导读:本文包含了遗传连锁图论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:图谱,分子,标记,基因,红麻,图板,农艺。
遗传连锁图论文文献综述
李鹏程[1]（2018）在《瑟伯氏棉×叁裂棉种间遗传连锁图的构建》一文中研究指出棉花作为用途广泛的农作物,其棉纤维可以用于纺织工业,棉籽可作为重要的油料来源,棉花的茎秆也可做工业材料和牲畜饲料,它对我国经济的发展也起着不可忽视的作用。目前棉花生产上面临的主要问题是陆地棉栽培种遗传资源狭窄,短时间内很难培育突破性新品种,从而导致了棉花产量上增产困难、品质上很难提高、抗逆性状改良效果不明显。由于陆地棉栽培种的产量占世界棉花总产量的90%以上,我们有必要通过多种有效途径,拓宽棉花遗传资源,比如从棉属野生种中发掘优良性状基因源,丰富我国棉花种质资源的遗传多样性。在本研究中,二倍体野生棉母本材料为瑟伯氏棉(Gossypium.thurberi),它主要起源于美洲,具有抗黄萎病、棉铃虫以及抗零下低温等特性;父本材料为叁裂棉(Gossypium.trilobum),起源并分布于墨西哥西部sinaloa州和中部Michoacan州等,它具有高抗黄萎病以及耐干旱的特性。本实验利用种间杂交产生的F_1代进行自交,成功获得了274株F_2单株群体,从F_2群体中随机选取了188株用作构建遗传图谱的个体。基于雷蒙德氏棉基因组开发的12560对gSSR引物,对亲本进行多态性筛选,获得994对多态性引物,多态率为7.9%。用这些多态性引物来检测(瑟伯氏棉D1-5×叁裂棉D8-7)F_2群体188个单株的基因型,最后共获得963个标记。利用Joinmap 4.0作图软件构建的遗传连锁图谱共包括849个有效标记位点,覆盖全部13条染色体。其中标记最多的是Chr09染色体,有93个;标记最少的是Chr02染色体,有21个。该遗传图谱总长1012.458 cM,相邻两个标记间的平均距离是1.193 cM,有114个标记位点没有进入任何连锁群。经卡方检测,连锁图谱上存在134个偏分离标记,偏分离比例为15.8%。在全部的13条染色体中一共有8个SDR区域。其中Chr01、Chr02、Chr06、Chr09、Chr10、Chr11各有一个SDR,分别命名为SDR1、SDR2、SDR6、SDR9、SDR10、SDR11。Chr07上有两个SDR命名为SDR7-1、SDR7-2。通过对瑟伯氏棉×叁裂棉的遗传连锁图谱与已经基因组测序的雷蒙德氏棉基因组物理图谱对比,发现遗传图与物理图存在较好的线性关系,个别染色体上存在倒位(Chr02、Chr03、Chr05、Chr07、Chr13)和易位(Chr03、Chr08、Chr09)现象,呈非共线性关系。该遗传图对应到雷蒙德氏棉物理图谱0.707 Gb基因组大小。本次遗传连锁图的构建,为进一步解析二倍体野生棉基因组结构与功能、挖掘野生棉抗逆优良基因、比较基因组学的研究以及标记辅助选择育种等研究提供了一定的工作基础。(本文来源于《河南大学》期刊2018-06-01）
张琳[2]（2018）在《香菇基于RNA-Seq构建遗传连锁图及重要性状的QTL定位》一文中研究指出香菇(Lentinula edodes)是一种具有较高食药用价值的大型真菌,其栽培起源于中国。对香菇菌株进行遗传改良是香菇产业持续发展的基础。对于受多基因控制的香菇数量性状,利用与数量性状连锁分子标记进行分子标记辅助选择,是对香菇菌株进行遗传改良的有效方法。目前,香菇遗传连锁图主要基于非特异性分子标记构建,标记还很难与基因组信息对应。