人PRMT5基因的生物信息学分析

论文摘要

PRMT5 （Protein arginine methyltransferase 5）已经广泛地作为组蛋白甲基转移酶修饰H4R3、H2AR3和H3R8,从而潜在地影响多个信号传导途径。本研究为了对人PRMT5基因进行生物信息学方面的深入分析,以PRMT5基因序列及编码蛋白序列为材料,通过生物信息学方法分析了PRMT5基因的DNA序列、启动子及CpG岛、RNA结构,及该蛋白的理化性质、亚细胞定位、信号肽与跨膜区域、互作蛋白、系统发育等。研究结果表明,人PRMT5在物种间的保守性相对较高,位于染色体14q11.2,大小为1 911 bp,潜在核心启动子在1 014～1 064 bp,没有预测到CpG岛。PRMT5基因编码637个氨基酸残基,分子量为10 157 Da,等电点为5.88,不稳定系数是44.33;该蛋白更可能定位于细胞质,无明显的信号肽及跨膜结构;主要的二级结构元件是α-螺旋结构和无规卷曲,包含一个SAM-dependent MTase功能结构域,同时有10个可能的互作蛋白;进化分析表明黑猩猩和猕猴与人PRMT5蛋白亲缘关系最近。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 郭萍,任晨霞,麻丽霞,郭颖,曹文君

关键词: 基因,结构域功能,生物信息学分析

来源: 基因组学与应用生物学 2019年05期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学

单位: 长治医学院中心实验室

基金: 山西省基础研究计划(2015021185),长治医学院科研启动基金项目(普及项目)(QDZ201650)共同资助

分类号: Q811.4

DOI: 10.13417/j.gab.038.002259

页码: 2259-2264

总页数: 6

文件大小: 1713K

下载量: 359

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