从江香猪SIM1基因SNP位点遗传效应分析

从江香猪SIM1基因SNP位点遗传效应分析

论文摘要

研究SIM1基因多态性与从江香猪胴体性状的关联性,寻找影响从江香猪胴体性状的数量性状基因座(QTL),为分子标记辅助选择提供依据;利用DNA直接测序技术,对从江香猪SIM1基因的C77T、C225T、A426G位点进行基因分型,采用SHEsis在线软件构建单倍型。在受试群体中,发现SIM1基因的3个SNP位点均有3种基因型,构建7种单倍型;最小二乘分析发现,3个SNP位点与肌内脂肪、眼肌面积、皮厚之间差异均不显著(P>0.05),C77T、A426G位点与从江香猪背膘厚差异显著(P<0.05);MM基因型、CC基因型、GG基因型的肌内脂肪和眼肌面积高于其他基因型;NN基因型、TT基因型、AA基因型的背膘厚和皮厚低于其他基因型;肌内脂肪最高的为MMCCAA聚合基因型,眼肌面积最高的为MNCCGG聚合基因型;背膘厚和皮厚最低的均为MNTTAA聚合基因型。可以考虑将MM基因型、CC基因型、GG基因型以及MMCCAA聚合基因型、MNCCGG聚合基因型作为影响从江香猪肌内脂肪和眼肌面积的有利基因型,将NN基因型、TT基因型、AA基因型以及MNTTAA聚合基因型作为影响背膘厚和皮厚有利基因型。

论文目录

  • 1 试验与方法
  •   1.1 试验时间与地点
  •   1.2 试验材料
  •     1.2.1 试验动物
  •     1.2.2 主要试剂及仪器
  •   1.3 试验方法
  •     1.3.1 DNA提取
  •     1.3.2 引物设计与PCR扩增
  •     1.3.3 PCR反应体系及条件
  •     1.3.4 统计分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PCR产物检测
  •   2.2 测序结果分析
  •   2.3 SNP位点的基因型频率及遗传特异性分析
  •   2.4 连锁不平衡分析与单倍型构建
  •   2.5 SIM1基因不同基因型与胴体性状的关联性分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李俊,毛世明,陈大芳,龙清孟,周迪,李平,张勇,张雄,冯文武,李明勇,尹杨莎,唐明宗

    关键词: 从江香猪,基因,多态性,胴体性状

    来源: 养猪 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 畜牧与动物医学

    单位: 贵州大学动物科学学院,贵州省畜牧兽医研究所

    基金: 贵州省农业农村厅自立科研项目《从江香猪胴体及肉质相关候选基因研究》(20171221号)资助,中央引导地方科技发展专项资金项目[黔科中引地(2018)4015],贵州省农业动植物育种项目合同书[黔农育专字(2017)012号]

    分类号: S828.2

    DOI: 10.13257/j.cnki.21-1104/s.2019.06.021

    页码: 57-61

    总页数: 5

    文件大小: 367K

    下载量: 76

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