序列分布论文_刘志高,王颖希,李甫,马原,焦章平

导读:本文包含了序列分布论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:序列,沙门,转录,模型,猪霍乱,华北平原,西南地区。

序列分布论文文献综述

刘志高,王颖希,李甫,马原,焦章平[1](2019)在《15个常染色体STR基因座在中国汉、藏、蒙、维、彝的序列分布差异》一文中研究指出目的获取中国5个民族(汉、藏、蒙、维、彝)15个常染色体STR基因座分型,探索不同民族群体间基因座的等位基因序列差异分布。方法本文以高通量测序为检测手段,利用以直扩法文库构建技术为核心的SeqType?R系统,对来自中国汉、藏、蒙、维、彝族人群,共计304份样本进行了STR序列多态性分析。检测基因座包括Amel、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、D8S1179、D21S11、D18S51、vWA、D5S818、FGA、TPOX、TH01、D2S1338、CSF1PO、D19S43。结果显示在9个STR基因座中,包括5个复杂序列基因座(D21S11、D2S1338、D3S1358、D8S1179、vWA)和4个简单序列基因座(D13S317、D16S539、D7S820、D5S818),序列多态性引起等位基因数目增加,增幅分别为汉族57%~169%,藏族29%~117%,蒙古族43%~100%,彝族29%~110%,维族56%~160%。由此导致这9个基因座个体识别率平均增加4.3%~5.8%。SeqTyper?R所涵盖的15个常染色体STR基因座随机匹配概率提高3个数量级,人群均值由7.2E-15下降至6.0E-18。其中维族人群变化最为突出(1.8E-15下降至1.6E-19)。结论等位基因频率统计显示,基因座亚型分布比例在不同人群中存在差异。(本文来源于《中国法医学杂志》期刊2019年06期)

毕金孟,蒋长胜[2](2019)在《华北地区地震序列参数的分布特征》一文中研究指出为系统地考察华北地区地震序列参数的分布特征,以期构建适合区域地震活动特征的短期概率预测模型和评估地震危险性,本文利用当前较为前沿的ETAS模型和R-J模型,采用连续滑动、多时段拟合的方式,对华北地区1970年以来的16个地震序列进行了参数拟合,并对参数的整体情况、参数之间的关系、参数与大地热流之间的关系等特征进行了分析研究.研究结果表明,主震发生后的早期阶段,地震序列参数变化相对较为剧烈,误差也较大;两种地震预测模型的序列参数呈现出一种优势分布特征,主要参数的平均值分别为αETAS=1.7404±0.3420,pETAS=0.9769±0.1396,aOML=-1.6638±0.5284,bOML=0.8312±0.1658,pOML=0.9053±0.1527,这与国际上其他区域的研究具有很强的一致性;大多数情况下,ETAS模型参数pETAS高于R-J模型参数pOML,平均偏高0.0716;序列参数αETAS与大地热流值整体上呈现一种负相关关系,激发次级余震的能力与大地热流具有一定的相关性.地震序列参数的分布特征以及与大地热流之间的关系对地震序列类型的判断,及基于地震序列参数构建定量化的短期概率预测模型,均有重要的应用价值.(本文来源于《地球物理学报》期刊2019年11期)

