小鼠肝脏蛋白质组数据门户

小鼠肝脏蛋白质组数据门户

论文摘要

肝脏是哺乳动物体内的代谢中枢,系统性研究肝脏蛋白质组在不同的生理和病理状态下的表达情况有助于我们理解肝脏的功能机理。随着高精度质谱技术的不断发展,众多小鼠肝脏生理病理研究产生了大量蛋白质组学数据。文中系统性整理了834例小鼠肝脏的蛋白质组学实验,建立了小鼠肝脏蛋白质组数据门户(Mouse Liver Portal,http://mouseliver.com),该门户中包含了肝脏在不同生理和病理状态下的蛋白质组学数据,如不同性别、年龄、昼夜节律、细胞类型和不同时间阶段的部分肝切除、非酒精性脂肪肝等状态。该门户能够提供肝脏在不同状态下蛋白的表达变化情况、差异显著的蛋白质和它们参与的生物学过程以及潜在的信号转导和调控网络。作为目前最全面的小鼠肝脏蛋白质组数据门户,该数据库能够给肝脏生物学研究提供重要的资源和参考。

论文目录

  • 1 数据收集和处理
  •   1.1 元数据和蛋白质组数据的收集
  •   1.2 数据质控
  •   1.3 数据预处理
  •   1.4 基因集功能分析方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 小鼠肝脏蛋白质组数据门户概览
  •   2.2 基本功能
  •     2.2.1 比较功能
  •     2.2.2 查询功能
  •     2.2.3 数据上传和下载功能
  • 3 总结
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘洋,冯晋文,刘万霖,秦钧,丁琛,贺福初

    关键词: 肝脏,蛋白质组学,数据库

    来源: 生物工程学报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 复旦大学生物医学研究院,复旦大学生命科学学院

    基金: 上海市科技重大专项(No.2017SHZDZX01)资助~~

    分类号: Q51

    DOI: 10.13345/j.cjb.190166

    页码: 1715-1722

    总页数: 8

    文件大小: 2069K

    下载量: 96

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