本研究基于香菇LQ-15测交群体,考察了群体136个菌株的10个农艺性状,并对其中110个菌株进行转录组测序,开发SNP标记用于构建香菇高密度遗传连锁图,进行10个农艺性状的QTL定位,筛选控制农艺性状的候选基因,用于香菇品种的改良。1、进行测交群体LQ-15的栽培试验,测定包括出菇期、菇形性状、产量性状在内的10个性状的表型,并结合2012年该群体的栽培数据,对两年数据进行统计分析和BLUP校正。统计分析表明,菌盖重量、菌柄重量、单菇重、单袋菇数在两年表型数据中变异系数较大。相关性分析表明,除菌盖重量外,其余9个性状在两年间均呈极显着正相关;10个农艺性状中,菇形性状两两间呈极显着正相关,产量性状中单袋菇数与单菇重、单袋产量分别呈极显着负相关和正相关。方差分析表明,基因型、年份、基因型与年份的互作对性状表型影响均达到极显着水平。2、对作图群体LQ-15的110个菌株的成熟子实体进行转录组测序,基于12083个SNP标记,构建了1张香菇高密度遗传连锁图。图谱全长1039.37 cM(27.65Mb),包含11个连锁群和671个bins,平均图距0.11 cM,bin间平均距离为1.58 cM。12083个SNP标记位于337个scaffold上。3、利用香菇高密度遗传连锁图对2016年、2012年、BLUP校正叁组农艺性状表型数据进行QTL定位。使用复合区间作图(CIM)共检测到控制10个性状的63个QTLs,分布于8个连锁群,QTLs分布不均,多聚集于LG01、LG02、LG03、LG06。各个性状定位到的QTLs数目介于4-9之间,贡献率>15%的位点有9个。76%的QTL位点呈簇分布,共鉴定9个QTLs热点区域。控制表型相关性状QTL的成簇分布,表明这些QTL可能是一因多效或紧密连锁的位点,QTL共位性是性状表型相关的遗传基础。4、对基因表达量和表型值进行相关性分析,筛选候选基因。共鉴定到577个基因与10个性状相关,其中有153个基因同时控制多个性状。37个候选基因被2个以上QTL重复检测到。对候选基因进行功能注释,鉴定到与编码糖苷水解酶、己糖转运蛋白、跨膜蛋白、蛋白激酶等基因同源的候选基因,可能调控香菇农艺性状。(本文来源于《华中农业大学》期刊2018-06-01）
郭建斌,黄莉,成良强,陈伟刚,任小平[3]（2016）在《利用3个F_2群体整合高密度栽培种花生遗传连锁图》一文中研究指出遗传图谱的构建及整合是开展花生分子育种研究的基础,利用多个作图群体整合遗传图谱是解决图谱标记密度低的有效途径。本研究采用基于锚定SSR标记的作图策略,构建3个F_2群体3张遗传连锁图,利用Join Map 3.0软件整合图谱,获得一张包含20个连锁群、792个位点、总遗传距离为2079.50 c M,标记间平均距离为2.63 c M的整合图谱,各连锁群标记数在20~66个之间,遗传距离在59.10~175.80 c M之间。将3个分离群体中检测到的与荚果及种子大小相关的QTL区段与整合连锁图的标记比较发现,各群体中检测到的位于各染色体上的QTL在整合图谱中都能出现,有些QTL标记区间在整合图谱中存在更多的标记,为今后利用这些标记进行精细定位奠定了基础。(本文来源于《作物学报》期刊2016年02期）
