导读:本文包含了密码子用法论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:密码子,基因,叶绿体,家蚕,噬菌体,自然选择,染色体。
密码子用法论文文献综述
张琦,焦翔,刘香健,张月,张素芳[1]（2018）在《圆红冬孢酵母的密码子用法分析》一文中研究指出运用CodonW等软件,分析了圆红冬孢酵母Rhodosporidium toruloides基因组中191个蛋白质编码基因的密码子使用模式,包括密码子3个位置上的GC含量、有效密码子数和密码子使用频率。圆红冬孢酵母有效密码子数ENc值为38.9,密码子GC含量为63%,密码子第叁位GC含量为78.3%,且偏好使用G或C结尾的密码子,确定了圆红冬孢酵母R. toruloides的21个高表达优越密码子。研究发现,圆红冬孢酵母与毕赤酵母、酿酒酵母、大肠杆菌和拟南芥在密码子使用频率上有较大差异,而与解脂耶氏酵母和果蝇差异相对较小。研究结果对提高外源基因在圆红冬孢酵母中表达效率及相关代谢工程和合成生物学研究有一定意义。(本文来源于《菌物学报》期刊2018年11期）
张欣,尤宏争,李荣妮,朱莉飞,李文通[2]（2017）在《金鱼密码子用法特点分析》一文中研究指出不同物种间的同义密码子使用偏性存在差异,开展密码子偏好性研究可深入了解基因表达特征,为分子育种提供依据。利用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术获得金鱼的转录组数据,筛选符合条件的编码基因序列(Coding DNAsequence,简称CDS),并通过Codon W软件和CUSP程序对金鱼蛋白质编码基因序列进行了分析,获得编码氨基酸的密码子使用频率,并与人、酵母、大肠杆菌、果蝇、斑马鱼等不同种类的模式生物进行比较。结果表明,金鱼8 143个基因在64个密码子中有28种偏爱密码子,有效密码子数为54.9,3个位置的平均GC含量为0.509,第3位密码子GC百分含量为0.564,金鱼偏向使用G或C结尾的密码子。金鱼密码子偏好性与模式生物有不同程度的差异,与酵母密码子使用频率差异最大,与斑马鱼的密码子偏好性一致。(本文来源于《华北农学报》期刊2017年S1期）
傅建敏,索玉静,刘慧敏,谭晓风[3]（2017）在《柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法》一文中研究指出为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密码子数在49.58~50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36~59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾。(本文来源于《经济林研究》期刊2017年02期）
王晖,高妍夏,杨帆,苏萌,张东豪[4]（2017）在《家蚕cyp450基因家族密码子的用法分析》一文中研究指出为了研究家蚕cyp450基因家族的密码子用法及影响密码子使用模式的主要因子,试验采用多种软件分析家蚕cyp450基因家族的碱基组成、序列同源性、密码子偏好性,得到统计cyp450基因家族密码子使用偏好性的各项参数,并对各项指数进行相关性分析。结果表明:家蚕cyp450基因家族位于AT丰度高的基因组区域,倾向于使用富含A、T且A、T结尾的密码子,整个基因组的同义密码子使用偏好性较弱;cyp450基因家族的序列同源性很低,大多数值在40%左右。突变压力在密码子的叁个位置作用程度相关性不显着。说明自然选择引起的碱基组成变化在家蚕cyp450基因家族密码子使用中起主要作用。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2017年07期）
孙虎芝,任慧英,张灿[5]（2015）在《噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38密码子用法及偏性分析》一文中研究指出为了解噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38的密码子使用特征,利用生物信息学方法对1株临床分离的多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38与其他5株T4类噬菌体进行密码子用法的分析比较。结果发现,Bp7尾丝蛋白gp38与其他5株T4类噬菌体密码子的使用模式差别大,Bp7尾丝蛋白gp38偏好于以C结尾的密码子,而其余5株噬菌体偏好A或U结尾;除了AUG(Met)和UGG(Trp)外,还确定了Bp7尾丝蛋白gp38使用的25种高频密码子;通过6株噬菌体gp38的密码子偏性比较发现,Bp7与任何一株噬菌体都存在较大差异;聚类分析的结果也表明,Bp7尾丝蛋白gp38与其余5株噬菌体不属于一类。总体上,噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38在密码子使用上比较特殊,gp38基因密码子的分析将为进一步研究噬菌体Bp7的感染机制及扩宽其裂解谱奠定基础。(本文来源于《动物医学进展》期刊2015年07期）
王樟凤,柴学文,彭武林,黄润红,饶友生[6]（2013）在《珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体基因表达的密码子用法》一文中研究指出从EMBL数据库下载珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体全部基因的cDNA序列,共有610个基因的CDS序列纳入统计分析。使用CodonW(1.4.2)对CDS序列进行密码子偏性研究,确定了UUC、CUC、CUG等28个密码子为珍珠鸟Z染色体基因表达的"最优"密码子。对应分析表明,影响珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子用法的主要因素分别为GC3s(同义密码子第3位的G C频率)、CDS的GC含量以及基因的表达水平。据此推论,珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子偏性是核苷酸组成和选择等因素综合作用的结果。(本文来源于《江西农业大学学报》期刊2013年06期）
