基于线粒体D-loop基因全序列分析贵州、四川、广西恒河猴群体遗传多样性

基于线粒体D-loop基因全序列分析贵州、四川、广西恒河猴群体遗传多样性

论文摘要

目的从分子水平探讨贵州、四川、广西恒河猴群体遗传多样性,为今后开展恒河猴遗传资源的保护及合理开发利用提供借鉴和背景资料。方法采用PCR直接测序法测定贵州、四川、广西恒河猴38份样品的线粒体D-loop基因全序列,用MEGA和DNASP软件对变异位点数、简约信息位点数、单倍型、单倍型多样度、核苷酸多样度等遗传信息进行分析,基于邻接法(Neighbor-joining,NJ)构建系统发生树。结果 38份样品定义了31种单倍型,共发现136个变异位点,其中单一多态位点20个,简约信息位点113个,缺失/插入3个。结论不同地区恒河猴群体均存在着较丰富的遗传多态性。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 试剂和仪器
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 基因组DNA的提取:
  •     1.3.2 PCR扩增:
  •     1.3.3 琼脂糖凝胶电泳及PCR产物直接测序:
  •     1.3.4 数据处理与结果分析:
  • 2 结果
  •   2.1 序列特征和单倍型分布
  •   2.2 不同地区恒河猴遗传多样性
  •   2.3 单倍型的系统进化关系
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 国内会议

    作者: 禹文海,马进,赵远,鲁帅尧,杨凤梅,李艳艳,王俊斌,陈丽雄,徐鸿界,刘权,和占龙

    关键词: 恒河猴,线粒体,单倍型,遗传多态性

    来源: 第十五届中国实验动物科学年会 2019-09-21

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室

    分类号: Q953

    DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.068191

    页码: 386-391

    总页数: 6

    文件大小: 1372k

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