周雁,卢兴潮,边银丙[4]（2015）在《毛木耳基因内分子标记开发与遗传连锁图构建》一文中研究指出毛木耳是我国广泛人工栽培的食用菌之一,但其遗传学和分子生物学基础相对薄弱。本研究以毛木耳杂交子APM2-16营养生长期(菌丝体)和生殖生长期(成熟子实体)的转录组为基础,开发了一系列基因内分子标记,包括SSR、InDel、CAPs、SCAR等,并利用这些分子标记开展了遗传连锁图的构建。毛木耳遗传连锁图的构建以APM2-16的123个担孢子单核体后代为作图群体,选用337对SSR引物、373对InDel引物以及23对其他类型的引物作为分子标记进行亲本单核体间的多态性分析和群体基因型分型,经遗传连锁作图分析获得一张包含160个基因内标记的毛木耳遗传连锁图。该遗传连锁图由14个连锁群组成,图谱总长595.7 cM,标记间的平均遗传距离为4.1 cM,交配型A位点和B位点分别位于第9连锁群和第1连锁群,并通过基因的遗传定位发现毛木耳的8个漆酶基因分散分布于5个不同的连锁群上。本遗传连锁图全部由基因内分子标记组成,为进一步开展毛木耳数量性状的QTL定位、功能基因的图位克隆、基因组组装、比较基因组研究和分子标记辅助选择育种等研究奠定了一定的遗传学基础。(本文来源于《中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集》期刊2015-09-20）
肖炳光[5]（2013）在《烟草基因组计划进展篇:3.烟草分子标记遗传连锁图构建和重要抗病基因定位》一文中研究指出分子标记遗传连锁图是基因定位、图位克隆、分子标记辅助选择育种的基础[1]。普通烟草基因组较大,分子标记多态性水平较低[2],为遗传连锁图构建、基因定位等相关研究造成较大困难。近年来,Bindler等[3-4]利用美国烟草基因组测序项目的序列数据,开发了大量SSR标记,构建了高密度烟草遗传连锁图。由于他们使用的作图群体为烤烟和晒烟品种间杂交F2群体,遗传差异相对较远,可供烤烟利用的标记数有限。在中国烟草总公司、中国烟草总公司云南省公司多个项目的资助下,云南省烟草农业科学研究院联合行业内外相关单位,开展了烟草分子标记开发、遗传连锁图构建和抗病基因定位等研究工作,取得了重要进展。(本文来源于《中国烟草科学》期刊2013年03期）
殷豪,吴俊,张绍铃[6]（2012）在《梨分子遗传连锁图构建及重要农艺性状定位》一文中研究指出梨分子遗传连锁图谱的构建始于21世纪初,构建高密度的分子遗传图谱将有助于提高梨的分子育种水平。我们就目前国内外梨分子遗传连锁图谱的构建及其在抗病虫、果实性状及树形性状的基因定位和QTL定位,包括其在梨和苹果比较作图研究中的应用等方面进行简要阐述,指出了梨分子遗传图谱构建中存在的图谱密度较低和作图群体偏小等问题。梨育种工作者在今后的梨分子遗传图谱构建工作中,应注意适当扩大作图群体,充分利用蔷薇科基因组数据开发共显性标记,提高图谱标记密度,从而为标记辅助育种和重要农艺性状基因的图位克隆奠定基础。(本文来源于《果树学报》期刊2012年05期）
[7]（2012）在《烤烟SSR标记遗传连锁图构建成功》一文中研究指出烟草分子标记遗传连锁图构建和重要性状基因定位克隆是中国烟草基因组计划重大专项的重要组成部分。开发高效、可靠的分子标记,构建高密度烟草分子标记遗传图,是抗性、品质等重要性状基因定位和分子标记辅(本文来源于《中国烟草学报》期刊2012年02期）
陈迪文,柴利广,蔡长春,林国平,王毅[8]（2009）在《白肋烟遗传连锁图的构建及黑胫病抗性QTL初步分析》一文中研究指出利用白肋烟抗黑胫病品种B37(Burley37)和感黑胫病品种B67(Burley67)杂交的F1代以花药培养技术培养获得的双单倍体(Double Haploid,DH)遗传群体87个株系为作图群体,利用AFLP和SRAP分子标记技术,在群体中共获得135个多态性标记.以此为基础,利用Mapmaker/EXP作图软件,构建了一个含23个连锁群、99个标记的白肋烟遗传连锁图,该图谱总长为915.7cM,标记间的平均距离为9.2cM.同时利用两年田间试验调查分析了该群体各株系的黑胫病发病率和病情指数,利用WinQTLcart2.5软件扫描遗传连锁图,在4个连锁群上共检测到7个黑胫病抗性相关QTLs(Qualitative TraitLoci),分别命名为TBS1—TBS7,单个QTL解释表型变异11.2%—20.0%.其中在C2和C5两个连锁群上出现了重复性稳定的QTL.研究结果为精细定位抗病QTL以及通过分子标记辅助选择等方法选育黑胫病抗性强的烟草品种奠定了基础.(本文来源于《自然科学进展》期刊2009年08期）
