导读:本文包含了系统发生关系论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:系统,线粒体,基因,基因组,脊索动物,发生关系,枪乌贼。
系统发生关系论文文献综述
陈楠桦,梁仁杰,白义,王海瑞[1]（2018）在《基于几何形态测量学的四种滨螺形态差异与系统发生关系研究》一文中研究指出运用几何形态测量学方法研究浙江省大陈岛海域常见的4种滨螺间的形态关系。对4种滨螺的壳口、螺体分别进行数字化标点,经迭印分析、主成分分析(PCA)和薄片样条法分析,获得4种滨螺在壳口和螺体上的差异,并进一步分析其形态特征与潮间带环境适应性关系。PCA结果表明四种滨螺壳口间差异在主成分轴上无法有效分开,而螺体间差异在主成分轴上能有效分开,说明壳口特征在不同滨螺间不具有规律性差异。螺体的PCA中PC1轴可以将短滨螺与其他3种滨螺区分,薄片样条法分析显示差异的部位主要在体螺层的宽度和螺体的高度间,PC2轴可以将粒结节滨螺与其他3种滨螺分开,薄片样条法分析显示差异部位主要是体螺层之上第一层以及体螺层之间。基于螺体特征的4种滨螺亲缘关系分析表明粗糙滨螺与塔结节滨螺亲缘关系最近,其次为短滨螺,粒结节滨螺最不相近。运用特征追踪法对螺层和螺肋特征追踪,结果表明螺层6层,螺肋密生是滨螺的祖先特征,后来演化出7层和8层的螺层特征以及颗粒状突起的螺肋特征。(本文来源于《海洋与湖沼》期刊2018年06期）
蔡昱婷,李沁,蒋敏,裘诗卉,张加勇[2]（2018）在《舟山川村陆蛙(Fejervarya kawamurai)的线粒体基因组结构和系统发生关系》一文中研究指出川村陆蛙是泽陆蛙的一种复合种,其分布区遍布印度到日本等东南亚地区。泽陆蛙在中国自南向北均有分布,且分布范围广,面积大,但我国有关泽陆蛙及其复合种之间的研究相对较少,对于其分类地位一直存在争议。本研究通过普通PCR技术测定泽陆蛙和川村陆蛙的粒体基因组全序列,利用MITOS WebServer来确定线粒体基因结构和排列方式,用tRNAscan-SE构建tRNA的叁叶草结构,用RaxML程序和MrBayes 3.1.2程序进行ML和BI分析,构建系统发育树。川村陆蛙线粒体基因组基因排列方式总体上和泽陆蛙相同,均存在典型的两个tRNA-Met基因。同时tRNA-Thr/tRNA-Pro/tRNA-Leu移位到tRNA-Phe上游,而ND5基因则移位到了控制区和tRNA-TPLF基因簇之间。但是在舟山川村陆蛙和部分福建样本的线粒体基因组排列中还发现,在tRNA-His和tRNA-Ser基因后面存在不同程度的tRNA-Ser或tRNA-Leu基因的重复。tRNA-Ser或tRNA-Leu基因均为残基,且序列组成的相似度高。当反密码子环从TCT突变为TTT时,tRNA-Ser变为tRNA-Leu。构建的系统发育树显示泽陆蛙及其复合种可以分为两大支系,分别是广西、广东、贵州以及舟山群岛等地聚为一支,其组内遗传距离范围为0.001-0.039,平均遗传距离为0.017,这表明川村陆蛙在系统发育上和中国东南和南部沿海地区的泽陆蛙关系较近,这可能是由于舟山岛屿上的川村陆蛙沿福建古大陆架进行扩散而形成的。(本文来源于《浙江省动物学会第十叁次会员代表大会暨学术研讨会论文摘要集》期刊2018-11-10）
陈尧[3]（2018）在《脊索动物叁亚门系统发生关系研究进展》一文中研究指出本文对脊索动物叁亚门系统发生的关系进行研究,通过这个领域的历史发展情况和现状来进行综合的表述,这样能够让大家更加全面的了解脊索动物进化以及脊椎动物发生的过程,以此来推动我国生物领域的丰富化发展。(本文来源于《家庭生活指南》期刊2018年09期）
