从HSF1基因敲除小鼠心肌中筛选及克隆热休克反应中受HSF1调控的靶基因

从HSF1基因敲除小鼠心肌中筛选及克隆热休克反应中受HSF1调控的靶基因

刘瑛[1]2003年在《从HSF1基因敲除小鼠心肌中筛选及克隆热休克反应中受HSF1调控的靶基因》文中研究表明用cDNA芯片从热休克转录因子1(heat shock transcription factor 1,HSF1)基因敲除小鼠心肌组织中筛选热休克反应中受HSF1调控的靶基因,并对筛选到的未知基因进行分子克隆。方法:①用cDNA芯片检测热休克反应(42℃ 15分钟,恢复3小时)中HSF1~(-/-)小鼠心肌组织基因表达谱的改变(以HSF1~(+/+)小鼠为对照);②用RT-PCR对cDNA芯片筛选结果进行验证;③对差异表达的已命名基因进行启动子区HSF1结合位点的分析;④利用生物信息学方法对筛选到的未知基因进行分子克隆。结果:①共筛选到差异表达基因1142个;其中在HSF1~(-/-)小鼠心肌中表达下调的基因为398个,已命名基因为173个;在HSF1~(-/-)小鼠心肌中表达上调的基因为641个,已命名基因为235个。②在HSF1~(-/-)小鼠心肌中表达下调2.5倍的已命名基因中,有5个基因启动子区含有热休克元件(heat shock element,HSE);在HSF1~(-/-)小鼠心肌中表达上调2.5倍的已命名基因中,有5个基因启动子区含有HSE;③克隆并在GenBank上登录人XLHSRF-1基因(GenBank ID:AY221994)和大鼠XLHSRF-2基因(GenBank ID:AY248698)。结论:在热休克反应中,HSF1~(-/-)小鼠心肌中多个基因表达发生改变;在这些差异表达基因中,有10个基因启动子区含HSE元件,可能受HSF1直接调控;采用生物信息学方法,克隆了两个新的应激相关基因,为进一步研究这些基因的功能及其在应激反应中的作用奠定了基础。

刘瑛[2]2006年在《KLF4:一个热休克反应和热休克蛋白表达的新调控介质》文中提出热休克反应(heat shock response,HSR)是机体中普遍存在的一种应激反应。在热休克反应中,细胞内一组热休克蛋白(heat shock proteins,HSPs)诱导表达增加。HSPs作为重要的分子伴侣(molecular chaperone),具有帮助蛋白质的折迭与移位,防止蛋白质聚集,帮助变性蛋白质的解聚及复性,促进严重受损蛋白质的降解等功能。热休克时HSPs的诱导表达主要在转录水平受热休克因子1(heat shock factor 1,HSF1)的调控。在热休克反应中,HSF1被活化并从胞浆移位到细胞核,从转录水平激活HSPs的表达。除HSPs外,HSF1还能直接调控多种其它基因的表达。此外,采用HSF1基因敲除小鼠研究还发现HSF1在非活化状态下能够调控HSPs的组成型表达,但其机制目前尚不清楚。Kruppel样因子4(Kruppel-like factor 4,KLF4)是Sp1/KLF锌指转录因子家族的成员之一。作为一个核转录因子,它能够与下游基因启动子区的GC盒,CACCC盒和基础转录元件(basic transcription elements)叁种结合元件相结合,从而直接调控这些基因的表达。通过对下游基因表达的调控,KLF4在正常细胞的增殖和分化、胚胎发育以及肿瘤的发生发展过程中起着重要的作用。但是,KLF4与热休克反应、HSF1及HSPs之间有何关系,至今尚未见报道。为了探讨KLF4与热休克反应之间的关系,本研究第一部分采用RT-PCR和Western blot分别检测了KLF4 mRNA和蛋白质在热休克反应中的表达情况,结果发现热休克导致整体小鼠的多种组织以及多种离体培养细胞中KLF4的表达显着增加。根据上述结果,我们首次提出:KLF4可能是一个热休克反应相关基因。由于热休克反应中多个基因的表达都受到HSF1的调控,我们进一步采用HSF1基因敲除小鼠探讨了HSF1对KLF4 mRNA表达的可能影响,结果发现HSF1既可以促进KLF4的基础表达,又可以促进其在热休克时的诱导表达。此外,我们还在KLF4基因启动子区找到了HSF1结合元件(heat shock element,HSE)。由此可见,KLF4是HSF1调控的下游基因。HSPs是热休克反应中受HSF1直接调控的重要功能蛋白。作为热休克反应中表达增加的转录因子,KLF4对HSPs基因表达的可能影响引起了我们的关注。以前的研究发现,Sp1/KLF家族的某些成员既可以调控HSPs的组成型表达,又可以调控其在热休克时的诱导表达。因此,本研究第二部分首先构建了KLF4过表达细胞株,并采用反义寡核苷酸技术建立了内源性KLF4表达抑制的模型;接着分别采用RT-PCR和Western blot在mRNA和蛋白质水平检测了KLF4过表达和内源性KLF4表达抑制对小分子HSPs家族的αB晶状体蛋白和HSP25,HSP70家族的HSP72和HSP73以及HSP90家族的HSP84和HSP86的组成型表达和诱导表达的影响。结果发现,KLF4过表达能够上调上述HSPs的组成型表达,而KLF4表达抑制则下调上述HSPs的组成型表达;但KLF4过表达或表达抑制均不影响上述HSPs的诱导表达。为了进一步阐明KLF4调控α晶状体蛋白、HSP25和HSP84组成型表达的机制,本研究采用EMSA和荧光素酶报告基因方法进行了深入探讨。结果发现,KLF4能够通过其DNA结合结构域与α晶状体蛋白、HSP25和HSP84基因启动子区的KLF4结合元件相结合而直接促进其转录,从而维持其组成型表达。为了更全面地了解KLF4能够调节哪些HSPs的组成型表达,我们进一步采用cDNA芯片检测了KLF4过表达对HSPs基因表达的影响,结果发现有9个HSPs的组成型表达可能受到KLF4的调控。此外,本研究还发现热休克反应中KLF4与HSPs基因启动子的结合显着减少,这可能是热休克时KLF4对HSPs失去调控作用的主要原因。综上所述,本研究首次发现KLF4是一个受HSF1调控的热休克反应相关基因。KLF4的组成型表达及热休克导致的诱导表达均受到HSF1的调控。KLF4通过其DNA结合结构域与αB晶状体蛋白、HSP25及HSP84等基因启动子区的KLF4结合元件相结合而直接调控上述HSPs的组成型表达,即KLF4能够介导HSF1对HSPs组成型表达的促进作用。而热休克时,由于KLF4与HSPs基因启动子的结合减少而导致其失去对HSPs的调控作用。上述研究揭示了KLF4在HSPs表达调控方面的新功能,完善了HSPs的表达调控机制。有关KLF4在生理状态下及热休克反应和其它应激反应中的功能和生物学意义值得进一步深入研究。

参考文献:

[1]. 从HSF1基因敲除小鼠心肌中筛选及克隆热休克反应中受HSF1调控的靶基因[D]. 刘瑛. 中南大学. 2003

[2]. KLF4:一个热休克反应和热休克蛋白表达的新调控介质[D]. 刘瑛. 中南大学. 2006

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