多光谱法和分子对接模拟法研究黄腐酸与胃蛋白酶的相互作用

多光谱法和分子对接模拟法研究黄腐酸与胃蛋白酶的相互作用

论文摘要

利用荧光光谱、同步荧光光谱、三维荧光光谱、紫外-可见吸收光谱、傅里叶变换红外光谱和圆二色光谱以及分子对接模拟方法研究了黄腐酸(FA)与胃蛋白酶(PEP)之间的相互作用.荧光光谱分析表明,FA-PEP荧光猝灭的类型为静态猝灭.根据Stern-Volmer方程和静态猝灭双对数公式计算得到猝灭常数Ksv和结合位点数n.根据Vant’t Hoff方程计算得到热力学常数ΔH=-59. 86 kJ/mol,ΔS=-98. 13 J·mol-1·K-1,ΔG=-30. 62 kJ/mol(298 K).热力学分析表明,氢键和范德华力是PEP与FA之间的主要结合力,其反应为自发过程.根据F9rster非辐射能量转移理论,计算得到PEP和FA之间的结合距离为2. 436 nm,表明在FA与PEP之间发生了非辐射能量转移.三维荧光光谱分析表明,在FA存在下PEP的肽链骨架结构发生了改变.此外,紫外-可见吸收光谱、同步荧光光谱和红外光谱结果表明,FA使PEP的二级构象发生变化.分子对接模拟结果表明,FA引起PEP荧光猝灭的结合作用力不仅有氢键和范德华力,还有疏水作用力.

论文目录

  • 1 实验部分
  •   1.1 试剂与仪器
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 不同温度下FA-PEP体系的荧光光谱
  •     1.2.2 同步荧光光谱的测定
  •     1.2.3 三维荧光光谱的测定
  •     1.2.4 紫外-可见吸收光谱的测定
  •     1.2.5 结合距离的测定
  •     1.2.6 傅里叶变换红外光谱的测定
  •     1.2.7 圆二色光谱的测定
  •     1.2.8 分子对接模拟
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 FA对PEP的荧光猝灭光谱及猝灭类型
  •   2.2 FA与PEP结合常数KA和结合位点数n的计算
  •   2.3 FA与PEP相互作用的热力学参数及主要作用力判断
  •   2.4 体系的能量转移及结合距离的测定
  •   2.5 FA对PEP二级结构的影响
  •     2.5.1 FA-PEP体系同步荧光的构象变化
  •     2.5.2 FA-PEP体系的紫外光谱分析
  •     2.5.3 FA-PEP体系的三维荧光光谱分析
  •     2.5.4 FA-PEP体系的圆二色光谱分析
  •     2.5.5 FA与PEP的红外光谱
  •   2.6 FA-PEP体系的分子对接模拟
  • 3 结 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王晓霞,马力通,聂智华,王正德,崔金龙,赵文渊,赛华征

    关键词: 黄腐酸,胃蛋白酶,多光谱法,分子对接模拟法

    来源: 高等学校化学学报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 化学

    单位: 内蒙古科技大学化学与化工学院,清华大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金(批准号:21766025),内蒙古自治区科技计划项目(批准号:201702027),内蒙古自治区高等学校科学研究项目(批准号:NJZY17166)资助~~

    分类号: O657.3;O641.3

    页码: 1840-1846

    总页数: 7

    文件大小: 7465K

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