白桦(Betula platyphylla×B.pendula)BpEIL1基因克隆及生物信息学分析

白桦(Betula platyphylla×B.pendula)BpEIL1基因克隆及生物信息学分析

论文摘要

EIN3/EILs是乙烯信号转导过程中的重要转录因子,在植物抗逆及不同激素协同和拮抗反应中具有重要作用。本研究通过RT-PCR方法扩增得到白桦BpEIL1基因序列,并利用生物信息学方法对获得的序列进行结构及功能预测。结果表明,白桦BpEIL1基因全长为2 968 bp,CDS为1 776 bp,编码的蛋白由591个氨基酸构成,属于EIN3超家族成员,是一个亲水性的不稳定蛋白。在白桦基因组中共找到2个EIN3超家族基因,与模式植物拟南芥和毛果杨EIN3超家族基因序列进行比较分析。结果表明,白桦BpEIL1基因与拟南芥AtEIL3和毛果杨PtEIL3基因亲缘关系较近,而另一个基因则与毛果杨PtEIN3基因亲缘关系较近。本研究对白桦BpEIL1基因产物的特征进行了初步的分析,为该基因功能的进一步研究提供了参考。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 克隆获得BpEIL1基因
  •   1.2 BpEIL1理化性质预测
  •   1.3 BpEIL1信号肽和跨膜结构分析
  •   1.4 BpEIL1保守蛋白预测
  •   1.5 BpEIL1二级、三级结构预测
  •   1.6 蛋白质修饰位点的预测
  •   1.7 氨基酸序列同源性对比
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 植物材料
  •   3.2 BpEIL1基因的克隆
  •   3.3 BpEIL1蛋白的生物信息学分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李然红,陈鑫,刘丹,姜静

    关键词: 白桦,基因克隆,生物信息学

    来源: 分子植物育种 2019年21期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,林业

    单位: 牡丹江师范学院生命科学与技术学院,东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31800558,31670673),北方药食技术工程中心专项(PT2018011)共同资助

    分类号: S792.153;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.007003

    页码: 7003-7009

    总页数: 7

    文件大小: 2412K

    下载量: 110

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