叶鹏,李显煌,陈杰,瞿绍宏,董章宏[3](2019)在《金铁锁转录组SSR的分布及其序列特征》一文中研究指出【目的】分析云贵地区金铁锁转录组中SSR位点信息的分布及其序列特征,为SSR引物的大量开发奠定基础。【方法】以金铁锁嫩叶为材料,经转录组测序后,利用MISA软件进行de novo组装;使用Excel软件进行分析并用Primer 3软件设计引物。【结果】从77 942条Unigenes序列中共检测到6 660个微卫星位点,出现频率为8.54%,平均分布距离为401.64 kb。检测到的SSR位点中以叁核苷酸和二核苷酸出现频率最高,分别占58.69%和35.77%,而以五核苷酸最少(1.24%)。AG/TC与GA/CT是二核苷酸的优势重复基元,分别占总基元的12.66%和10.45%。CTT/GAA和AAC/TTG在叁核苷酸中出现频率最高,占总基元的3.71%和3.60%。根据转录组的测序结果,金铁锁转录组的SSR位点出现的频率较高,具有丰富的基元类型,并且有较高的重复次数,具有较高的多态性潜力。根据转录组的测序结果,随机选出82对引物用于检测,其中有20对引物能扩增出清晰且单一的谱带。【结论】金铁锁转录组所产生的Unigene是开发SSR的有效来源,而获得的SSR引物可以为金铁锁种质资源的遗传变异研究提供更多的标记。(本文来源于《云南农业大学学报(自然科学)》期刊2019年05期)

莫忠妹,成宇,石甜,赵财[4](2019)在《基于ITS序列西南地区不同居群薤白亲缘关系及其地理分布格局研究》一文中研究指出该研究以西南地区分布的薤白(Allium macrostemon Bunge)为材料,对21个不同居群的薤白进行核糖体DNA的ITS序列测定,并结合GenBank相关序列,对27个不同居群薤白开展了系统分析,以探讨西南地区不同居群薤白的亲缘关系和生物地理分布格局。结果表明:(1)西南地区不同产区薤白nrDNA ITS序列长度介于607~638 bp之间,G+C含量为48%~52%,平均值为50%。(2)基于贝叶斯法和最大简约法构建的系统树均表明薤白为一单系群。(3)系统发育树分析结果显示,27个居群的薤白总体划分为a组和b组,其中位于西南地区东面的四川剑阁县、重庆巫溪县、贵州德江县和云南丘北县的薤白共同聚为a组,位于西南地区西面的四川汶川县、四川石棉县、四川江油市以及云南虎跳峡、云南昆明市、云南叁坝的薤白归为b组。研究表明,nrDNA ITS序列可以鉴定不同地区薤白的亲缘关系。(本文来源于《西北植物学报》期刊2019年09期)

杜付玉,廖成水,郁川,张春杰,程相朝[5](2019)在《sseK3基因在不同沙门菌中的分布与序列分析》一文中研究指出目的:了解sseK3基因在不同沙门菌中的分布情况及基因特点。方法:本研究对2株鼠伤寒沙门菌标准株、1株肠炎沙门菌标准株和3株分离株、3株猪霍乱沙门菌标准株、2株鸡白痢沙门菌标准株和3株分离株及鸡白痢多价诊断抗原,利用sseK3基因特异性引物通过PCR方法进行了sseK3基因的扩增克隆并将扩增出的基因片段送至生工进行测序,应用BLAST对测序序列进行比较分析,另外,通过SseK3抗体建立的ELISA方法再继续检测,进行二次验证。结果:实验结果显示:2株鼠伤寒沙门菌标准株和4株肠炎沙门菌株均扩增出了长度为(本文来源于《中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第二十五次学术交流会、中国病理生理学会动物病理学专业委员会第二十四次学术研讨会、中国实验动物学会实验病理学专业委员会第四次学术研讨会、中国兽医病理学家第四次研讨会论文集》期刊2019-07-27)

赵江南,周菊玲[6](2019)在《正态分布序列变点识别问题探讨》一文中研究指出文章对含有变点的正态分布随机变量序列进行了研究。构造了正态分布多变点模型,运用ASAMC(退火随机近似蒙特卡洛)方法得到了变点的估计,通过随机模拟进行验证,模拟结果表明对于变点个数及其位置的识别精准。实证检验了乌鲁木齐市1973—2017年共45年间平均温度序列的温度变点。(本文来源于《统计与决策》期刊2019年15期)

