导读:本文包含了表达谱分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,生物,陆地棉,信息学,菌核,棉铃虫,细胞。
表达谱分析论文文献综述
徐志远,秦永[1]（2019）在《喉鳞状细胞癌患者血清中miRNAs表达谱分析》一文中研究指出目的探究喉鳞状细胞癌(LSCC)血清特异性微RNA(miRNA)的表达及其临床诊断价值。方法选择2016年1月至2019年1月莒南县人民医院耳鼻喉科收治的82例LSCC患者作为研究组,同期选择50名健康体检者作为对照组。采集两组空腹静脉血,应用miRNA表达谱芯片筛选出表达差异较大的miRNA分子,并采用实时荧光定量聚合酶链反应对表达差异较大的miRNA分子进行验证。采用受试者工作特征曲线对`选出的miRNA分子的诊断价值进行评估。结果研究组血清miR-31、miR-141、miR-149a、miR-182、miR-485-3p、miR-122、miR-33、miR-205的相对表达量显着高于对照组,而miR-133a、miR-223以及miR-145的相对表达量显着低于对照组(P <0. 05)。miR-31、miR-33、miR-205诊断LSCC的曲线下面积分别为0. 99(95%CI 0. 99～1. 00)、0. 98(95%CI 0. 95～1. 00)、0. 97(95%CI 0. 95～1. 00),差异均有统计学意义(P <0. 05)。结论 miR-31、miR-33、miR-205可作为LSCC诊断的有效生物标志物。(本文来源于《医学综述》期刊2019年23期）
解美霞,杨君,王国宁,李志坤,张艳[2]（2019）在《基于表达谱分析陆地棉DUF642基因家族抗逆功能》一文中研究指出【目的】DUF642(Domain of unknown function 642 genes)是1个未知功能基因家族,在植物逆境胁迫响应中发挥重要作用。本研究旨在分析其在棉花抗逆反应中的功能。【方法】基于陆地棉基因组数据,系统地鉴定DUF642基因家族。利用生物信息学方法分析基因结构、理化性质、亚细胞定位、亲缘关系、启动子顺式作用元件等。应用转录组数据和实时定量聚合酶链式反应技术分析该家族基因在不同组织和多种逆境(冷、热、干旱、盐和黄萎病菌)胁迫下的表达规律。【结果】陆地棉基因组中包含23个DUF642基因,分布于14条染色体和1条Scaffold;编码的蛋白含有1～2个保守的DUF642结构域,多定位在细胞膜。DUF642家族基因可分成4个亚组,在进化上相对保守。DUF642基因具有较为广泛的组织表达类型,其中根和叶中表达较高。通过启动子和胁迫表达分析,推测Gh DUF642-09参与棉花抗盐胁迫;GhDUF642-08和GhDUF642-19参与棉花抗黄萎病;GhDUF642-02、GhDUF642-14和Gh DUF642-17参与棉花生长发育和抗逆胁迫。【结论】本研究结果为进一步研究DUF642基因家族功能和棉花抗逆分子机制提供了重要的理论依据。(本文来源于《棉花学报》期刊2019年06期）
殷培峰,孙骁,步显勇,向玉勇,柴新义[3]（2019）在《小粒性菌核病菌侵染桑椹表达谱分析》一文中研究指出目的探明桑椹小粒性菌核病病原菌侵染初期基因表达特征。方法本研究利用高通量测序技术对病原菌转录组进行测序,构建了样品cDNA文库。结果 reads序列拼接后共获得14446个Unigenes。在NR数据库进行BLAST比对,14357个Unigenes被注释,包含5种真菌,数目最多的是核盘菌,其次为富克葡萄孢盘菌。经GO分析,生物学功能主要为结合、催化、分子结构和运输等。生物学通路注释到208个Pathway,包含基因数较多途径为代谢通路,核糖体和次生代谢产物生物合成等。结论致病基因筛选发现cAMP依赖性蛋白激酶,多聚半乳糖醛酸酶和几丁质酶等致病基因都获得表达。(本文来源于《泰山医学院学报》期刊2019年10期）
