导读:本文包含了成簇基因论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,蛋白,序列,稻瘟病,核苷酸,回文,分枝。
成簇基因论文文献综述
王颖芳,王鹏飞,詹煜慧,张晓萌,段广才[1]（2019）在《志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系》一文中研究指出目的探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系。方法从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比对等方法获得志贺菌中CRISPR1、CRISPR2和CRISPR-Q1的分布情况、重复序列和间隔序列信息,通过BLAST方法获得毒力基因和耐药基因在志贺菌中的分布情况,SPSS 21.0软件分析CRISPR与毒力基因和耐药基因的关系。结果志贺菌中的CRISPR1和CRISPR2在不同菌株中的间隔序列差别较大,CRISPRQ1分布更为广泛(超过99%)。毒力基因在志贺菌中分布比较广泛(均超过56%),耐药基因中的blaOXA-1、camr、Sul2、tetB分布也比较广(超过50%)。CRISPR1/CRISPR2与是否携带9种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05),CRISPR-Q1与是否携带3种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2和CRISPR-Q1均与志贺菌中存在的毒力基因和耐药基因的个数间有统计学关联(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目之间存在统计学关联(χ2=61.6,P<0.001)。结论志贺菌中不同CRISPR的分布差异比较大,存在的间隔序列数目不等;志贺菌CRISPR与部分毒力基因和耐药基因之间存在负相关;CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目存在正相关。(本文来源于《西安交通大学学报(医学版)》期刊2019年01期）
翟亚男,许泉,郭亚,吴强[2]（2016）在《原钙粘蛋白基因簇调控区域中成簇的CTCF结合位点分析》一文中研究指出哺乳动物中原钙粘蛋白(Protocadherin,Pcdh)基因簇包含50多个串联排列的基因,这些基因形成3个紧密相连的基因簇(Pcdh?、Pcdh?和Pcdh?),所编码的原钙粘蛋白质群在神经元多样性(Neuronal diversity)和单细胞特异性(Single cell identity)以及神经突触信号转导中发挥重要作用。前期的工作已证实转录因子CTCF(CCCTC-binding factor)与CTCF结合位点(CTCF-binding site,CBS)的方向性结合能够决定增强子和启动子环化的方向以及其远距离交互作用的特异性,并进一步在Pcdh基因座(Locus)形成两个(Pcdh?和Pcdh?)染色质拓扑结构域(CTCF/cohesin-mediated chromatin domain,CCD),而且染色质拓扑结构域对于控制基因表达调控至关重要。本文通过生物信息学方法对比人类和小鼠序列,发现Pcdh??染色质拓扑结构域调控区域中的DNase I超敏位点(DNase I hypersensitive sites,HSs)较为保守。染色质免疫沉淀及大规模测序实验(Chromatin immunoprecipitation and massive parallel sequencing,Ch IP-Seq)揭示CBS位点在Pcdh??调控区域中成簇分布并且具有相同的方向。凝胶电泳迁移实验(Electrophoresis mobility shift assay,EMSA)确定Pcdh??调控区域内具体的42 bp CBS位点并且发现一个CTCF峰包含两个CBS位点。在全基因组范围内,运用计算生物学方法分析CTCF和增强子、启动子等调控元件的关系,发现CBS位点在调控元件附近有较多分布,推测CTCF通过介导增强子和启动子的特异性交互作用,在细胞核叁维基因组内形成活性转录枢纽调控基因精准表达。(本文来源于《遗传》期刊2016年04期）
