高通量测序技术对早熟棉中miRNA的鉴定与分析

论文摘要

棉花中miRNA的数量仍较少,miRNA在棉花早熟发育中的作用有待证明和揭示。为丰富棉花中miRNA的数量,同时,为揭示miRNA在早熟棉发育中的作用,以早熟棉花品种石早1和中熟棉花品种冀棉958为材料,利用高通量测序技术构建了2个小RNA文库,鉴定新的miRNA,比较早熟棉花和中熟棉花中miRNA表达的差异、特点。结果共鉴定到131个miRNA,包括41个不同家族的64个已知miRNA和67个新的miRNA;新miRNA中,54个miRNA属于已知miRNA家族,13个miRNA属于新的miRNA家族。比较2个品种中miRNA表达的差异,共发现39个miRNA在2个品种中的表达差异超过2倍,占总miRNA数的29. 8%,主要为中低量表达的miRNA。15个高表达miRNA中,只有miR398家族的ghr21在2个品种中的表达差异超过2倍（达到3. 4倍）;比较相同家族的不同miRNA在两品种中的表达差异,发现相同家族的miRNA在2个品种中表达差异可以不同,推测有不同的生物学功能。揭示了miRNA在早熟棉发育过程中,对其早熟性具有重要作用,为进一步研究miRNA在棉花早熟性调控中的作用提供依据。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 董章辉,朱青竹,赵丽芬,眭书祥,李增书,张艳丽,王虎,郭永召,姚则羊,赵国忠

关键词: 棉花,高通量测序,早熟

来源: 华北农学报 2019年S1期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 石家庄市农林科学研究院

基金: 国家棉花产业技术体系(CARS-15-27),河北省科技计划项目(16226303D-2),河北省现代农业产业技术体系(HBCT2018040206)

分类号: S562

页码: 15-21

总页数: 7

文件大小: 895K

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