论文摘要
为实现特定合成生物系统,需要使用恰当的蛋白质元件,即具有所需的特异性分子识别、酶催化活性等功能的天然蛋白质或工程改造蛋白质。以转录因子所识别的DNA序列的预测以及蛋白质-小分子特异性结合口袋的预测和设计为例,介绍计算方法在蛋白质功能预测和设计中的作用。强调了不同类型计算工具的整合以及它们与生物背景知识整合、计算方法通用性和准确性之间的平衡;讨论了有待解决的问题、计算的潜力和新方法的发展需求。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 刘海燕,陈泉,龙朋朋,黄斌,许洋,陈耀晞
关键词: 计算方法,转录因子,结合预测,结合口袋设计
来源: 生命科学 2019年04期
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学
单位: 中国科学技术大学生命科学学院大数据学院
基金: 国家自然科学基金项目(21773220,31570719,31470717),中科院青年创新促进会基金项目(2017494)
分类号: Q811.4
DOI: 10.13376/j.cbls/2019049
页码: 357-363
总页数: 7
文件大小: 1557K
下载量: 117
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