王延莉,梁祎凡,肖成,金花子,曹阳[4]（2019）在《小尾寒羊ACAA1基因CDS克隆及组织表达谱分析》一文中研究指出为探索乙酰辅酶A酰基转移酶1(acetyl-coenzyme A acyltransferase 1,ACAA1)基因的生物学功能,明确该基因在小尾寒羊不同组织中的表达差异,试验采集小尾寒羊心脏、肝脏、胃、十二指肠、小肠、背最长肌、皮下脂肪组织,提取总RNA,根据GenBank中公布的绵羊ACAA1基因序列(登录号:XM_004018227.3)设计引物,利用RT-PCR和分子克隆技术获得小尾寒羊ACAA1基因完整CDS,并对其进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR检测该基因在小尾寒羊不同组织中的表达差异。结果显示,小尾寒羊ACAA1基因CDS长为1 071 bp,编码356个氨基酸;小尾寒羊ACAA1基因氨基酸序列与绵羊、山羊同源性最高,约为100%,与食蟹猴、狒狒和野猪的同源性均为93.0%;系统进化树结果显示,小尾寒羊与绵羊、山羊位于同一分支,亲缘关系较近,与穿山甲、狒狒的亲缘关系较远;各物种间同源性较高,保守性较强。ACAA1蛋白分子质量约为36.92 ku,分子式为C_(1603)H_(2638)N_(458)O_(501)S_(18),理论等电点为7.48,半衰期为30 h,消光系数为9 440,稳定系数为40.88,脂溶系数为92.67,亲水性氨基酸残基约占58%,为不稳定的碱性脂溶性亲水蛋白;不存在跨膜结构与信号肽,不是分泌蛋白;主要分布在过氧化物酶体,存在25个磷酸化位点、3个潜在的N-糖基化位点和4个O-糖基化位点。ACAA1蛋白二级结构含有α-螺旋(37.92%)、β-折迭(12.64%)和无规则卷曲(49.44%),叁级结构预测结果与其一致。实时荧光定量PCR结果显示,ACAA1基因在小尾寒羊不同组织中均有表达,其中在肝脏、皮下脂肪、小肠中表达量相对较高。本试验结果为进一步探索小尾寒羊ACAA1基因生物学功能及筛选与肉质性状相关的候选基因提供依据。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2019年10期）
王璟,李庆东,滑留帅,陈俊峰,张家庆[5]（2019）在《猪PAANCR组织表达谱分析及其对脂质生成的影响》一文中研究指出前期通过高通量测序比较去势和非去势猪皮下脂肪长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达差异,筛选到一个表达差异极显着的novel lncRNA——PAANCR,本试验旨在研究PAANCR在猪育肥不同阶段不同组织中的表达规律及其与脂质生成的关系。选用10头健康长×大二元杂交仔猪,在90和210 d各随机选取3头屠宰取样,使用实时荧光定量PCR方法检测PAANCR的表达谱,同时在3T3-L1细胞中使用siRNA干扰PAANCR的同源体lncRNA_(B130024G19Rik),通过油红O染色和实时荧光定量PCR分析其对脂肪沉积的作用。结果发现,PAANCR具有明显的组织特异性和发育特异性,其在肺脏、子宫、脾脏、肾脏和脂肪组织中表达量较高,而在肝脏、小肠和脑中的表达量随着年龄增长而增加,在肌肉组织中几乎不表达。同时,通过siRNA介导的干扰能够显着抑制PAANCR同源体的表达量,PAANCR同源体表达量降低后,关键成脂分化和脂质沉积调控基因表达量也随之减少。提示PAANCR可以作为调控猪脂质生成的候选因子,对于深入研究lncRNA参与调控猪脂质生成的分子机制具有重要意义。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2019年10期）
