全长转录组测序在植物中的应用研究进展

全长转录组测序在植物中的应用研究进展

论文摘要

全长转录组测序(Iso-Seq)是指使用第三代测序(TGS)技术获得mRNA的全长序列。随着以单分子实时(SMRT)测序为代表的TGS技术逐渐发展成熟,以及该技术在基因组和转录组de novo测序等方面的优势,全长转录组测序技术已经广泛被应用于动物、植物、微生物测序研究中,并挖掘出大量相关数据。本文综述了基于Iso-Seq技术的原理及其在模式植物和非模式植物研究中的应用,期望为研究植物全长转录组相关分析提供参考。

论文目录

  • 1 全长转录组测序的原理
  • 2 全长转录组测序在植物中的应用
  •   2.1 全长转录组测序在模式植物中的应用
  •     2.1.1 拟南芥
  •     2.1.2 丹参
  •     2.1.3 野草莓
  •     2.1.4 玉米
  •     2.1.5 高粱
  •     2.1.6 矮牵牛
  •   2.2 全长转录组测序在非模式植物中的应用
  •     2.2.1 大豆
  •     2.2.2 小麦
  •     2.2.3 白菜
  •     2.2.4 棉花
  •     2.2.5 甘蔗
  •     2.2.6 甜菜
  •     2.2.7 毛竹
  •     2.2.8 黄芪
  •     2.2.9 茶树
  •     2.2.10咖啡豆
  •     2.2.1 1 松树
  •     2.2.1 2 无油樟
  •     2.2.1 3 苜蓿
  •     2.2.1 4 盐生草
  •     2.2.1 5 猪笼草
  • 3 问题与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赵陆滟,曹绍玉,龙云树,张应华,许俊强

    关键词: 全长转录组测序,单分子实时测序,模式植物和非模式植物

    来源: 植物遗传资源学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 云南农业大学云南省滇台特色农业产业化工程研究中心

    基金: 国家自然科学基金(31560560),云南省应用基础研究基金(2015FD019)~~

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20190326001

    页码: 1390-1398

    总页数: 9

    文件大小: 1385K

    下载量: 957

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