表明随着时间的延长,肝组织中氧化应激加重。(3)在试验期间,试验组肝组织中18种硒蛋白基因(Gpx1、Gpx2、Gpx3、Gpx4、Sepn1、Sepp1、Selo、Sepx1、Selu、Txnrd1、Txnrd2、Txnrd3、Dio1、Dio2、SPS2、Selm、SelPb 和Sels)mRNA表达量均呈下降趋势,Sep15基因则呈现先升高后降低趋势,与对照组相比差异显着(P<0.05),Seli和Dio3基因mRNA表达量与对照组相比差异不显着,提示在鸡肝组织中硒调控硒蛋白基因表达存在差异性。(4)持续的硒缺乏导致鸡肝脏Hsp27、Hsp40、Hsp60、Hsp70和Hsp90的mRNA表达增加,Hsp60、Hsp70和Hsp90的蛋白表达也随之上调,表明其参与了肝损伤的发生。(5)通过蛋白质组学初步分析,发现缺硒致鸡肝脏中113个差异蛋白上调,95个差异蛋白下调。KEGG代谢通路分析表明差异蛋白主要参与自噬相关通路,进一步对自噬通路进行Pathway富集分析发现差异性表达蛋白质主要参与6条自噬信号通路,其中MAPK和mTOR信号途径是主要富集通路。(6)试验组肝组织中LC3-1、LC3-2、ATG5、Dynein和Beclin1随着时间延长呈逐渐升高趋势,而TOR则是呈先升高后降低趋势,与对照组相比差异显着(P<0.05)。结合形态学结果表明,自噬是缺硒性肝损伤病理机制之一。综上所述,缺硒时鸡肝脏发生氧化应激损伤,鸡肝脏组织中HSPs表达量增加,通过蛋白质组学分析,筛选出自噬的主要信号通路。从形态学和自噬相关基因检测结果证实,自噬是缺硒性肝损伤病理机制之一。这一结果丰富了缺硒性肝损伤的病理学机制,为进一步研究缺硒性肝损伤和比较医学提供参考。(本文来源于《东北农业大学》期刊2015-12-01）
肝脏蛋白质组学论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
研究目的:低氧运动能够改善脂代谢,降低血脂水平,抑制脂肪酸合成,促进脂肪酸分解和氧化,具有明显的降体重、减体脂的作用。本研究采用iTRAQ蛋白质组学技术高通量、高效率地鉴定及筛选低氧运动环境下肥胖大鼠肝脏组织中差异蛋白的表达情况,从整体水平上对影响低氧运动脂肪代谢的差异蛋白和信号通路进行系统研究。通过蛋白质组学发现Wnt/β-catenin信号通路可能参与了低氧运动的脂肪代谢,因此在mRNA和蛋白水平验证Wnt/β-catenin信号通路在低氧运动脂肪形成中的作用,并开展DNA甲基化的研究,从而进一步完善低氧运动影响脂肪形成和脂肪代谢的理论体系。研究方法:本研究构建了肥胖大鼠模型,分为常氧安静组、低氧安静组,常氧运动组,低氧运动组,低氧浓度13.6%(相当于海拔3500米),运动组用水平跑台进行耐力训练,训练强度常氧组25 m/min,低氧组20 m/min,持续运动1h/d、5d/w,共4周。采用iTRAQ蛋白质组学技术对低氧安静组和常氧安静组,低氧运动组和常氧运动组的肥胖大鼠肝脏组织中的差异表达蛋白进行了筛选。通过WB验证PPAR信号通路、Wnt信号通路、脂肪酸分解等蛋白信号通路相关蛋白FABP4、CacyBP/SIP、ACAA1蛋白的表达变化情况。通过Real time PCR和WB检测Wnt/β-catenin信号通路相关分子mRNA和蛋白变化情况。采用简化表达亚硫酸盐测序RRBS技术对低氧运动组与常氧运动组的DNA进行高通量测序分析,分析并筛选出两组标本的Wnt/β-catenin信号通路相关基因DNA的CpG岛和DMR情况。研究结果:结果一:1.低氧和运动降低了肥胖大鼠体重、脂体比、Lee'S指数、TC、TG和LDL-C,可以改善肥胖大鼠的血脂水平,降低体脂,低氧运动的效果最为显着。2.常氧安静组和低氧安静组之间有70个蛋白质表达存在显着性差异,其中,33个蛋白质上调表达,37个蛋白质下调表达。低氧运动组和常氧运动组有110个显着差异表达的蛋白质,其中,61个蛋白质上调表达,49个蛋白质下调表达。3.KEGG分析显示:在常氧安静组和低氧安静组,有14条信号通路发生了显着性变化,在常氧运动组和低氧运动组,有11条信号通路发生了显着性变化。4.FABP4低氧安静组、常氧运动组和低氧运动组比常氧安静组蛋白表达量显着性升高,CacyBP/SIP在低氧运动时表达量显着降低,ACAA1在低氧运动组表达量显着升高,这些蛋白可能参与了肥胖大鼠低氧及低氧运动下的脂肪代谢。结果二:1.低氧运动组比常氧运动组Wnt/β-catenin信号通路下游相关分子c-myc、β-catenin的mRNA表达量显着升高(p<0.05),APC、GSK3β的mRNA表达量显着降低(p<0.05),CCND1低氧运动比常氧运动表达没有显着性变化。2.低氧运动组比常氧运动组Wnt/β-catenin信号通路相关分子c-myc、β-catenin蛋白表达量显着升高(p<0.05)。结果叁:1.比较分析低氧运动肥胖大鼠和常氧运动肥胖大鼠全基因组DNA的CpG岛发生甲基化的基因有675个具有显着差异性,213个DMR差异区域,低氧运动组比常氧运动组的甲基化高1.1%。2.Wnt信号通路相关的基因,CpG启动子甲基化明显的位点包括:Fzd2、Fzd9、Wnt16、Wnt2b、Sfrp2、Sfrp1、Sox2、Sox1等,DMR甲基化明显的差异区域包括:cdc、Fzd10、Gsk-3β、PI3k、Wnt16、Wnt6。Wnt信号通路相关的基因CpG和DMR甲基化明显。研究结论:1、通过iTRAQ蛋白质组学分析:常氧安静组和低氧安静组有70个蛋白质有显着性差异,有14条信号通路发生了显着变化;低氧运动组和常氧运动组有110个蛋白质有显着性差异,有11条信号通路发生了显着变化。2、Wnt/β-catenin信号通路在低氧运动环境下肥胖大鼠脂肪形成中被激活,Wnt/β-catenin信号通路参与了低氧运动肥胖大鼠的脂肪形成和脂肪代谢。3、比较分析低氧运动肥胖大鼠和常氧运动肥胖大鼠全基因组DNA的CpG岛发生甲基化的基因有675个具有显着差异性,213个DMR差异区域。Wnt信号通路相关的基因CpG和DMR甲基化明显。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
肝脏蛋白质组学论文参考文献
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