李丹丹,李娟,张春龙,徐汝聪,吕东[4]（2018）在《拟南芥、水稻SUTs基因及其上游序列的系统发生关系》一文中研究指出【目的】对拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)SUTs家族的基因及其上游区的序列进行了核酸组成和系统发生关系的分析,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考。【方法】利用邻近法和基因结构分析,解析SUTs基因及其上游序列的系统发生关系。【结果】水稻SUTs基因及其上游区的GC含量都明显高于拟南芥;拟南芥和水稻SUTs基因的序列长度与GC含量呈明显负相关,其基因结构分类与邻近法分类相一致,都可分为3个亚族;拟南芥SUCs上游区的序列长度与其GC含量的相关性不明显,而水稻的SUTs上游区序列长度与其GC含量有较弱的负相关性。此外,拟南芥4个SUC基因(At SUC6~9)上游序列的系统发生关系与基因序列的系统发生完全一致,但其他的At SUCs和Os SUTs基因的上游序列系统发生关系与基因序列的系统发生关系并不一致。【结论】SUTs基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守,而其上游序列在进化过程变化较大,揭示了SUTs基因调控序列的复杂性。(本文来源于《云南农业大学学报(自然科学)》期刊2018年03期）
江波[5]（2018）在《鸫属九种鸟线粒体基因组全序列比较及系统发生关系》一文中研究指出鸫属是雀形目鸟类中最大的属之一,且分布范围广泛。但是鸫属属内种间的分子系统发育研究目前仍不明确。本文对白颈鸫、灰头鸫以及棕背黑头鸫的线粒体基因组全序列进行了测定,并对叁种鸟类的基因排布进行了定位。同时与从GeneBank下载的斑鸫、灰背鸫、乌鸫、旅鸫、欧歌鸫、棕腹鸫的线粒体基因全序列进行了比较。结果表明,九种鸫属鸟线粒体基因组结构全部为双链闭合环状DNA分子,除欧歌鸫外,其他八种鸫属鸟编码37个基因和一个非编码区,欧歌鸫存在基因组增大现象,含有40个编码基因和两个非编码区。以九种鸫属鸟全序列做贝叶斯和最大似然数分析,结果表明基于这两种方法构建的系统发生树拓扑结构是一致的:1、在九种鸫属鸟中,欧歌鸫处于树的基部,是相对其他八种鸫属鸟最早分化出来的物种;2、旅鸫和棕腹鸫聚为一个亚枝互为姊妹种;3、灰头鸫与白颈鸫互为姊妹种而后与斑鸫、棕背黑头鸫及灰背鸫聚为一枝;4、乌鸫的系统发生地位在两种系统发生树中有差异。以白颈鸫、灰头鸫以及棕背黑头鸫和自GeneBank上下载其他56种鸫属鸟类的12S rRNA和Cytb基因的串联序列做贝叶斯和最大似然数分析,结果表明:1、相对其它八种鸫属鸟欧歌鸫仍然处于根部;2、旅鸫与乌鸲鸫互为姊妹种;3、灰背鸫与乌灰鸫互为姊妹种而后与黑胸鸫和蒂氏鸫聚为一枝;4、斑鸫与赤颈鸫互为姊妹种,而后与环颈鸫聚为一枝;5、灰头鸫与白颈鸫互为姊妹种;6、棕背黑头鸫与白头鸫在一个支系,关系较近;7、棕腹鸫与褐背鸫互为姊妹种;8、乌鸫位置在两树之间存在差异仍不能确定,有待进一步研究。对鸫属九种鸟类的16个基因(包括13个PCGS,2个rRNA基因合一个D-loop区)单基因的可靠性进行分析,结果表明:16S rRNA和ND4两个基因在鸫属鸟系统发生树构建中可靠性较高。为了更精确的理解鸫属鸟之间的分类和系统发生关系,之后的研究中仍需增加样本的数量与序列的长度,并且要注意方法的标准化。(本文来源于《兰州大学》期刊2018-05-01）
