IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的结构基因组学分析

IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的结构基因组学分析

论文摘要

【背景】IncFII-FIA-FIB型质粒广泛存在于肠杆菌科细菌中,介导了许多耐药基因的水平转移,并导致细菌多重耐药问题日益严重。【目的】分析IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的基因组结构,并研究其介导大肠杆菌BTR株的耐药基因水平转移机制。【方法】利用PCR进行耐药基因筛查;接合转移和电转化实验验证质粒pBTR-CTXM是否具备自主接合转移的特性;VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析仪测定相关菌株对抗生素的药物敏感性;构建MatePair文库并进行细菌全基因组高通量测序和质粒结构基因组学分析。【结果】菌株BTR是携带blaNDM-1、blaCTX-M-15、blaTEM、qnrD、qnrS1、mph(A)、erm(B)和tetA(B)等耐药基因的多重耐药大肠杆菌,其中blaCTX-M-15、mph(A)、erm(B)和tet A(B)等耐药基因均位于大小为144 939 bp的质粒p BTR-CTXM (GenBank登录号MF156697)上,该质粒可与菌株BTR内质粒pNDM-BTR接合共转移到受体菌大肠杆菌EC600中。pBTR-CTXM具备IncFII-FIA-FIB型质粒典型的骨架区结构,其多重耐药(Multidrug-resistant,MDR)区由新的复合型转座子Tn6492、Tn2残余、Tn10残余、ISEcp1-blaCTX-M-15-Δorf477转座单元和一些插入序列组成。【结论】pBTR-CTXM中新复合型转座子Tn6492与Tn10残余和ISEcp1-blaCTX-M-15-Δorf477转座单元共同介导大肠杆菌BTR株的多重耐药与耐药基因的水平传播。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 菌株来源
  •     1.1.2 主要试剂和仪器
  •   1.2 耐药基因筛查
  •   1.3 接合转移实验
  •   1.4 电转化实验
  •   1.5 药敏实验
  •   1.6 全基因组测序及生物信息学分析
  •   1.7 序列登录号
  • 2 结果与分析
  •   2.1 菌株耐药基因筛查
  •   2.2 接合转移和电转化实验
  •   2.3 药敏实验结果
  •   2.4 全基因组测序及生物信息学分析
  •     2.4.1 质粒基本特征
  •     2.4.2 质粒骨架区分析
  •     2.4.3 质粒MDR区分析
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李曼莉,王利君,赵亚超,蒋昭芳,周冬生,童贻刚,赵宝华

    关键词: 大肠杆菌,型质粒,多重耐药

    来源: 微生物学通报 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 河北师范大学生命科学学院,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室,清华大学附属北京清华长庚医院清华大学临床医学院

    基金: 河北省科技计划项目(17226701D)~~

    分类号: Q78

    DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180431

    页码: 139-150

    总页数: 12

    文件大小: 1807K

    下载量: 181

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