刘宏涛,张彤彤,张元川,杨华武,詹大方[6]（2019）在《肥胖合并急性心肌梗死患者血小板基因表达谱分析》一文中研究指出目的:比较分析急性心肌梗死首次发作人群中,BMI正常的患者与肥胖患者之间血小板基因表达的差异性,并探讨这些基因对急性心肌梗死可能造成的影响。方法:从GEO数据库中检索获取患者的芯片数据,并根据数据库中所提供的BMI将患者分为BMI正常组和肥胖组,接着通过GEO2R筛选出差异表达基因,并运用DAVID数据库对差异表达基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,然后运用STRING数据库以及Cytoscape软件筛选出其中的关键基因。结果:共筛选出550个差异基因,其中上调基因432个,下调基因118个。GO富集分析显示,差异基因主要在膜构成、细胞外基质、信号转导以及GTP酶活性正调控等功能富集。KEGG分析提示,差异基因主要参与cAMP信号通路、多巴胺能神经突触、胰岛素分泌信号通路、T细胞信号通路和FOX信号通路的调控。共筛选出ALB、KDR、HDAC2、IL10、EIF4A3、ERBB4、NRP1、GDNF、NPM1和NUP43等10个得分较高的基因,其中ALB和KDR为蛋白相互作用网络的核心节点。结论:血小板基因表达水平在肥胖和BMI正常患者之间存在明显差异,这些差异基因可能因BMI升高引起,并可能促进急性心肌梗死的发生。(本文来源于《临床心血管病杂志》期刊2019年10期）
胡亚,王玥,李清叶,魏海军,张庆丽[7]（2019）在《肾透明细胞癌基因表达谱分析及预后相关影响因素研究》一文中研究指出目的:挖掘肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)的基因表达变化,分析年龄、性别、肿瘤TNM分期及显着性差异表达基因与患者生存时间的相关性。方法:经在线数据平台GEPIA分析KIRC组织的基因表达谱,以|log2FC|> 1,P <0. 01筛选组间差异基因;下载肿瘤基因图谱TCGA中KIRC基因表达数据和相应的临床信息,运用R 3. 5. 1中的survival包进行Kaplan-Meier生存曲线的绘制和分析。结果:肾透明细胞癌组织中存在着2 959个差异表达基因,其中上调基因1 635个,下调基因1 324个。不同性别对患者生存率影响不大(P> 0. 05),随着年龄增大及TNM分期的进展,患者生存率下降(P <0. 001),ANGPTL4基因表达水平对患者生存率有较大影响(P <0. 05)。结论:分析肾透明细胞癌基因表达能够系统的探索疾病在基因水平的改变,寻找合适的分子标志物,有望成为疾病诊断、治疗及预后判断的新靶点。(本文来源于《中国中西医结合肾病杂志》期刊2019年09期）
王婷婷,索倩,孙晓燕,马跃敏,刘凯于[8]（2019）在《棉铃虫激活增强子结合蛋白AP-4基因的原核表达、多克隆抗体制备、表达谱分析及功能鉴定》一文中研究指出【目的】激活增强子结合蛋白4(activating enhancer binding protein 4, AP-4)是近年来备受关注的一类功能广泛的转录因子,参与Wnt/β-catenin信号通路的调控。本研究旨在研究棉铃虫Helicoverpa armigera HaAP-4基因的原核表达并制备多克隆抗体,明确HaAP-4基因的时空表达谱,初步探究HaAP-4对棉铃虫胆固醇载体蛋白2(sterol carrier protein-2, SCP-2)基因(HaSCP-2)表达的调控作用。