利用PCR-DGGE技术分析内蒙古西部地区土壤细菌的多样性

利用PCR-DGGE技术分析内蒙古西部地区土壤细菌的多样性

论文摘要

为明确内蒙古西部地区土壤细菌的多样性,利用聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳PCR-DGGE(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis)技术对170份土壤样品中的细菌丰度和群落结构组成进行了分析,并研究了土壤细菌多样性与肥力参数的关系。结果表明:内蒙古西部地区土壤细菌的多样性是比较丰富的,丰富度指数处于4到60之间,香浓指数处于1.38到4.09之间。不同土壤类型,其细菌的多样性有明显差异。其中,新积土、棕钙土、栗钙土和灰钙土中的细菌多样性指数均高于其他类型土壤,而灰漠土的多样性指数最低。且土壤的不同利用方式也会对土壤细菌多样性有所影响,其中耕地土壤细菌多样性指数最高,而未利用土壤的多样性指数最低。细菌多样性与土壤肥力参数的相关性分析结果显示二者之间并无显著的相关性。内蒙古西部地区土壤中的优势种群包括Proteobacteria(变形菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门)、Firmicutes(厚壁菌门)、Actinobacteria(放线菌门)、Acidobacteria(酸杆菌门)、Gemmatimonadetes(芽单胞菌门)、Nitrospira(硝化螺旋菌门)。可为该地区的土壤生态系统治理与恢复及未来该地区特有微生物资源的开发利用、农业生产指导等提供一定的科学依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 土壤样品
  •     1.1.2 PCR引物
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 土壤肥力参数的测定
  •     1.2.2 土壤总DNA提取
  •     1.2.3 PCR反应条件
  •     1.2.4 DGGE方法
  •     1.2.5 DGGE切胶回收
  •     1.2.6 序列分析
  •     1.2.7 数据处理与分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 土壤肥力参数的测定
  •   2.2 细菌多样性的分析
  •     2.2.1 土壤总DNA提取
  •     2.2.2 16S rRNA 片段的PCR扩增
  •     2.2.3 PCR产物的DGGE分析
  •     2.2.4 多样性指数分析
  •     2.2.5 系统发育树的构建
  •   2.3 细菌多样性与土壤理化性质的关系
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 武志华,夏冬双,王雪寒,马强,唐凯,刘惠荣

    关键词: 变性梯度凝胶电泳,土壤细菌,多样性,内蒙古西部地区,群落结构

    来源: 生态学报 2019年07期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学

    单位: 内蒙古农业大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31370058)

    分类号: S154.3

    页码: 2545-2557

    总页数: 13

    文件大小: 4078K

    下载量: 443

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