康立森[6]（2018）在《基于mtDNA全基因组探究枪乌贼科的系统发生关系》一文中研究指出本研究首次测定了枪贼科六种乌贼,包括中国乌贼(Uroteuthis chinensis)、日本枪乌贼(Loliolus jaPoonica)、尤氏小枪乌贼(Loliolus uyii)以杜氏枪乌贼(Uroteuthis duvauceli)、乳光枪乌贼(Doryteuthis.opalescens)以及火枪乌贼(Loliolus Beka)的线粒体基因组全序列。对六种枪乌贼功能基因进行注释与特征分析。最后分别用16S RNA、control region以及全基因组序列通过ML法构建系统发育树来分析9种枪乌贼的系统发育关系,为枪乌贼科的分类及进化提供分子水平的依据。主要研究结果如下:1.本研究扩增所得的枪乌贼线粒体基因组全长范围介于17134-17485bp之间,6种枪乌贼科乌贼基因排列顺序相同,长度比较一致。六种枪乌贼均由13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因以及3个非编码区组成。6种枪乌贼包含有两种rRNA,分别是16SrRNA和12SrRNA。其中16SrRNA位于 tRAIle与 tRNAVal 之间,12SrRNA 位于 tRNAVal 与 tRNATrp之间。2.六种枪乌贼均存在基因间隔与基因重迭区域,基因间隔最短的1bp,最长达410bp,基因重迭最短1bp,最长达29bp。在碱基含量方面,六种枪乌贼的A碱基在40%左右,T碱基在31%左右,C碱基在18%左右,G碱基在7-11%之间,A+T%的含量71-72%之间,表现出明显的AT偏向性,与枪乌贼科其它物种的特征一致。枪乌贼的蛋白编码基因的核苷酸序列长度从11193到11223bp,分别占基因组长度的65.326%及65.208%,编码蛋白可以分为两个类型:COX3,ND2,COX1,COX2,ATP8,ATP6,ND4 以及 ND3 落在轻链上,ND1,ND5,ND4L,CYTB,ND6落在重链上。CYTB,ND1,ND5,ND4L以及ND6以ATG作为起始密码子,而ND4以TAT作为终止子,COX3,ND2,COX1,COX2,ND3以及ATP6以TAA作为终止密码子,Cytb,ND6,ND1,ND5以作为终止密码子,而ND4以及ND4L使用CTA作为密码子,ATP8以TAG作为终止密码子。基因间还存在着序列重复现象,NAD2以及COI重复了 29对碱基。ND4L和ND4重复了7碱基,tRNAHis以及tRNALeu重复了 3碱基。3.六种乌贼均包含叁个几乎完全相同非编码区(也被称为控制区)。总长度为1409bp到1570bp,六者相似度为66.62%。推测此区域的长短可能是造成六种乌贼线粒体基因组全序列长度差异的主要原因。4.基于线粒体全基因组序列和16SRNA基因构建进化树,结果比较一致。结果显示,本研究中六种枪乌贼的分支分类情况与传统形态学分类比较一致,而其它学者分类结果存在分歧。都支持枪乌贼共分为两大支,进化树中中国枪乌贼与剑尖枪乌贼聚为一支,日本枪乌贼、火枪乌贼以及尤氏枪乌贼聚为一支,莱氏拟乌贼处于该系统进化树的底部。莱氏拟乌贼及剑尖枪乌贼的分类状况仍存在争议,笔者推测在枪乌贼科内可能还存在一个未知的属或亚属。本研究首次测定了中国枪乌贼、日本枪乌贼、尤氏小枪乌贼、杜氏枪乌贼、乳光枪乌贼以及火枪乌贼的线粒体基因组全序列,并对其进行了基因注释以及基因结构和特征的分析,进一步丰富了 NCBI的基因组数据库,并引入线粒体全基因组序列来分析枪乌贼科的系统进化关系,将为头足纲更高阶元的系统发生学研究奠定良好的基础。(本文来源于《浙江海洋大学》期刊2018-04-01）
高澎夏[7]（2018）在《基于Cytb基因的部分序列对亚洲14种猫科动物系统发生关系与现行分类合理性分析》一文中研究指出传统猫科动物分类多基于形态学证据,为探讨现行的分类体系的合理性,本研究对14种猫科动物(其中10种在中国有分布)的细胞色素b(Cytb)基因的部分序列(约1201bp)进行了比对与分析,并利用MEGA 7.0软件内置的"邻接法"和"最大简约法"两种模型基于比对的序列构建了系统发育树。分析数据表明,在所选取的Cytb基因序列中,共有780个变异位点,占总位点数的64.9%,简约信息位点717个,占总位点数的59.7%。