李昕蔓,金卓颖,苏安然,杨林夕,苏晟[7](2019)在《白皮松EST-SSR序列分布特征及引物开发》一文中研究指出为解决白皮松分子标记资源相对匮乏的问题,对其针叶转录组测序结果进行检测分析及引物开发,结果在针叶转录组数据中共检测到精确型SSR位点3 268个以及复合型SSR位点104个,序列长度为10~27 bp的短序列(2 954,93.36%)占主导地位;SSR重复单元的重复次数在4~30次之间,重复次数为9次的重复单元数量最多,所占比例最大(684,20.93%);在所有142个重复单元中,A/T所占比例最大(1 508,46.14%),其次为AT/CA(280,8.57%)和TA/TC(245,7.50%);从所设计的1 151对引物中,随机选择60对EST-SSR引物,对来自不同地区的50株白皮松优树进行PCR扩增,有28对引物能扩增出清晰的条带,有效扩增率为46.67%,其中多态性引物2对,引物多态率为7.14%,多态性信息含量PIC分别为0.375、0.305。为了检验引物的多态性,又选择了7对已发表的对白皮松基因型具有多态性的SSR引物进行验证分析,结果发现,这7对引物均能扩增出清晰的条带,但对50株白皮松优树均无多态性,也侧面说明了白皮松基因序列的相对保守性。该研究结果为白皮松种质资源评价、分子标记辅助育种等方面的研究提供了参考。(本文来源于《林业与生态科学》期刊2019年03期)

叶鹏,李显煌,唐军荣,李斌,张贵良[8](2019)在《云南金花茶转录组SSR的分布及其序列特征》一文中研究指出分析云南金花茶转录组中的SSR位点信息及其序列分布特征,为SSR引物的大量开发奠定前期基础。利用MISA软件分析了云南金花茶转录组数据155 011条Unigenes的SSR位点信息,在云南金花茶转录组中共检测到30 435个SSR位点,出现频率为19.63%,平均3.46 kb就出现1个SSR位点。而重复基元类型从二核苷酸到六核苷酸均有出现,其中二核苷酸重复基元为主要类型,占SSR总数的71.44%;其次是叁核苷酸,占SSR总数的25.48%;四核苷酸到六核苷酸仅占3.08%。AG/TC与CT/GA是二核苷酸的优势重复基元,分别占总基元的26.75%与25.17%;CTT/GAA与AGA/TCT是叁核苷酸的优势重复基元,分别占总数的2.64%与2.23%。根据云南金花茶转录组测序结果,云南金花茶转录组的SSR位点出现的频率较高,具有丰富的基元类型,并且有较高的重复次数,具有较高的多态性潜力。随机选出50对设计的SSR引物用于检测,其中有14对引物能扩增出清晰且单一的谱带。对云南金花茶转录组数据中SSR位点信息进行分析,可为其SSR引物的设计与筛选、SSR遗传多样性分析以及种质资源的保护提供理论依据。(本文来源于《中南林业科技大学学报》期刊2019年09期)

郑逢斌,周致丞,刘扬,左宪禹,朱文德[9](2019)在《基于MODIS的华北平原长时间序列气溶胶光学厚度时空分布特征研究》一文中研究指出本文利用Aqua/MODIS气溶胶光学厚度产品(Aerosol Optical Depth, AOD),从月均、季均及年均3个时间尺度,统计分析了近10 a(2006-2015年)华北平原AOD参数的空间分布特性及时间趋势变化.结果表明:从空间分布规律来看,高值区主要分布在河北省石家庄、邢台及邯郸沿线城市,沿山西省太原-临汾主线逐渐过渡到河南省郑州市,及山东省黄河以北及西南部及天津等地;需要注意的是,几乎在所有月份,山东省中心城市群AOD浓度要低于周围地区.对时间变化而言,AOD在6、7月份最大,11、12月份最小,夏季浓度高达1.6,明显高于其他3个季节;在10 a长时间变化序列中,从2006年开始呈缓慢下降,在2009年达到低谷,随后2年出现短暂的回升,从2011年起逐年下降,总体下降幅度达到17.14%.(本文来源于《河南大学学报(自然科学版)》期刊2019年04期)