朱明,王庆,徐东芳,张魁,杨卉[3]（2015）在《结核分枝杆菌MVLA基因分型成簇的影响因素分析》一文中研究指出目的探讨马鞍山地区结核病患者结核分枝杆菌基因分型成簇的影响因素。方法采用PCR及琼脂糖凝胶电泳技术,选取15个多位点可变数目串联重复序列分析(MVLA),对104株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型,同时对基因分型成簇的影响因素进行分析。结果 104株结核分枝杆菌菌株共分为38个不同的基因型,成簇基因型占83.65%(87/104),单一基因型占16.35%(17/104)。耐药菌株、不同性别和不同治疗患者在成簇和单一基因型的分布上差异无统计学意义(χ2=0.036,P=0.849),但在不同年龄之间差异有统计学意义(P<0.05)。结论马鞍山地区结核分枝杆菌基因型成簇率较高,提示结核分枝杆菌近期传播的风险较高,应加强对结核病患者的管理。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2015年19期）
薛泽润,王颖芳,段广才,杨海燕,郗园林[4]（2015）在《志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列的相关基因检测》一文中研究指出目的建立检测志贺菌CRISPR相关基因的斑点杂交方法。方法分别采用PCR法制备地高辛标记DNA探针和人工合成的寡核苷酸探针,与志贺菌CRISPR相关基因进行斑点杂交。结果设计出志贺菌CRISPR的相关基因探针;实现了志贺菌CRISPR系统的探针制备及杂交方法的建立。结论斑点杂交可以快速大量检测志贺菌CRISPR的相关基因。(本文来源于《现代预防医学》期刊2015年18期）
吴建利,柴荣耀,樊叶杨,李德葆,郑康乐[5]（2004）在《抗稻瘟病水稻材料谷梅2号中主效抗稻瘟病基因的成簇分布》一文中研究指出应用由籼稻组合中 15 6 /谷梅 2号衍生的 30 4个重组自交系 ,构建了由 177个标记组成、覆盖 12条水稻染色体的连锁图谱 ,定位控制水稻稻瘟病抗性的主效基因。前期定位的控制对中国稻瘟菌菌系 92 183(小种ZC1 5)穗瘟抗性的基因Pi2 5 (t)的位置得到进一步确认 ,位于第 6染色体标记A7和RG4 5 6之间 ,与A7和RG4 5 6的遗传距离分别为 1.7和 1 5cM ;发现群体对菲律宾稻瘟菌菌系Ca89(4谱系 )的叶瘟抗性由单基因控制 ,将该暂命名为Pi2 6 (t)的基因定位于第 6染色体标记B10和R6 74之间 ,与B10和R6 74的遗传距离分别为 5 .7和 2 5 .8cM。两个基因座位上的抗病等位基因均来源于谷梅 2号 ,表明谷梅 2号中存在控制水稻稻瘟病抗性的基因簇。(本文来源于《中国水稻科学》期刊2004年06期）
黄粤[6]（2003）在《细菌人工染色体(BAC)与成簇基因功能表达调控机制研究》一文中研究指出细菌人工染色体(Bacterial Artificial Chromosome,BAC)是二十世纪九十年代发展起来的一种载体系统。它是建立在大肠杆菌的F因子(F Factor)的基础上的,F因子亦称F质粒,它可将宿主染色体基因转移至另一宿主细胞。人工构建的BAC载体,保留了F因子的与自动复制、拷贝数控制以及质粒分酉等基本功能相关的基因:oriS,repE,parA,parB(本文来源于《后基因组时代的基因功能研究——青年科学家论坛第八十次活动论文集》期刊2003-11-01）
徐海明,刘德培[7]（1999）在《成簇基因的时空表达调控》一文中研究指出成簇基因具有不同于单个基因的特性，同一簇内基因大多有类似的结构、功能以及表达模式，基因之间时空表达模式及表达量高度协调，提示同一簇基因是作为统一整体进行调节的，具有共同的调节机制。基因成簇排列是实现基因时空协调表达的基础，是遗传信息的一种高级组织形式，具有强大的进化优势。要揭示成簇基因表达调控的基本规律，应从顺式作用元件、反式作用因子、染色质结构等层次，进行整体的以及多基因相互作用的研究，这些机制的阐明，对细胞分化、个体发育程序的研究具有重大的理论价值，是生命科学极为重要的基础研究领域。(本文来源于《生命科学》期刊1999年03期）
