一个解释灭螺药物处理后湖北钉螺多组学研究的不一致结果的数学模型

一个解释灭螺药物处理后湖北钉螺多组学研究的不一致结果的数学模型

论文摘要

目的:湖北钉螺是日本血吸虫唯一的中间宿主,在日本血吸虫病的传播过程中是必不可少的。灭螺工作一直是日本血吸虫病控制的重要手段,故灭螺药物的作用机制和灭螺新药的开发一直是研究者关注的重点。方法:在先前的研究中,为了探索氯硝柳胺对湖北钉螺的作用机制,我们对药物作用后的湖北钉螺进行了转录组、酶学、形态学和代谢组的检测。在这些检测中,药物作用后的酶活性相对于对照组的变化与对应的unigenes、对应的代谢物的相对对照组的变化存在大量的不一致现象。为了解释这些不一致现象存在的合理性,我们构建了一个数学模型假说。结果:这个数学模型建立在两个前提条件下:1.酶合成的速度仅仅取决于它的RNA模板unigenes的量,代谢物生成的速度仅仅取决于其催化剂酶的量;2.在无外界条件干扰下,unigenes的量、酶的量以及代谢物的量是不变的。一些外界的干扰条件被引入,使unigenes的量发生改变,利用前提条件1中三者的关系,对酶和代谢物的量的变化进行运算。三者的变化趋势一致的条件在计算中被得出,即条件3:unigenes量的变化趋势必须的单调的。一旦unigenes量出现波动性变化,会给酶的量带来滞后的影响,从而形成某些时段的不一致,这很好地解释了我们先前研究中细胞色素c氧化酶活性及其相关的unigene的量变化趋势不一致的现象。结论:这个模型在假定条件1和条件2成立的基础上,合理地解释了多个组学研究中结果不一致的部分原因。而在真实的生物体中,会有更多的因素影响酶的合成、代谢物的合成。故此模型还需要进一步的改进,对这些因素进行考虑,以期对多组学研究的数据挖掘提供帮助。

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文章来源

类型: 国内会议

作者: 熊涛,江妮,徐莎,张燕,徐兴建,董惠芬,赵琴平,卢芳国

关键词: 数学模型,转录组,酶学,代谢组,不一致性

来源: 第15届中国中西医结合学会基础理论专业委员会学术年会暨第二届广东省中西医结合学会转化医学专业委员会年会 2019-10-25

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 数学,预防医学与卫生学

单位:

分类号: O141.4;R184.38

DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.006655

页码: 44-45

总页数: 2

文件大小: 414k

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