构建的系统发育树显示,雪豹(Panthera uncia)、金钱豹(Panthera pardus)、狮(Panthera Leo)、虎(Panthera tigris)聚为一支,支持划分为豹属(Panthera);而沙丘猫(Felis margarita),中国特有的荒漠猫(Felis slivestris bieti)以及亚洲野猫(Felis silvestris)聚为一支,支持将其划分为猫属(Felis);其他几种猫科动物在该段序列上比较独特,如猞猁,与其他猫科动物亲缘关系较远,支持独立为猞猁属(Lynx);而兔狲的情况与猞猁类似,与其他的猫科动物均不易聚为一支,支持将兔狲划为兔狲属(Otocolobus)而非猫属。(本文来源于《现代医学与健康研究电子杂志》期刊2018年02期）
钟婧[8]（2018）在《脊索动物叁亚门系统发生关系研究进展》一文中研究指出本文将对该领域的历史和现状进行综述,以期更好地了解脊索动物进化以及脊椎动物发生的过程。(本文来源于《科学咨询(科技·管理)》期刊2018年02期）
石庆会,张桂清,韦中学,吴楠,张严[9]（2017）在《基于线粒体多基因串联序列的蚬蝶类系统发生关系分析》一文中研究指出测定了蚬蝶类两个代表种(波蚬蝶、银纹尾蚬蝶)的线粒体基因16S r RNA、Cytb、COI、COIII的部分序列。同时,结合Gen Bank数据库中已公布的其他蝶类52个代表种相应的基因序列,选取蛾类2个代表种作为外类群。基于这4个基因的串联序列,分别使用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯推论法重新构建了蝶类的分子系统树,分析了蚬蝶类的系统发生关系。序列分析结果显示:经比对处理后串联序列共有4784个同源位点,其中保守位点2113个,变异位点2669个,简约信息位点2149个;A+T平均含量为76.8%,具有明显的AT偏倚性。分子系统树表明:蚬蝶类形成一个单系群,并与灰蝶科形成姊妹群,结果进一步表明蚬蝶类与灰蝶科具有较近的亲缘关系,但能否归入灰蝶科还有待于进一步的论证。(本文来源于《叁明学院学报》期刊2017年06期）
杨巧梅[10]（2017）在《基于cpDNA和nDNA多基因位点序列研究大豆属物种的系统发生关系》一文中研究指出本研究选取了来自国内外具有一定代表性的Soja亚属和Glycine亚属共16个种81份材料,通过利用实验室前期的已测序数据和数据库中的大豆重测序数据,对野生大豆和栽培大豆中均未发现变异位点的基因进行筛选,以期挖掘出新的适用于大豆属系统发育研究的核基因;同时结合文献中挑选的基因序列信息,重构大豆属的系统发育树,为后续对大豆属进行近一步的研究奠定基础。主要结果如下:1、本文共挑选了14个基因片段,其中从文献中挑选了4个cpDNA片段,3个nDNA片段;从实验室数据和重测序数据中,筛选出7个新的引物通性较高、变异速率适中(约10%)、易装配的低拷贝的核基因片段。2、4个cpDNA片段,测序长度共2068bp,SNP位点95个,θ值0.00925,π值0.01100;3个nDNA片段,测序长度共1074bp,SNP位点170个,θ值0.03188,π值0.03223;7个新的nDNA片段,测序长度共2567bp,SNP位点258个,θ值0.02024,π值0.01705。3、对大豆属各种内遗传多样性进行分析,不同物种的遗传多样性差异较大。其中G.can、G.cla、G.tab、G.tom四个种的π值和θ值相对较高,并且G.tab的π值和θ值明显高出其它种,说明其种内差异较大。4、对大豆属进行系统发育分析,大豆属被分为黄豆亚属和大豆亚属两个大支;大豆亚属内又被划分为3个主要的分支。该研究结果在大支的划分上与前人的研究结果相一致。单独基于不同类型的基因数据进行建树分析,结果表明分别基于叶绿体基因与核基因构建的系统发育树在Glycine亚属内的划分明显不同。5、单独基于叶绿体基因与核基因构建的系统发育树中,G.tabacina均被划分为两组,一组是来自国内的品种G.tab 6-G.tab 10(2n=80),一组是来自澳大利亚的品种G.tab 1-G.tab 5(2n=40)。推测可能是由于四倍体的G.tabacina(2n=80)是古多倍体复合体,与二倍体G.tabacina之间的遗传差异较大。另一方面,由于种群间的遗传分化与地理距离有一定的相关性,因此长期的环境和地理隔离,也可能加剧了它们之间的遗传分化。(本文来源于《南昌大学》期刊2017-06-30）
