大鼠坐骨神经Wallerian溃变过程中LncRNA的差异表达分析

论文摘要

目的:采用分子生物学和生物信息学方法筛选大鼠坐骨神经损伤后Wallerian溃变(Wallerian degeneration,WD)过程中的关键长链非编码RNA(long none coding RNA, LncRNA),并分析该关键LncRNA分子在大鼠坐骨神经损伤过程中的作用。方法:采用Affymetrix大鼠Non Coding RNA芯片,分析大鼠坐骨神经损伤后WD过程中差异表达的LncRNA;通过实时定量聚合酶链式反应验证关键LncRNA的表达;预测关键LncRNA相关基因及功能。结果:基因芯片分析结果显示共有显著差异性LncRNA 708个和mRNA 2 649个,上调LncRNA 283个,下调LncRNA 425个。通过编码—非编码基因共表达分析和预测竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA, ceRNA)机制,显示在WD过程中发挥作用的LncRNA,其中上调19个,下调17个。WD早期差异表达的LncRNA靶基因11个,WD后期差异表达的LncRNA靶基因31个。结论:大鼠坐骨神经损伤后,LncRNA显著差异性表达,提示LncRNA在周围神经损伤修复与再生过程中可能发挥了一定作用,为进一步分析LncRNA在神经再生中的作用提供了实验基础。

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类型: 期刊论文

作者: 蔡敏,李雨婷,高楠楠,邵健,YUNG Bryant,王祎,姚登兵

关键词: 长链非编码,溃变,周围神经再生,表达谱基因芯片,大鼠

来源: 南通大学学报(医学版) 2019年06期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 神经病学

单位: 南通大学医学院,南通大学神经再生重点实验室,南通大学生命科学学院

基金: 国家自然科学基金资助项目(31971277,31950410551),南通市科技计划项目(JC2018091),江苏省研究生科研与实践创新计划项目(KYCX19-2050)

分类号: R745

DOI: 10.16424/j.cnki.cn32-1807/r.2019.06.001

页码: 433-437

总页数: 5

文件大小: 1025K

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标签：长链非编码论文;  溃变论文;  周围神经再生论文;  表达谱基因芯片论文;  大鼠论文;