论文摘要
目的应用生物信息学方法分析原发性高血压(EH)患者与正常血压成人差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA),从分子水平探讨EH的发病机制,为研究EH提供新思路。方法从美国国立生物技术信息中心公共数据平台下载包含5份EH患者和5份正常血压者(对照组)的血浆样本基因芯片数据集GSE76845(为了降低个体差异,每三个人的血浆混合为一份样本),使用R语言包寻找差异基因,进行基因集合富集分析(GSEA),使用miRcode、miRDB、miRTarBase和TargetScan数据库预测靶向微小RNA(miRNA)和mRNA并构建内源竞争RNA(ceRNA)调控网络。结果与对照组比较,EH组共筛选出191个差异lncRNA(90个上调、101个下调)和1 187个差异mRNA(533个上调、654个下调),GSEA分析得到泛醌和其他萜烯类醌的生物合成,甲状旁腺激素的合成、分泌及作用,脂肪酸代谢和甾体激素生物合成等17条通路可能参与高血压的发生。构建了包含150个节点和488个交互对的ceRNA网络。结论采用生物信息学方法分析EH,为EH发生发展的分子机制和治疗靶点研究提供了研究方向和理论依据。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 李艳珍,许皓杰,胡佳敏,林诗竹,张娜,蔡宏达,曾凯,梁敏,林志坚,林财珠,吴晓丹
关键词: 长链非编码,原发性高血压,表达谱,生物信息学分析,基因集合富集分析分析
来源: 中华高血压杂志 2019年12期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技
专业: 心血管系统疾病
单位: 福建医科大学附属第一医院麻醉科,福建医科大学附属漳州市医院麻醉科,福建省立医院麻醉科福建医科大学省立临床医学院
基金: 国家自然科学基金面上项目(81570219),福建省科技创新联合资金项目(2016Y9003)
分类号: R544.11
DOI: 10.16439/j.cnki.1673-7245.2019.12.015
页码: 1150-1156
总页数: 7
文件大小: 1786K
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标签：长链非编码论文; 原发性高血压论文; 表达谱论文; 生物信息学分析论文; 基因集合富集分析分析论文;