系统发生关系论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
川村陆蛙是泽陆蛙的一种复合种,其分布区遍布印度到日本等东南亚地区。泽陆蛙在中国自南向北均有分布,且分布范围广,面积大,但我国有关泽陆蛙及其复合种之间的研究相对较少,对于其分类地位一直存在争议。本研究通过普通PCR技术测定泽陆蛙和川村陆蛙的粒体基因组全序列,利用MITOS WebServer来确定线粒体基因结构和排列方式,用tRNAscan-SE构建tRNA的叁叶草结构,用RaxML程序和MrBayes 3.1.2程序进行ML和BI分析,构建系统发育树。川村陆蛙线粒体基因组基因排列方式总体上和泽陆蛙相同,均存在典型的两个tRNA-Met基因。同时tRNA-Thr/tRNA-Pro/tRNA-Leu移位到tRNA-Phe上游,而ND5基因则移位到了控制区和tRNA-TPLF基因簇之间。但是在舟山川村陆蛙和部分福建样本的线粒体基因组排列中还发现,在tRNA-His和tRNA-Ser基因后面存在不同程度的tRNA-Ser或tRNA-Leu基因的重复。tRNA-Ser或tRNA-Leu基因均为残基,且序列组成的相似度高。当反密码子环从TCT突变为TTT时,tRNA-Ser变为tRNA-Leu。构建的系统发育树显示泽陆蛙及其复合种可以分为两大支系,分别是广西、广东、贵州以及舟山群岛等地聚为一支,其组内遗传距离范围为0.001-0.039,平均遗传距离为0.017,这表明川村陆蛙在系统发育上和中国东南和南部沿海地区的泽陆蛙关系较近,这可能是由于舟山岛屿上的川村陆蛙沿福建古大陆架进行扩散而形成的。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
系统发生关系论文参考文献
[1].陈楠桦,梁仁杰,白义,王海瑞.基于几何形态测量学的四种滨螺形态差异与系统发生关系研究[J].海洋与湖沼.2018
[2].蔡昱婷,李沁,蒋敏,裘诗卉,张加勇.舟山川村陆蛙(Fejervaryakawamurai)的线粒体基因组结构和系统发生关系[C].浙江省动物学会第十叁次会员代表大会暨学术研讨会论文摘要集.2018
[3].陈尧.脊索动物叁亚门系统发生关系研究进展[J].家庭生活指南.2018
[4].李丹丹,李娟,张春龙,徐汝聪,吕东.拟南芥、水稻SUTs基因及其上游序列的系统发生关系[J].云南农业大学学报(自然科学).2018
[5].江波.鸫属九种鸟线粒体基因组全序列比较及系统发生关系[D].兰州大学.2018
[6].康立森.基于mtDNA全基因组探究枪乌贼科的系统发生关系[D].浙江海洋大学.2018
[7].高澎夏.基于Cytb基因的部分序列对亚洲14种猫科动物系统发生关系与现行分类合理性分析[J].现代医学与健康研究电子杂志.2018
[8].钟婧.脊索动物叁亚门系统发生关系研究进展[J].科学咨询(科技·管理).2018
[9].石庆会,张桂清,韦中学,吴楠,张严.基于线粒体多基因串联序列的蚬蝶类系统发生关系分析[J].叁明学院学报.2017
[10].杨巧梅.基于cpDNA和nDNA多基因位点序列研究大豆属物种的系统发生关系[D].南昌大学.2017
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