应用Illumina高通量测序技术分析3种酒曲中微生物多样性

应用Illumina高通量测序技术分析3种酒曲中微生物多样性

论文摘要

为了解贵州花溪(酒曲A)、盘州(酒曲B)、安顺(酒曲C)3个地区的酒曲中微生物群落组成和多样性,运用高通量测序技术对酒曲中的细菌16S rDNA V3-V4区和真菌ITS1区进行测序,比较不同地区酒曲中微生物群落结构差异。测定不同地区酒曲的基本理化指标,与酒曲主要细菌种群进行相关性分析。结果显示,细菌获得129 510条有效序列,1 030个OTU;真菌获得60 945条有效序列,19个OTU。细菌的多样性分析表明,酒曲B中Shannon指数明显低于酒曲A和酒曲C,酒曲A和酒曲C的细菌群落结构更为接近。真菌的多样性分析表明,酒曲C中Shannon指数明显低于酒曲A和酒曲B,酒曲A和酒曲B的真菌群落结构更为接近。在门水平上,酒曲A的优势细菌门为变形菌门(Proteobacteria),优势真菌门为接合菌门(Zygomycota);酒曲B的优势细菌门为厚壁菌门(Firmicutes),优势真菌门为接合菌门;酒曲C的优势细菌门为变形菌门(Proteobacteria),优势真菌门为子囊菌门(Ascomycota)。在属水平上,酒曲A优势细菌属为红球菌属(Rhodococcus),酒曲C和酒曲B的优势细菌属均为芽孢杆菌属(Bacillus);酒曲A和酒曲B的优势真菌属为米根霉属(Rhizopus),而酒曲C的优势真菌属为酵母属(Saccharomyces)。不同地方来源的酒曲中的微生物组成及多样性在属和门水平上有明显差异;酒曲理化指标与酒曲细菌种群结构具有一定相关性。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 样品采集及前处理
  •     1.3.2 酒曲的理化指标检测
  •     1.3.3 DNA抽提和PCR扩增
  •     1.3.4 Illumina MiSeq测序
  •     1.3.5 数据处理
  •   1.4 数据分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 酒曲中基本理化性质分析
  •   2.2 酒曲中DNA提取与定量
  •   2.3 样品中细菌的分析
  •     2.3.1 细菌丰度和多样性分析
  •     2.3.2 细菌中微生物群落组成分析
  •     2.3.3 细菌微生物群落相似性分析
  •   2.4 样品中真菌的分析
  •     2.4.1 真菌的丰度和多样性分析
  •     2.4.2 真菌中微生物群落组成分析
  •     2.4.3 真菌微生物群落相似性分析
  •   2.5 典型关联分析 (canonical correlation analysis, CCA)
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 母应春,姜丽,苏伟

    关键词: 酒曲,微生物多样性,高通量测序技术,环境因子

    来源: 食品科学 2019年14期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 轻工业手工业

    单位: 贵州大学酿酒与食品工程学院

    基金: 国家自然科学基金地区科学基金项目(31860441)

    分类号: TS261.11

    页码: 115-122

    总页数: 8

    文件大小: 1574K

    下载量: 471

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