陈美霞,张广庆,祁建民,张晓琛,林荔辉[9]（2008）在《红麻SRAP、ISSR遗传连锁图构建的初步研究》一文中研究指出应用SRAPI、SSR标记构建红麻分子遗传连锁图,以半野生种Ga42(源自加纳)和栽培种阿联红麻(源自埃及)杂交产生的203株F2代分离群体作为作图群体。筛选出多态性好的27对SRAP引物组合和5个ISSR引物,对F2作图群体进行PCR扩增,共产生108个多态性条带,平均每个引物组合产生3.4个多态性条带,最多的可产生8条多态性条带。应用MAPMAKER/EXP3.0软件对108个多态性条带进行遗传连锁分析,被分为16个连锁群(L0D≥3.0),初步构建了首张红麻遗传连锁图谱,该图谱总长为1336.6 cM,平均两个标记位点间距为17.82cM。本文还讨论了图谱构建存在的偏分离有关问题与对策,可为进一步构建较高密度、分布均匀的遗传图谱及基因定位奠定了良好的基础。(本文来源于《中国麻业科学》期刊2008年03期）
郭恩才,王广鹏,孔德军,刘庆香,张新忠[10]（2008）在《“薄皮”ד垂枝”板栗RAPD遗传连锁图构建》一文中研究指出使用20组共400条RAPD随机引物,在"薄皮"和"垂枝"两个板栗亲本无性系及其5个杂交后代进行筛选,共有187条引物获得了清晰、重复性好的多态性条带,占供试引物的46.75%。应用筛选出的多态性引物在两亲本及其60个杂交后代中进行扩增,获得的多态性条带在后代中的分离比用卡方测验(α=0.05)分析,结果共有143个标记符合1:1测交分离比,其中来源于母本"薄皮"板栗的有88个,来源于父本"垂枝"的有55个。采用作图软件Mapmaker和回交群体模型分别对符合测交分离比的标记进行亲本特异的标记分群和连锁分析,设定LOD值为3和最大重组值θ为0.50作为可信统计度与最大连锁标记数量之间的最佳组合,其中母本的标记定位了10个连锁组,父本的标记定位了7个连锁组。母本"薄皮"板栗遗传连锁图共包含88个标记,覆盖了板栗基因组总长约823.1cM(Kosambi,以下同),占基因组的66.7%;父本"垂枝"板栗遗传连锁图共包含55个标记,覆盖了板栗基因组总长约720.8cM,占基因组的41.7%。母本"薄皮"板栗遗传连锁图上标记间的遗传距离为1.6~26.5cM,平均9.4cM,连锁组的大小从15.5cM到166.3cM,平均为82.3cM;父本"垂枝"板栗遗传连锁图上标记间的遗传距离为2.1~39.9cM,平均13.1cM,连锁组的大小从53.5cM到139.6cM,平均为103.0cM。(本文来源于《分子植物育种》期刊2008年02期）
遗传连锁图论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
