论文摘要
目的:基于生物信息学分析方法研究miR-103a-3p在子宫内膜癌（endometrial carcinoma, EC）中的表达情况及其对预后的影响,评估其在EC中的临床意义。方法:本研究利用癌症基因图谱（TCGA）数据库分析miR-103a-3p在EC组织中的表达;利用Kaplan-Meier plotter数据库分析miR-103a-3p与EC患者预后相关性;利用miRWalk 2.0数据库获取miR-103a-3p的靶基因,同时采用DAVID 6.8数据库对靶基因进行GO和KEGG富集分析,进一步以Cytoscape 3.7.1软件构建靶蛋白互作（PPI）网络并筛选核心基因,通过数据库对核心基因进一步验证。结果:TCGA数据库分析显示, miR-103a-3p在EC组织中的表达水平显著高于正常组织。Kaplan-Meier生存分析显示, miR-103a-3p低表达EC患者的总生存时间明显多于高表达患者。GO分析显示,miR-103a-3p的靶基因显著富集到蛋白质结合、细胞质、细胞质基质、细胞膜、核质、ATP结合等生物学过程。KEGG分析显示, miR-103a-3p的靶基因显著富集于AMPK、Hippo等关键信号通路。CDC42、BDNF、FBXW7、CDC27、ACTR2、FASN、CDC23、CD40、FLT3、BAIAP2是miR-103a-3p潜在靶基因PPI网络中的核心基因,经数据库验证在EC中仅CD40的mRNA和蛋白水平显著降低。生存分析显示CD40低表达与EC患者预后不良相关。结论:EC组织中miR-103a-3p低表达在子宫内膜癌相关的生物学过程起重要作用,可能通过调控潜在靶基因CD40参与其中,有潜力成为EC诊断标志物、预后指标及治疗靶点。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 周登莲,刘晓岚,邓鑫
关键词: 子宫内膜癌,靶基因,生物信息学
来源: 西南医科大学学报 2019年06期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技,基础科学
专业: 生物学,妇产科学,肿瘤学,生物医学工程
单位: 西南医科大学教务处,西南医科大学,西南医科大学药物与功能性食品研究中心
基金: 国家自然科学基金(81800434),四川省卫生健康委员会项目(16ZD033),省级大学生创新创业训练计划(201816032154)
分类号: R737.33;Q811.4
页码: 501-506
总页数: 6
文件大小: 2231K
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