辐射杂种板论文_林丽

导读:本文包含了辐射杂种板论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:基因,杂种,染色体,论文,SDHD,RalGDS,SNP。

辐射杂种板论文文献综述

林丽[1](2004)在《猪五个基因的分离、辐射杂种板定位及其与经济性状的关联分析》一文中研究指出分子生物学的诞生及其在猪育种中的应用,为猪遗传育种提供了新的契机。猪高密度基因图谱的建立、对基因的结构、功能以及基因与性状关系等的充分了解,是未来动物分子育种的主要依据。生物信息学的发展和大量公共数据库的共享,为分离、定位基因提供了新的思路。本论文根据猪EST信息和比较基因组策略,分离鉴定了猪的五个基因,取得了如下的结果: 1.依据人cDNA信息获得的猪EST所构建的EST重迭群设计的猪特异引物,从湖北白猪基因组中分离克隆了五个猪基因片段。将其中分离的叁个醛缩酶同工酶基因(ALDOA、ALDOB和ALDOC)片段提交GenBank数据库,获GenBank收录号,分别为AY359812、AY359813和AY359811。分离的其余两个基因为硒蛋白P基因(SEPP1)和CT120膜蛋白基因(CT120)。并经过同源序列鉴定,发现预测的ALDOA、ALDOB、ALDOC、SEPP1和CT120外显子部分与相应的人的cDNA核苷酸序列的相似性分别为93%、92%、93%、88%和86%。将这些分离的片段鉴定为猪的ALDOA、ALDOB、ALDOC、SEPP1和CT120基因片段。 2.利用辐射杂种板技术对五个基因进行了染色体精细定位。这五个基因均与猪第一张全基因组辐射杂种图谱的标记紧密连锁(LOD>6)。ALDOA基因与SW1443紧密连锁(LOD=6.12),ALDOB基因与SSC1F12紧密连锁(LOD=17.58),ALDOC基因与SWC23紧密连锁(LOD=10.8),SEPP1基因与S0077紧密连锁(LOD=8.85),CT120基因与S0106紧密连锁(LOD=11.06)。 3.在分离的SEPP1基因中发现了第2内含子的KpnI—RFLP(T-G)和VspI—RFLP(T-C)多态位点;在分离的CT120基因中发现了第4内含子的MspI—RFLP(A-G)多态位点。采用PCR—RFLP分析技术,检测了不同群体中SEPP1基因2个位点和CT120基因1个位点的多态性,计算了3个位点的基因型频率和基因频率,分析了各基因型在不同猪群中的分布差异。 4.在长白(?)×(大白×通城)♀和大白(?)×(长白×通城)早的上下代个体中分析了SEPP1的KpnI—RFLP和CT120的MspI—RFLP位点的遗传方式,结果表明均呈共显性遗传方式。 5.在本室与通城县畜牧局种畜场合作所建立的试验群体(含通城、长大通、大长通、长白和大白猪群)中分析了CT120第4内含子MspI—RFLP位点的多态性,利用SAS8.2中的一般线性模型程序分析了CT120基因与部分免疫性状和生产性状华中农业大学2004届硕士学位论文的关联,初步研究的结果发现该基因第4内含子的人试,I一”LP位点与平均背膘厚极显着相关(P<0.01),最小二乘均数的两两比较发现AA等位基因型个体的平均背膘厚比GG型低,达到极显着水平(P<0.01),AA等位基因型个体的平均背膘厚也显着低于AG型(P<0.05)。 6.以鄂西黑猪的肝、肺、’肾、脾和心脏组织作为研究材料,利用半定量Rl’- PCR研究猪义护尸了基因在各组织的表达谱和表达规律,结果发现该基因在这上述五种组织中均表达,但在肝中的表达丰度最高。(本文来源于《华中农业大学》期刊2004-05-01)

张金标[2](2004)在《猪琥珀酸脱氢酶D亚基基因的单核苷酸多态性检测、表达谱研究、辐射杂种板定位及性状关联分析》一文中研究指出养猪业是畜牧业的一个重要产业,通过分子遗传学途径对猪的遗传机理进行研究可加深对猪基因的结构、功能及与性状关系等的了解,推动动物育种理论的发展以及为猪育种工作提供更多的可作为标记辅助选择(marker assisted selection,MAS)的候选基因。 本研究主要对猪琥珀酸脱氢酶D亚基(succinate dehydrogenase complex,subunit D,SDHD)基因第四外显子中的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)进行检测,并在通城试验猪群中进行突变位点与性状的关联分析,利用辐射杂种板对该基因进行染色体定位以及对该基因的表达谱研究。取得以下研究结果: 1.以猪胚胎期骨骼肌cDNA文库测序获得的猪SDHD基因cDNA序列设计特异引物,分离该基因第四外显子中部分片段: 2.对所分离的基因片段进行SSCP检测,挑选不同的SSCP纯合型的具有代表性的个体进行PCR产物测序,发现在SDHD基因Exon4中的CDS区存在两个SNP位点,两个SNP位点中有一个引起了氨基酸的改变,但无内切酶位点,另一个SNP位点的突变为同义突变,存在一个MboI酶切位点; 3.在无亲缘相关群体中分别进行SSCP检测和使用MboI进行RFLP检测,并对各自的基因型进行了基因频率计算和基因在群体中分布的显着性检验,结果表明:基因频率和基因型频率在不同猪品种中的分布存在不同的差异显着性; 4.在通城试验猪群中进行RFLP检测,将RFLP基因型与该试验猪群中的部分性状进行了关联分析,发现猪SDHD基因MboI酶切位点的SNP与眼肌面积显着相关(P=0.0067),与肌肉大理石纹的相关接近显着(P=0.0614); 5.以通城猪和鄂西黑猪的肾、心、脾、肺、肝五个组织进行该基因的表达谱研究,结果表明该基因在所检测的各个组织中均有表达。 6.利用辐射杂种板将猪SDHD基因定位在猪染色体9p21。(本文来源于《华中农业大学》期刊2004-05-01)