【方法】通过PCR扩增棉铃虫HaAP-4基因片段,将其克隆至pET-28a原核表达载体,转化至大肠杆菌Escherichia coli BL21,经IPTG诱导表达,采用镍柱纯化重组蛋白,免疫新西兰兔制备多克隆抗体。运用RT-qPCR检测HaAP-4基因在棉铃虫不同发育阶段(卵、幼虫、预蛹、蛹和成虫)以及5龄幼虫和预蛹不同组织(中肠、脂肪体、头和表皮)中的表达水平。设计并合成HaAP-4 siRNA,转染棉铃虫Ha细胞,通过RT-qPCR检测和分析使用HaAP-4 siRNA进行RNA干扰后Ha细胞中HaAP-4和HaSCP-2基因mRNA的表达情况。【结果】成功构建pET-28a-HaAP-4重组表达质粒,在大肠杆菌细胞中获得高效表达的可溶性蛋白,目的蛋白大小约为55 kD,经纯化获得了纯度较高的重组蛋白,免疫新西兰兔成功制备了多克隆抗体,通过Western blotting检测显示抗体具有较好的特异性,ELISA分析表明抗体效价较高。发育阶段特异性表达结果显示,HaAP-4基因在棉铃虫不同发育阶段均有表达,其中在卵期、5龄幼虫期和预蛹期的表达量较高。组织表达结果表明,HaAP-4基因在5龄幼虫和预蛹不同组织中均有表达,且在中肠和头部具有高表达,而在表皮和脂肪体中表达量较低。RNA干扰实验发现,HaAP-4基因的敲降对HaSCP-2基因转录有显着影响,HaSCP-2基因mRNA表达水平下降了约55%。【结论】利用pET-28a原核表达系统能有效地在体外表达可溶性的HaAP-4,并制备了较好的多克隆抗体。RNAi实验结果提示,在中肠内高表达的HaAP-4基因能促进HaSCP-2基因的转录表达,在棉铃虫脂质生理代谢过程中发挥作用。本研究为进一步深入阐明棉铃虫HaAP-4的潜在功能打下了基础。(本文来源于《昆虫学报》期刊2019年09期）
黄啸博,陈智斌,曹新,魏钦俊,邢光前[9]（2019）在《WFS1突变致聋家系的鉴定及斑马鱼同源基因时空表达谱分析》一文中研究指出目的:对2个遗传性耳聋家系进行分子病因学鉴定,并应用斑马鱼对致聋基因WFS1进行初步功能分析。方法:利用靶向捕获测序技术,对2个家系进行外显子测序分析,确定候选致病基因。生物信息学预测人WFS1基因的功能以及模式生物斑马鱼与人类WFS1基因的同源性;采用整胚原位杂交和定量PCR法分析斑马鱼wfs1a和wfs1b的时空表达特征。结果:外显子测序及家系遗传共分离分析确定WFS1基因c.2036～2038delAGG(p.680delE)和c.1957C>T(p.653R>C)突变分别是2个家系的分子病因。定量PCR和全胚原位杂交结果显示斑马鱼wfs1a和wfs1b在胚胎发育不同时期呈现不同的时空表达特征。生物信息学分析提示wfs1b与人WFS1基因的进化距离更近,同源性更高。结论:2个遗传性耳聋家系均由WFS1突变所致,拓展了遗传性耳聋的基因突变谱。斑马鱼胚胎发育过程中wfs1a和wfs1b具有明显的时空表达特异性,wfs1b是人类WFS1的直系同源基因。研究结果既为耳聋分子诊断提供了支持,也为后续深入研究WFS1的突变致聋机制奠定了基础。(本文来源于《南京医科大学学报(自然科学版)》期刊2019年09期）