刘华[10](2019)在《独立卡方分布序列的极限分布》一文中研究指出借助特征函数和连续性定理首次证明了当随机变量序列由任意独立不同的χ~2分布构成的独立随机变量序列满足中心极限定理,并且证明了当独立随机变量序列是由均匀分布和χ~2分布构成时,在一定的条件下,其极限分布也是标准正态分布。(本文来源于《荆楚理工学院学报》期刊2019年03期)

序列分布论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为系统地考察华北地区地震序列参数的分布特征,以期构建适合区域地震活动特征的短期概率预测模型和评估地震危险性,本文利用当前较为前沿的ETAS模型和R-J模型,采用连续滑动、多时段拟合的方式,对华北地区1970年以来的16个地震序列进行了参数拟合,并对参数的整体情况、参数之间的关系、参数与大地热流之间的关系等特征进行了分析研究.研究结果表明,主震发生后的早期阶段,地震序列参数变化相对较为剧烈,误差也较大;两种地震预测模型的序列参数呈现出一种优势分布特征,主要参数的平均值分别为αETAS=1.7404±0.3420,pETAS=0.9769±0.1396,aOML=-1.6638±0.5284,bOML=0.8312±0.1658,pOML=0.9053±0.1527,这与国际上其他区域的研究具有很强的一致性;大多数情况下,ETAS模型参数pETAS高于R-J模型参数pOML,平均偏高0.0716;序列参数αETAS与大地热流值整体上呈现一种负相关关系,激发次级余震的能力与大地热流具有一定的相关性.地震序列参数的分布特征以及与大地热流之间的关系对地震序列类型的判断,及基于地震序列参数构建定量化的短期概率预测模型,均有重要的应用价值.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

序列分布论文参考文献

[1].刘志高,王颖希,李甫,马原,焦章平.15个常染色体STR基因座在中国汉、藏、蒙、维、彝的序列分布差异[J].中国法医学杂志.2019

[2].毕金孟,蒋长胜.华北地区地震序列参数的分布特征[J].地球物理学报.2019

[3].叶鹏,李显煌,陈杰,瞿绍宏,董章宏.金铁锁转录组SSR的分布及其序列特征[J].云南农业大学学报(自然科学).2019

[4].莫忠妹,成宇,石甜,赵财.基于ITS序列西南地区不同居群薤白亲缘关系及其地理分布格局研究[J].西北植物学报.2019

[5].杜付玉,廖成水,郁川,张春杰,程相朝.sseK3基因在不同沙门菌中的分布与序列分析[C].中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第二十五次学术交流会、中国病理生理学会动物病理学专业委员会第二十四次学术研讨会、中国实验动物学会实验病理学专业委员会第四次学术研讨会、中国兽医病理学家第四次研讨会论文集.2019

[6].赵江南,周菊玲.正态分布序列变点识别问题探讨[J].统计与决策.2019

[7].李昕蔓,金卓颖,苏安然,杨林夕,苏晟.白皮松EST-SSR序列分布特征及引物开发[J].林业与生态科学.2019

[8].叶鹏,李显煌,唐军荣,李斌,张贵良.云南金花茶转录组SSR的分布及其序列特征[J].中南林业科技大学学报.2019

[9].郑逢斌,周致丞,刘扬,左宪禹,朱文德.基于MODIS的华北平原长时间序列气溶胶光学厚度时空分布特征研究[J].河南大学学报(自然科学版).2019

[10].刘华.独立卡方分布序列的极限分布[J].荆楚理工学院学报.2019

论文知识图

量化参数与模式的分布关系距离随邻域点个数变...对体外培养海马神经元网络的自发电信...一6a:72502站点气溶胶标高时间序列分抑制剂阻断草鱼TGF-β1下调头肾白...抑制剂阻断草鱼TGF-β1下调外周血...

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