基于转录组和蛋白互作网络分析光信号在花药发育过程中的功能和可能机制

基于转录组和蛋白互作网络分析光信号在花药发育过程中的功能和可能机制

论文摘要

花药是被子植物重要的雄性生殖器官,其正常发育对植物的有性生殖和作物产量至关重要。花药的发育受到外在环境因子和内在信号的共同调控。光是植物生长和发育的重要环境因子之一,影响着植物生长的各个方面,然而对于光是否参与以及如何参与花药发育的调控过程,却鲜有报道。本文研究发现:光相关基因有752个(96.66%)在野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana) 4~7期花药中表达,其中246个高表达, 33个极高表达;655个在6~7期绒毡层、633个在8~10期绒毡层高表达,推测这些基因可能在花药发育中发挥功能。进一步分析光相关基因在花药发育重要转录因子突变体dyt1-3、bhlh010 bhlh089 bhlh091、ams中的表达变化,挖掘到一批受这些转录因子调控的光信号基因,暗示这些光相关基因作为DYT1-bHLHs-AMS转录网络的下游元件发挥功能;通过酵母双杂交实验筛选到与bHLH010、bHLH089、bHLH091、DYT1有相互作用的光系统以及光信号转导途径相关的蛋白,绘制了这些蛋白的相互作用网络。本文的研究为深入揭示光信号基因在花药发育中发挥的作用和调控网络提供新的认识和参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 转录组数据
  •   1.2 拟南芥光系统、光信号转导相关GO类别与基因的筛选
  •   1.3 转录组数据分析
  •   1.4 蛋白网络绘制工具
  •   1.5 酵母核系统筛库
  • 2 实验结果
  •   2.1 光合及光信号转导相关基因在花药中的表达情况
  •   2.2 光合及光信号转导相关基因在花药绒毡层的表达情况
  •   2.3 光相关基因在DYT1相关绒毡层转录调控网络突变体中表达发生变化
  •   2.4 多种光相关蛋白与bHLH010、bHLH089、bHLH091、DYT1蛋白有相互作用
  •   2.5 光相关蛋白与bHLH010、bHLH089、bHL-H091、DYT1构建成蛋白互作网络
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 阮林伟,付营,王梦涵,李梦雨,马红,常芳

    关键词: 花药发育,光信号,转录组,蛋白互作网络

    来源: 植物生理学报 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 复旦大学生命科学学院,植物科学研究所

    基金: 国家自然科学基金(31470282)~~

    分类号: Q943.2;Q945

    DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2018.0443

    页码: 159-168

    总页数: 10

    文件大小: 1623K

    下载量: 308

    相关论文文献

    • [1].植物激素调控水稻花药发育的研究进展[J]. 江西农业学报 2020(10)
    • [2].组学在花药发育研究中的应用进展Ⅰ:转录组学[J]. 生物技术进展 2019(05)
    • [3].玉米花药发育的细胞生物学与分子遗传学的研究方法[J]. 中国生物工程杂志 2018(01)
    • [4].蒙农4号新麦草幼穗穗长与花药发育的阶段性特征分析[J]. 中国草地学报 2015(06)
    • [5].上海交大揭示水稻花药发育新机制[J]. 新农村 2014(07)
    • [6].2013年35卷第7期《遗传》封面说明[J]. 遗传 2013(07)
    • [7].温敏雄性不育水稻培矮64S花药发育过程中钙的变化(英文)[J]. 热带亚热带植物学报 2009(03)
    • [8].植物MYB转录因子在花药发育中的调控作用[J]. 生物工程学报 2020(11)
    • [9].光信号途径组分HEMERA调控拟南芥的花药发育[J]. 复旦学报(自然科学版) 2020(01)
    • [10].番茄花药发育中多糖和脂滴的分布特征[J]. 园艺学报 2015(04)
    • [11].不同苏打盐碱胁迫对水稻品种“东稻4”与“吉粳88”花药发育的影响[J]. 吉林农业大学学报 2014(06)
    • [12].玉米雄性不育K932MS不育株和可育株生理生化特性的比较研究[J]. 玉米科学 2018(03)
    • [13].红砂的花药发育和花粉粒的形成[J]. 电子显微学报 2013(03)
    • [14].十字花科植物花旗竿花药发育的细胞形态学观察[J]. 延边大学农学学报 2012(01)
    • [15].水稻花药发育相关基因研究进展[J]. 现代农业科技 2010(04)
    • [16].花椰菜花药发育的细胞学研究[J]. 农业科技通讯 2013(08)
    • [17].上海交大在水稻花药发育分子机制研究上获得新进展[J]. 广东农业科学 2011(04)
    • [18].玉米C型细胞质雄性不育花药不同发育时期的转录组分析[J]. 中国农业科学 2019(08)
    • [19].组学在花药发育研究中的应用进展Ⅱ:蛋白质组学和代谢组学[J]. 生物技术进展 2019(05)
    • [20].新型叶用芥菜细胞质雄性不育系0912A的花药发育特征[J]. 华中农业大学学报 2012(01)
    • [21].苎麻雄性不育系与保持系花药发育的比较观察[J]. 云南大学学报(自然科学版) 2011(06)
    • [22].毛竹的花药发育研究[J]. 广西植物 2016(02)
    • [23].含笑花药发育的超微结构研究[J]. 西北植物学报 2015(02)
    • [24].高温胁迫对花药发育的影响及信号传导网络[J]. 生物学杂志 2019(01)
    • [25].甘蓝型油菜核质不育与双隐性核不育花药发育的细胞学研究[J]. 甘肃农业大学学报 2016(02)
    • [26].水稻雄性不育突变体花药发育的细胞形态学研究[J]. 科学咨询(科技·管理) 2011(08)
    • [27].枸杞脂肪酰基还原酶基因的克隆及表达分析[J]. 植物遗传资源学报 2018(02)
    • [28].天冬氨酸蛋白酶在拟南芥和水稻中的分子进化、表达模式以及在花药发育中的功能分析[J]. 植物生理学报 2015(03)
    • [29].菠萝蜜花药发育及花粉萌发研究[J]. 植物研究 2011(02)
    • [30].洋葱花药发育中钙离子分布特征[J]. 植物生理学通讯 2010(08)

    标签:;  ;  ;  ;  

    基于转录组和蛋白互作网络分析光信号在花药发育过程中的功能和可能机制
    下载Doc文档

    猜你喜欢