孙奴奴,白慧慧[10]（2019）在《2个山西地方猪种MX2基因组织表达谱分析》一文中研究指出MX2是由干扰素分泌的一个MX亚型的蛋白,该蛋白具有广泛的抗病毒作用以及GTP酶活性。本次实验采用3头晋汾白猪和3头新山西黑猪的皮肤、肌肉、脾脏、支气管淋巴结等18种组织的总RNA,通过RT-PCR方法对MX2基因在晋汾白猪与新山西黑猪的不同组织中的表达情况进行检测。然后通过SPSS 19软件对晋汾白猪与新山西黑猪的肺泡巨噬细胞、脾脏、白细胞与支气管淋巴结这四种免疫组织中MX2基因进行方差比较及多重检测分析。结果显示:晋汾白猪的脾与支气管淋巴结间的表达呈显着差异(0.01<P<0.05)。新山西黑猪的脾与支气管淋巴结间的表达呈显着差异(0.01<P<0.05)。MX2基因在晋汾白猪与新山西黑猪的支气管淋巴结中的表达呈显着差异(0.01<P=0.0174<0.05)。本实验预示MX2基因在免疫调控、抵抗疾病等方面可能发挥重要作用,为研究MX2在晋汾白猪和新山西黑猪的生物学功能提供一些基础材料。(本文来源于《现代畜牧科技》期刊2019年09期）
表达谱分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
【目的】DUF642(Domain of unknown function 642 genes)是1个未知功能基因家族,在植物逆境胁迫响应中发挥重要作用。本研究旨在分析其在棉花抗逆反应中的功能。【方法】基于陆地棉基因组数据,系统地鉴定DUF642基因家族。利用生物信息学方法分析基因结构、理化性质、亚细胞定位、亲缘关系、启动子顺式作用元件等。应用转录组数据和实时定量聚合酶链式反应技术分析该家族基因在不同组织和多种逆境(冷、热、干旱、盐和黄萎病菌)胁迫下的表达规律。【结果】陆地棉基因组中包含23个DUF642基因,分布于14条染色体和1条Scaffold;编码的蛋白含有1～2个保守的DUF642结构域,多定位在细胞膜。DUF642家族基因可分成4个亚组,在进化上相对保守。DUF642基因具有较为广泛的组织表达类型,其中根和叶中表达较高。通过启动子和胁迫表达分析,推测Gh DUF642-09参与棉花抗盐胁迫;GhDUF642-08和GhDUF642-19参与棉花抗黄萎病;GhDUF642-02、GhDUF642-14和Gh DUF642-17参与棉花生长发育和抗逆胁迫。【结论】本研究结果为进一步研究DUF642基因家族功能和棉花抗逆分子机制提供了重要的理论依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
表达谱分析论文参考文献
[1].徐志远,秦永.喉鳞状细胞癌患者血清中miRNAs表达谱分析[J].医学综述.2019
[2].解美霞,杨君,王国宁,李志坤,张艳.基于表达谱分析陆地棉DUF642基因家族抗逆功能[J].棉花学报.2019
[3].殷培峰,孙骁,步显勇,向玉勇,柴新义.小粒性菌核病菌侵染桑椹表达谱分析[J].泰山医学院学报.2019
[4].王延莉,梁祎凡,肖成,金花子,曹阳.小尾寒羊ACAA1基因CDS克隆及组织表达谱分析[J].中国畜牧兽医.2019
[5].王璟,李庆东,滑留帅,陈俊峰,张家庆.猪PAANCR组织表达谱分析及其对脂质生成的影响[J].中国畜牧兽医.2019
[6].刘宏涛,张彤彤,张元川,杨华武,詹大方.肥胖合并急性心肌梗死患者血小板基因表达谱分析[J].临床心血管病杂志.2019
[7].胡亚,王玥,李清叶,魏海军,张庆丽.肾透明细胞癌基因表达谱分析及预后相关影响因素研究[J].中国中西医结合肾病杂志.2019
[8].王婷婷,索倩,孙晓燕,马跃敏,刘凯于.棉铃虫激活增强子结合蛋白AP-4基因的原核表达、多克隆抗体制备、表达谱分析及功能鉴定[J].昆虫学报.2019
[9].黄啸博,陈智斌,曹新,魏钦俊,邢光前.WFS1突变致聋家系的鉴定及斑马鱼同源基因时空表达谱分析[J].南京医科大学学报(自然科学版).2019
[10].孙奴奴,白慧慧.2个山西地方猪种MX2基因组织表达谱分析[J].现代畜牧科技.2019
论文知识图
