AtZFP5、AtZFP6、AtGIS3和OsRHL41-like等基因调控根毛生长和发育的分子机制研究

AtZFP5、AtZFP6、AtGIS3和OsRHL41-like等基因调控根毛生长和发育的分子机制研究

论文摘要

根是植物重要的营养器官,根毛是根表皮特化的细胞,是植物根系的重要组成部分,能够增加根系与土壤之间的接触面积,从而促进植物更高效地吸收水分和养分。因此,研究植物根毛细胞的分化和发育机制,具有重要的学术意义和经济应用价值。本研究主要以拟南芥为材料,探究了 C2H2锌指蛋白ZFP5、ZFP6和GIS3在根表皮细胞发育中的作用;同时以水稻为材料,对OsRHL41-like,OsRHD1-like,OsRHD2-like1和OsRHD2-like2基因在根毛发育中的功能进行研究。所取得的主要结果如下:1、为了研究ZFP5响应营养信号调控根毛发育进行研究,发现低磷、低钾能够诱导ZFP5基因的表达,但是不能恢复zfp5突变体和干扰株系的短根毛表型。分子生物学实验表明乙烯参与低磷、低钾诱导根毛伸长,且ZFP5通过调控EIN2基因的表达来响应低磷、低钾诱导根毛发育。2、为了研究GIS3调控根毛发育的分子机制进行研究,发现与野生型相比,gis3突变体和GIS3RNAi干扰株系根毛数量显著减少,根毛长度显著变短,表明GIS3是调控根毛发育的正向调控因子。外源ACC和BA处理诱导野生型中GIS3表达,但是不能恢复gis3突变体短根毛表型。分子生物学和遗传学研究表明,GIS3通过直接作用于RHD2和RHD4上游来调控根毛伸长。综上所述,GIS3通过整合乙烯和细胞分裂素信号直接调控RHD2和RHD4基因的表达来调控根毛的形成和发育。3、为了研究ZFP6基因在根毛发育中的作用,对zfp6突变体和干扰株系根毛表型进行分析,发现ZFP6对根毛发育具有正向调控作用。外源施加ACC和BA能够显著诱导野生型中ZFP6基因的表达,但不能恢复zfp6突变体根毛长度,表明ZFP6响应乙烯和细胞分裂素信号调控根毛伸长。通过RNA-Seq分析筛选出13个激素相关基因,酵母双杂交分析表明ZFP6可能与AT4G36110、MYB51、ERF6和ATMYBL2存在相互作用。4、为了研究植物激素生长素、乙烯和细胞分裂素之间的关系,发现只有乙烯能诱导野生型产生异位根毛,这意味着乙烯在根毛起始阶段的特殊作用。然而,在伸长阶段,生长素、乙烯和细胞分裂素均能促进根毛尖端生长,而细胞分裂素的作用在这个过程中独立于生长素和乙烯。当生长素和乙烯信号有缺陷时,外源BA处理能够恢复根毛伸长。更为重要的是,转录分析表明生长素、乙烯和细胞分裂素通过RSL4调控一系列根毛特异性基因来调控根毛发育。5、为了研究水稻OsRHL41-like等基因的功能,我们克隆了OsRHL41-like、OsRHD1-like、OsRHD2-like1和OsRHD2-like2这四个水稻基因,并将其转入拟南芥和水稻中。发现过量表达水稻OsRHL41-like显著增加拟南芥和水稻根毛长度,而OsRHL41-like干扰株系根毛长度显著低于野生型。结果表明,OsRHL41-like正向调控水稻根毛伸长。OsRHD2-like1和OsRHD2-like2转基因株系根毛表型与OsRHL41-lik相似,表明OsRHD2-like1和OsRHD2-like2是调控水稻根毛伸长的正向调控因子。而OsRHD1-like转基因株系根毛表型与OsRHL41-like相反,表明OsRHD1-like是调控水稻根毛发育的负向调控因子。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • Abstract
  • 1 绪论
  •   1.1 拟南芥根毛发育
  •     1.1.1 根毛发育的模式
  •     1.1.2 根毛细胞命运决定
  •     1.1.3 根毛的起始
  •     1.1.4 根毛的伸长
  •   1.2 植物激素对根毛发育的影响
  •   1.3 营养元素对根毛发育的影响
  •   1.4 C2H2锌指蛋白参与表皮毛和根毛的形成和发育
  •   1.5 禾本科作物根毛发育研究进展
  •     1.5.1 根表皮细胞发育模式
  •     1.5.2 根毛的起始
  •     1.5.3 根毛的伸长
  •   1.6 本研究的目的和意义
  • 2 锌指蛋白基因ZFP5调控拟南芥根毛形成的分子机制
  •   2.1 材料与方法
  •     2.1.1 植物材料和生长条件
  •     2.1.2 突变体鉴定
  •     2.1.3 DNA提取
  •     2.1.4 根毛长度、数量统计
  •     2.1.5 RNA提取、反转录和荧光定量PCR
  •     2.1.6 营养处理实验
  •     2.1.7 GUS染色
  •     2.1.8 激素处理
  •     2.1.9 统计分析方法
  •   2.2 结果与分析
  •     2.2.1 低磷、低钾胁迫诱导ZFP5的表达
  •     2.2.2 ZFP5响应低磷、低钾胁迫调控根毛伸长
  •     2.2.3 乙烯参与低磷、低钾胁迫调控根毛伸长
  •     2.2.4 ZFP5和乙烯相互作用来调控低磷、低钾诱导根毛发育
  •     2.2.5 ZFP5调控根毛相关基因的表达来响应低磷、低钾胁迫
  •   2.3 讨论