刘德培[8]（1998）在《成簇基因的时空表达调控》一文中研究指出基因簇是遗传信息组织的高级形式,可分为叁大类。基因簇的形成有利于实现整体功能的协调一致,具有强大的进化优势。同一基因簇内的各基因具有类似的表达特异性,提示它们受共同的调节机制控制,或具有共同的顺式作用元件,或处于同一染色质环境。成簇基因具有高度的时空有序性以及表达量的高度协调性等规律,在研究成簇基因表达调控机制时,应建立一定的模型,确保遗传信息的完整性,从整体的、发育的角度研究多基因的相互作用及功能。(本文来源于《生命科学与生物技术：中国科协第叁届青年学术年会论文集》期刊1998-08-20）
成簇基因论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
哺乳动物中原钙粘蛋白(Protocadherin,Pcdh)基因簇包含50多个串联排列的基因,这些基因形成3个紧密相连的基因簇(Pcdh?、Pcdh?和Pcdh?),所编码的原钙粘蛋白质群在神经元多样性(Neuronal diversity)和单细胞特异性(Single cell identity)以及神经突触信号转导中发挥重要作用。前期的工作已证实转录因子CTCF(CCCTC-binding factor)与CTCF结合位点(CTCF-binding site,CBS)的方向性结合能够决定增强子和启动子环化的方向以及其远距离交互作用的特异性,并进一步在Pcdh基因座(Locus)形成两个(Pcdh?和Pcdh?)染色质拓扑结构域(CTCF/cohesin-mediated chromatin domain,CCD),而且染色质拓扑结构域对于控制基因表达调控至关重要。本文通过生物信息学方法对比人类和小鼠序列,发现Pcdh??染色质拓扑结构域调控区域中的DNase I超敏位点(DNase I hypersensitive sites,HSs)较为保守。染色质免疫沉淀及大规模测序实验(Chromatin immunoprecipitation and massive parallel sequencing,Ch IP-Seq)揭示CBS位点在Pcdh??调控区域中成簇分布并且具有相同的方向。凝胶电泳迁移实验(Electrophoresis mobility shift assay,EMSA)确定Pcdh??调控区域内具体的42 bp CBS位点并且发现一个CTCF峰包含两个CBS位点。在全基因组范围内,运用计算生物学方法分析CTCF和增强子、启动子等调控元件的关系,发现CBS位点在调控元件附近有较多分布,推测CTCF通过介导增强子和启动子的特异性交互作用,在细胞核叁维基因组内形成活性转录枢纽调控基因精准表达。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
成簇基因论文参考文献
[1].王颖芳,王鹏飞,詹煜慧,张晓萌,段广才.志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系[J].西安交通大学学报(医学版).2019
[2].翟亚男,许泉,郭亚,吴强.原钙粘蛋白基因簇调控区域中成簇的CTCF结合位点分析[J].遗传.2016
[3].朱明,王庆,徐东芳,张魁,杨卉.结核分枝杆菌MVLA基因分型成簇的影响因素分析[J].中国卫生检验杂志.2015
[4].薛泽润,王颖芳,段广才,杨海燕,郗园林.志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列的相关基因检测[J].现代预防医学.2015
[5].吴建利,柴荣耀,樊叶杨,李德葆,郑康乐.抗稻瘟病水稻材料谷梅2号中主效抗稻瘟病基因的成簇分布[J].中国水稻科学.2004
[6].黄粤.细菌人工染色体(BAC)与成簇基因功能表达调控机制研究[C].后基因组时代的基因功能研究——青年科学家论坛第八十次活动论文集.2003
[7].徐海明,刘德培.成簇基因的时空表达调控[J].生命科学.1999
[8].刘德培.成簇基因的时空表达调控[C].生命科学与生物技术：中国科协第叁届青年学术年会论文集.1998
论文知识图