郑其平,余龙,赵勇,孙喜元,戴方彦[3](2000)在《利用辐射杂种板(GB4)精细定位人类新基因H-RalGDS于染色体9q34.1》一文中研究指出目的 HRalGDS基因是我们新近分离与克隆的人类新的Ras相关基因,是鼠Ral鸟嘌呤核苷酸解离刺激因子(RalGDS)在人类的同源基因。利用辐射杂种板(radiationhybrid,RH)制图法进行该基因的精细定位。方法 根据HRalGDS基因cDNA的3′不翻译区设计正反向引物,PCR扩增人鼠辐射体细胞杂种板(radiationhybridGenebridge4panel),并将杂种板每一细胞株的PCR结果按一定方式统计后输入WIMITRadiationHybridMapper的相关网址,进行HRalGDS基因的RH制图和整合分析。结果RH制图将HRalGDS基因定位在9号染色体的骨架图上。定位附近的Marker顺序为9pter——WI6083——HRalGDSWI1405——9qter,经文献检索及进一步与物理图、遗传连锁图及细胞学图谱的整合分析,将其精细定位于染色体9q34.1区带的基因位标SURF5与RPL7A之间。结论 HRalGDS基因的定位不仅有助于人染色体9q34区带的精细基因图与细胞遗传图的构建,而且也表明用RH制图法定位于人类新基因既简便、易行、可靠,又可为丰富染色体上的基因定位提供新的信息。(本文来源于《中华医学遗传学杂志》期刊2000年01期)

辐射杂种板论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

养猪业是畜牧业的一个重要产业,通过分子遗传学途径对猪的遗传机理进行研究可加深对猪基因的结构、功能及与性状关系等的了解,推动动物育种理论的发展以及为猪育种工作提供更多的可作为标记辅助选择(marker assisted selection,MAS)的候选基因。 本研究主要对猪琥珀酸脱氢酶D亚基(succinate dehydrogenase complex,subunit D,SDHD)基因第四外显子中的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)进行检测,并在通城试验猪群中进行突变位点与性状的关联分析,利用辐射杂种板对该基因进行染色体定位以及对该基因的表达谱研究。取得以下研究结果: 1.以猪胚胎期骨骼肌cDNA文库测序获得的猪SDHD基因cDNA序列设计特异引物,分离该基因第四外显子中部分片段: 2.对所分离的基因片段进行SSCP检测,挑选不同的SSCP纯合型的具有代表性的个体进行PCR产物测序,发现在SDHD基因Exon4中的CDS区存在两个SNP位点,两个SNP位点中有一个引起了氨基酸的改变,但无内切酶位点,另一个SNP位点的突变为同义突变,存在一个MboI酶切位点; 3.在无亲缘相关群体中分别进行SSCP检测和使用MboI进行RFLP检测,并对各自的基因型进行了基因频率计算和基因在群体中分布的显着性检验,结果表明:基因频率和基因型频率在不同猪品种中的分布存在不同的差异显着性; 4.在通城试验猪群中进行RFLP检测,将RFLP基因型与该试验猪群中的部分性状进行了关联分析,发现猪SDHD基因MboI酶切位点的SNP与眼肌面积显着相关(P=0.0067),与肌肉大理石纹的相关接近显着(P=0.0614); 5.以通城猪和鄂西黑猪的肾、心、脾、肺、肝五个组织进行该基因的表达谱研究,结果表明该基因在所检测的各个组织中均有表达。 6.利用辐射杂种板将猪SDHD基因定位在猪染色体9p21。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

辐射杂种板论文参考文献

[1].林丽.猪五个基因的分离、辐射杂种板定位及其与经济性状的关联分析[D].华中农业大学.2004

[2].张金标.猪琥珀酸脱氢酶D亚基基因的单核苷酸多态性检测、表达谱研究、辐射杂种板定位及性状关联分析[D].华中农业大学.2004

[3].郑其平,余龙,赵勇,孙喜元,戴方彦.利用辐射杂种板(GB4)精细定位人类新基因H-RalGDS于染色体9q34.1[J].中华医学遗传学杂志.2000

论文知识图

利用猪辐射杂种板对猪SlDOA8...猪一仓鼠辐射杂种板定位结果电泳...猪为陈义1基因辐射杂种板定位...辐射杂种板PCR数据在线分析结果4 辐射杂种克隆板扩增 118 个样品结果(...一,猪以J基因RH定位结果图

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