射干内生真菌Fusarium proliferatum的ISSR和SRAP位点遗传多样性分析

射干内生真菌Fusarium proliferatum的ISSR和SRAP位点遗传多样性分析

论文摘要

目的为了解射干内生真菌Fusarium proliferatum的遗传多样性。方法选用了52条ISSR引物和90条SRAP引物对17株射干内生真菌F. proliferatum进行了遗传多样性分析。筛选出了27条ISSR引物和38条SRAP引物可用于遗传多样性分析。结果结果,27条ISSR引物共扩增出了178个条带,其中131条(63%)具有多态性;38条SRAP引物能够扩增出357条稳定性较好的条带,其中323条(91%)具有稳定性差异。27条ISSR引物PCR扩增产物的多态性信息量(PIC)介于0.19~0.91,平均为0.70;38条SRAP引物PCR扩增产物的多态性信息量PIC介于0~0.93,平均为0.73。聚类分析结果表明,根据27个ISSR、38个SRAP及ISSR+SRAP遗传位点分析得出遗传相似系数变化范围分别为0.73~0.99、0.72~0.95和0.73~0.95,平均分别为0.84、0.85和0.85。根据材料间的遗传相似系数聚类,三者之间的聚类有较小的差异,但总体上,17株内生真菌被聚为3大类,分离自根的内生真菌F. proliferatum聚为一类,分离自茎和叶的F. proliferatum聚集于另外两类。研究表明,内生真菌F. proliferatum遗传相似性较大,其亲缘关系较近,与传统方法鉴定出的结果一致。结论采用分子标记技术比传统的方法鉴定更为有效,同时,ISSR和SRAP标记可更真实地反映射干内生真菌F. proliferatum的遗传多样性,为该内生真菌在分子生物技术方面的研究等提供一定参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 DNA提取
  •   1.3 PCR扩增与琼脂糖凝胶电泳
  •   1.4 数据分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 ISSR位点多态性分析
  •   2.2 SRAP位点多态性分析
  •   2.3 遗传差异分析
  •     2.3.1 ISSR多态性遗传差异分析
  •     2.3.2 SRAP多态性遗传差异分析
  •     2.3.3 ISSR+SRAP多态性遗传差异分析
  •   2.4 聚类分析
  •     2.4.1 ISSR位点聚类分析
  •     2.4.2 SRAP位点聚类分析
  •     2.4.3 ISSR+SRAP位点聚类分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 罗琴,赵欢,彭正松,李佩华,杨玉霞,夏燕莉,邓迪

    关键词: 射干,内生真菌,遗传多样性

    来源: 中草药 2019年23期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

    专业: 生物学,农作物

    单位: 西华师范大学生命科学学院,西昌学院,四川省中医药科学院

    基金: 四川省教育厅重大培育项目(15CZ0015),西华师范大学博士启动基金(15E025),西华师范大学英才科研基金项目(17YC364),四川省大学生创新创业项目(201810638100)

    分类号: S567.239;Q933

    页码: 5847-5857

    总页数: 11

    文件大小: 745K

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