香菇(Lentinula edodes)是一种具有较高食药用价值的大型真菌,其栽培起源于中国。对香菇菌株进行遗传改良是香菇产业持续发展的基础。对于受多基因控制的香菇数量性状,利用与数量性状连锁分子标记进行分子标记辅助选择,是对香菇菌株进行遗传改良的有效方法。目前,香菇遗传连锁图主要基于非特异性分子标记构建,标记还很难与基因组信息对应。本研究基于香菇LQ-15测交群体,考察了群体136个菌株的10个农艺性状,并对其中110个菌株进行转录组测序,开发SNP标记用于构建香菇高密度遗传连锁图,进行10个农艺性状的QTL定位,筛选控制农艺性状的候选基因,用于香菇品种的改良。1、进行测交群体LQ-15的栽培试验,测定包括出菇期、菇形性状、产量性状在内的10个性状的表型,并结合2012年该群体的栽培数据,对两年数据进行统计分析和BLUP校正。统计分析表明,菌盖重量、菌柄重量、单菇重、单袋菇数在两年表型数据中变异系数较大。相关性分析表明,除菌盖重量外,其余9个性状在两年间均呈极显着正相关;10个农艺性状中,菇形性状两两间呈极显着正相关,产量性状中单袋菇数与单菇重、单袋产量分别呈极显着负相关和正相关。方差分析表明,基因型、年份、基因型与年份的互作对性状表型影响均达到极显着水平。2、对作图群体LQ-15的110个菌株的成熟子实体进行转录组测序,基于12083个SNP标记,构建了1张香菇高密度遗传连锁图。图谱全长1039.37 cM(27.65Mb),包含11个连锁群和671个bins,平均图距0.11 cM,bin间平均距离为1.58 cM。12083个SNP标记位于337个scaffold上。3、利用香菇高密度遗传连锁图对2016年、2012年、BLUP校正叁组农艺性状表型数据进行QTL定位。使用复合区间作图(CIM)共检测到控制10个性状的63个QTLs,分布于8个连锁群,QTLs分布不均,多聚集于LG01、LG02、LG03、LG06。各个性状定位到的QTLs数目介于4-9之间,贡献率>15%的位点有9个。76%的QTL位点呈簇分布,共鉴定9个QTLs热点区域。控制表型相关性状QTL的成簇分布,表明这些QTL可能是一因多效或紧密连锁的位点,QTL共位性是性状表型相关的遗传基础。4、对基因表达量和表型值进行相关性分析,筛选候选基因。共鉴定到577个基因与10个性状相关,其中有153个基因同时控制多个性状。37个候选基因被2个以上QTL重复检测到。对候选基因进行功能注释,鉴定到与编码糖苷水解酶、己糖转运蛋白、跨膜蛋白、蛋白激酶等基因同源的候选基因,可能调控香菇农艺性状。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
遗传连锁图论文参考文献
[1].李鹏程.瑟伯氏棉×叁裂棉种间遗传连锁图的构建[D].河南大学.2018
[2].张琳.香菇基于RNA-Seq构建遗传连锁图及重要性状的QTL定位[D].华中农业大学.2018
[3].郭建斌,黄莉,成良强,陈伟刚,任小平.利用3个F_2群体整合高密度栽培种花生遗传连锁图[J].作物学报.2016
[4].周雁,卢兴潮,边银丙.毛木耳基因内分子标记开发与遗传连锁图构建[C].中国菌物学会2015年学术年会论文摘要集.2015
[5].肖炳光.烟草基因组计划进展篇:3.烟草分子标记遗传连锁图构建和重要抗病基因定位[J].中国烟草科学.2013
[6].殷豪,吴俊,张绍铃.梨分子遗传连锁图构建及重要农艺性状定位[J].果树学报.2012
[7]..烤烟SSR标记遗传连锁图构建成功[J].中国烟草学报.2012
[8].陈迪文,柴利广,蔡长春,林国平,王毅.白肋烟遗传连锁图的构建及黑胫病抗性QTL初步分析[J].自然科学进展.2009
[9].陈美霞,张广庆,祁建民,张晓琛,林荔辉.红麻SRAP、ISSR遗传连锁图构建的初步研究[J].中国麻业科学.2008
[10].郭恩才,王广鹏,孔德军,刘庆香,张新忠.“薄皮”ד垂枝”板栗RAPD遗传连锁图构建[J].分子植物育种.2008
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