  • 3 锌指蛋白基因GIS3调控拟南芥根毛形成的分子机制
  •   3.1 材料与方法
  •     3.1.1 植物材料和生长条件
  •     3.1.2 突变体鉴定
  •     3.1.3 根毛长度、数量统计
  •     3.1.4 RNA提取、反转录和荧光定量PCR
  •     3.1.5 过量表达载体构建
  •     3.1.6 拟南芥转基因
  •     3.1.7 双突变体构建
  •     3.1.8 激素处理实验
  •     3.1.9 GUS染色
  •     3.1.10 地塞米松(Dexamethasone,DEX)和放线菌酮(Cycloheximide,CHX)
  •     3.1.11 染色体免疫共沉淀(ChIP)
  •   3.2 结果与分析
  •     3.2.1 GIS3是调控根毛发育的重要调控因子
  •     3.2.2 GIS3响应乙烯信号调控根毛发育
  •     3.2.3 GIS3响应细胞分裂素信号调控根毛发育
  •     3.2.4 GIS3作用于根毛调控因子上游来调控根毛发育
  •     3.2.5 GIS3作用于RHD2和RHD4上游
  •     3.2.6 GIS3直接作用于RHD2和RHD4启动子区域来调控根毛伸长
  •     3.2.7 RHD2和RHD4受乙烯和细胞分裂素诱导调控根毛发育
  •   3.3 讨论
  • 4 锌指蛋白基因ZFP6调控拟南芥根毛形成的分子机制
  •   4.1 材料与方法
  •     4.1.1 植物材料和生长条件
  •     4.1.2 突变体鉴定
  •     4.1.3 根毛长度、数量统计
  •     4.1.4 RNA提取、反转录和荧光定量PCR
  •     4.1.5 激素处理
  •     4.1.6 营养处理实验
  •     4.1.7 GUS染色
  •     4.1.8 RNA-Seq测序
  •     4.1.9 酵母双杂载体构建
  •     4.1.10 酵母双杂点对点验证
  •     4.1.11 地塞米松(Dexamethasone,DEX)和放线菌酮(Cycloheximide,CHX)
  •   4.2 结果与分析
  •     4.2.1 ZFP6是调控根毛发育的正向调控因子
  •     4.2.2 ZFP6响应乙烯和细胞分裂素信号调控根毛发育
  •     4.2.3 ZFP6响应低磷、低钾信号调控根毛发育
  •     4.2.4 ZFP6根毛相关下游靶基因筛选
  •     4.2.5 ZFP6其他下游基因筛选
  •   4.3 讨论
  • 5 植物激素通过调控根表皮基因来促进根毛的发育
  •   5.1 材料与方法
  •     5.1.1 植物材料和生长条件
  •     5.1.2 根毛长度和数量统计
  •     5.1.3 植物激素处理
  •     5.1.4 RNA提取和定量PCR分析
  •     5.1.5 公共芯片数据和生物信息学分析
  •     5.1.6 统计分析
  •   5.2 结果与分析
  •     5.2.1 乙烯在促进根毛起始方面有独特的作用
  •     5.2.2 命运决定因子突变体对植物激素的敏感性较低
  •     5.2.3 细胞分裂素独立于生长素和乙烯来促进根毛伸长
  •     5.2.4 植物激素协同增强根毛伸长
  •   5.3 讨论
  • 6 水稻根毛发育调控基因的功能研究
  •   6.1 材料与方法
  •     6.1.1 植物材料和生长条件
  •     6.1.2 水稻根系RNA提取和反转录
  •     6.1.3 基因克隆与载体构建
  •     6.1.4 拟南芥遗传转化
  •     6.1.5 水稻遗传转化与株系筛选
  •     6.1.6 转基因株系筛选
  •     6.1.7 拟南芥根毛长度、数量统计
  •     6.1.8 水稻根毛长度统计
  •   6.2 结果与分析
  •     6.2.1 拟南芥转基因材料qRT-PCR鉴定及株系筛选
  •     6.2.2 水稻转基因材料qRT-PCR鉴定及株系筛选
  •     6.2.3 OsRHL41-like是调控水稻根毛伸长的正向调控因子
  •     6.2.4 OsRHD1-like是调控水稻根毛伸长的负调控因子
  •     6.2.5 OsRHD2-like1和OsRHD2-like2是根毛伸长的正向调控因子
  •   6.3 讨论
  • 7 全文总结和展望
  •   7.1 全文总结
  •   7.2 展望
  • 参考文献
  • 附录A: 攻读博士学位期间所取得的成果
  • 附录B: 作者简历
  • 文章来源

    类型: 博士论文

    作者: 黄琳丽

    导师: 甘银波

    关键词: 根毛,乙烯,细胞分裂素,低磷,低钾

    来源: 浙江大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 浙江大学

    分类号: Q943.2

    总页数: 145

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