论文摘要
微生物的细胞大小是其基本且重要的特征,理应作为细胞生理和生态学功能研究的重要参考因素。环境微生物细胞体积相差巨大,目前环境微生物学研究中采用的分子生态学技术基本忽略了微生物之间的细胞大小差异。本文以人体肠道细菌为研究对象,通过粒径分级过滤、细胞数量绝对定量并结合高通量测序技术对肠道细菌细胞大小与物种、基因组大小、rRNA基因拷贝数及其表达量等方面的分析,得出以下结论:(1)多个个体来源所获得的细胞大小鉴定结果呈现出高度一致性,表明本研究采用的方法可有效对大多数肠道微生物细菌同步实现粒径分级和物种鉴定;(2)在单基因(16S rRNA基因与rpoB基因)水平和基因组水平定义的细胞大小非常接近,对于相同物种其相对标准偏差在1.6%-1 8.5%范围;(3)16S rRNA序列相似度很高(>99%)的细菌间其细胞大小相近的概率较高,随着相似度的降低(99%-90%),细胞大小差异也随之增大;(4)伴随肠道微生物细胞大小的增加,细胞基因组大小、rRNA基因拷贝数及其表达等方面呈现出增高的趋势,暗示细胞大小与基因组演化与生理特征方面的潜在关联。综上,本研究首次探索肠道菌群细胞大小与物种分类、基因组特征等方面的相关性,研究结果将有助于补充现有微生物分子生态学研究中忽略细胞大小信息的不足,相关实验与分析方法可应用于其他环境菌群系统。
论文目录
文章来源
类型: 硕士论文
作者: 王磊
导师: 郭峰
关键词: 肠道细菌,细胞大小,微生物生态
来源: 厦门大学
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,基础医学
单位: 厦门大学
分类号: R37
总页数: 92
文件大小: 7159K
下载量: 37
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