论文摘要
肿瘤浸润免疫细胞通过发挥促肿瘤和抗肿瘤的作用,可以深刻地影响肿瘤的进展以及抗癌治疗的成功.因此,对于肿瘤浸润免疫细胞的量化有望揭示免疫系统在人类癌症中的多方面作用及其参与肿瘤逃逸机制和对治疗的反应.解卷积的目的就是试图在复杂组织里存在的免疫细胞中寻找新的免疫疗法,其核心思想是利用算法和免疫细胞的表达特征,从细胞混合物的表达数据中量化免疫细胞比例信息,以准确刻画肿瘤样本测序数据的免疫浸润情况.为此,提出了一个新的基于逐步回归策略的解卷积算法模型,并使用真实的肿瘤样本微阵列数据和RNA-Seq测序数据来测试该算法的准确性.与CIBERSORT和dtangle相比较,具有良好的解卷积性能.
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 裴晶晶,余彩裙,佘玉梅
关键词: 浸润性免疫细胞,反卷积,基因表达谱,标签矩阵
来源: 云南民族大学学报(自然科学版) 2019年04期
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,肿瘤学
单位: 云南民族大学数学与计算机科学学院
基金: 国家自然科学基金(31460297),云南民族大学创新基金(2018YJCXS230)
分类号: R730.2;Q811.4
页码: 371-376
总页数: 6
文件大小: 1634K
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