马铃薯DREB1转录因子的克隆和植物表达载体构建

马铃薯DREB1转录因子的克隆和植物表达载体构建

论文摘要

WRKY是DREB/CBF转录因子在植物非生物胁迫响应中起重要的调节作用、激活下游功能基因表达的一类反式作用因子,能增强植物的逆境适应性。本研究以10%的PEG6000胁迫下青薯9号茎段的cDNA为模板,根据马铃薯StDREB1 CDS序列设计特异引物,采用RT-PCR技术克隆了DREB1转录因子,并进行植物表达载体构建。结果表明,DREB1转录因子全长约783 bp,编码框为657 bp,编码218个氨基酸,蛋白质大小为27.6 kD,理论等电点为4.68。利用SWISS-MODEL在线工具和ProtScal对DREB蛋白二级结构和三级结构进行预测及分析,结果表明,DREB1蛋白二级可能为mixed型,平均疏水性为-0.868,是亲水性蛋白,属于非跨膜蛋白、非分泌型蛋白。以2gcc.1.A为模板进行DREB1转录因子的三级结构预测,其AP2结构域非常保守。经NCBI中氨基酸同源序列分析表明,DREB转录因子的核苷酸序列与番茄(Solanum pennellii)的氨基酸序列同源性最高达到88%。通过SacⅠ和XbaⅠ酶切,将StDREB1连接在pBI221-GFP载体上,构建了CaMV35S启动子驱动的DREB1转录因子的植物表达载体StpBI-GFP-DREB1。DREB1转录因子的克隆,为下一步从分子水平上验证其抗旱的生物学功能及提示马铃薯非生物胁迫抗逆机制提供科学依据,为提高马铃薯抗旱分子机制提供新材料。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 马铃薯总RNA的提取
  •   1.2 DREB1转录因子的扩增
  •   1.3 马铃薯DREB1表达载体的构建和酶切鉴定
  •   1.4 DREB1基因的序列分析以及系统发育树的构建
  •     1.4.1 DREB1转录因子序列分析
  •     1.4.2 DREB1转录因子同源性分析
  •   1.5 DREB1编码氨基酸的理化性质分析及结构预测
  •     1.5.1 DREB1转录因子编码的蛋白理化性质分析
  •     1.5.2 DREB1转录因子编码氨基酸的结构预测
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •   3.2 马铃薯总RNA的提取及反转录
  •   3.3 引物设计及扩增
  •   3.4 马铃薯DREB1表达载体的构建
  •   3.5 马铃薯DREB1转录因子的生物信息学分析
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王芳,李伟,王舰

    关键词: 转录因子,基因克隆,表达载体构建,序列分析

    来源: 分子植物育种 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 青海大学农林科学院,青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学青藏高原生物技术教育部重点实验室,青海大学农林科学院青海省马铃薯育种重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31660417),现代农业产业技术体系(CARS-9),青海省马铃薯研究开发中心能力建设项目(2015-GX-Q17A)共同资助

    分类号: Q943.2;S532

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.003549

    页码: 3549-3555

    总页数: 7

    文件大小: 2109K

    下载量: 194

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