鲫鱼养殖池塘底泥菌群结构及常见可培养菌分析

论文摘要

为了研究江苏地区鲫鱼养殖池塘底泥细菌菌群结构与多样性,通过高通量测序技术对2017年8～10月间采集的江苏省不同区域养殖池塘底泥中所有细菌的16S rRNA V3-V4基因进行扩增测定,分析了底泥菌群结构特征;并通过平板计数法和选择培养基法检测池塘底泥中细菌总数和主要常见菌。结果表明,49个样品高通量测序共获得有效序列2 152 956条,可归为17 735个分类操作单元（OTUs）;物种注释结果显示,鲫鱼养殖池塘底泥中具有较高的菌群多样性,检测到的细菌归属于29个门类;所有池塘底泥都具有主要门类为变形菌门、绿弯菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、水生古细菌门、酸杆菌门、放线菌门、硝化螺旋菌门、螺旋菌门、芽单胞菌门、蓝细菌门、浮霉菌门、疣微菌门等。在属的水平上主要以硫杆菌属、乳酸球菌属、硫氧化菌、甲烷菌、地杆菌属、假单胞菌属、厌氧粘杆菌属、甲烷绳菌属、芽孢杆菌属等为主;所有池塘底泥共有菌主要有乳酸球菌属、甲烷菌、盐单胞菌、芽孢杆菌、红杆菌属、链球菌属、肉杆菌属、微小杆菌属、土芽孢杆菌属等。通过细菌培养发现,池塘底泥中常见益生菌如乳酸菌、芽孢菌具有较高的比例。可见鲫鱼养殖池塘底泥菌群结构及组成具有多样性,不同养殖池塘中共有的细菌可作为益生菌开发的参考菌株。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 朱卫,郭丽芸,唐忠林,储卫华

关键词: 池塘底泥,菌群结构,多样性,高通量测序

来源: 科学技术与工程 2019年04期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅱ辑,基础科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 生物学,环境科学与资源利用

单位: 中国药科大学生命科学与技术学院,南京市水产科学研究所

基金: 江苏省海洋与渔业局水产三新工程项目(Y2017-40)资助

分类号: X52;X172

页码: 259-263

总页数: 5

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