逯凯,张灿,刘文华,邹玲,任慧英[7]（2013）在《多价噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37基因密码子用法分析》一文中研究指出编码天然蛋白质20种氨基酸的密码子共有61种,每种氨基酸可由1-6个密码子编码,所以存在简并性。密码子的这种简并性特征造成了不同物种的密码子使用偏爱性不同,即同义密码子子在不同物种中具有不同的使用频率,而且不同种类生物的密码子使用方式也存在差别。这种现象会导致外源基因在宿主细胞中的表达量降低。而早在20世纪70年代,人们在研究基因的异源表达时,就已经意识到密码子偏性的重要性。以往对密码子用法的研究多集中在自养生物[1]及果蝇、毕赤酵母等,对纯(本文来源于《中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第八届全国会员代表大会暨第十五次学术研讨会论文集》期刊2013-10-21）
邢朝斌,曹蕾,周秘,修乐山[8]（2013）在《刺五加叶绿体基因组密码子的用法分析》一文中研究指出目的:分析刺五加叶绿体基因组密码子的使用方式及其影响因素。方法:以刺五加叶绿体基因组的52条编码基因为材料,利用CodonW和SPSS软件进行多元统计分析和对应性分析。结果:刺五加叶绿体基因组密码子3个位置GC的量依次为46.46%,38.26%,29.88%,其中GC1与GC2呈极显着相关关系(P<0.01),GC12与GC3的相关系数为0.205,未达到显着水平。同义密码子的相对使用频率(relative synonymous codon usage,RSCU)>1的密码子共30个,其中29个以A或T碱基结尾。对应性分析的结果表明:第1轴显示了10.35%的差异,与有效密码子数(effective number of codons,ENC)和GC3显着相关,相关系数分别为-0.288,0.353;确定了刺五加叶绿体基因组的16个最优密码子。结论:刺五加叶绿体密码子第3位偏好以A或T碱基结尾,密码子使用模式受选择和突变及其他因素共同影响,其中选择的作用略大。(本文来源于《中国中药杂志》期刊2013年05期）
倪志华[9]（2012）在《药用植物人参和叁七的密码子用法分析》一文中研究指出采用高频密码子分析法,对人参属药用植物人参(Panax ginseng C.A.Mey.)和叁七[PanaxNotoginseng(Burk.)F.H.Chen]的蛋白质编码基因序列(coding DNA sequence,CDS)进行了同义密码子相对使用频率(relative frequency of synonymous coden,RFSC)分析,确定了人参高频密码子6个和叁七高频密码子7个。将人参和田七的密码子使用频率进行比较,结果显示两者的密码子偏爱性具有较高的一致性。分析结果为外源基因在人参和叁七中的表达提供参考。(本文来源于《唐山师范学院学报》期刊2012年05期）
李鼎立,宋健坤,王然[10]（2011）在《不同种类梨密码子用法的初步分析》一文中研究指出采用高频密码子分析法,对白梨(Pyrus bretschneideri)、西洋梨(Pyrus communis)、砂梨(Pyrus pyrifolia)、秋子梨(Pyrus ussuriensis)4种梨种类的蛋白质编码基因序列(Codon DNA sequence,CDS)进行了同义密码子相对使用频率计算,鉴定出了不同种类梨的高频密码子,发现其在密码子的使用上具有较高的一致性,最后对密码子的使用进行了讨论。(本文来源于《梨科研与生产进展（五）》期刊2011-11-01）
密码子用法论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
不同物种间的同义密码子使用偏性存在差异,开展密码子偏好性研究可深入了解基因表达特征,为分子育种提供依据。利用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术获得金鱼的转录组数据,筛选符合条件的编码基因序列(Coding DNAsequence,简称CDS),并通过Codon W软件和CUSP程序对金鱼蛋白质编码基因序列进行了分析,获得编码氨基酸的密码子使用频率,并与人、酵母、大肠杆菌、果蝇、斑马鱼等不同种类的模式生物进行比较。结果表明,金鱼8 143个基因在64个密码子中有28种偏爱密码子,有效密码子数为54.9,3个位置的平均GC含量为0.509,第3位密码子GC百分含量为0.564,金鱼偏向使用G或C结尾的密码子。金鱼密码子偏好性与模式生物有不同程度的差异,与酵母密码子使用频率差异最大,与斑马鱼的密码子偏好性一致。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
密码子用法论文参考文献
[1].张琦,焦翔,刘香健,张月,张素芳.圆红冬孢酵母的密码子用法分析[J].菌物学报.2018
[2].张欣,尤宏争,李荣妮,朱莉飞,李文通.金鱼密码子用法特点分析[J].华北农学报.2017
[3].傅建敏,索玉静,刘慧敏,谭晓风.柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法[J].经济林研究.2017
[4].王晖,高妍夏,杨帆,苏萌,张东豪.家蚕cyp450基因家族密码子的用法分析[J].黑龙江畜牧兽医.2017
[5].孙虎芝,任慧英,张灿.噬菌体Bp7尾丝蛋白gp38密码子用法及偏性分析[J].动物医学进展.2015
[6].王樟凤,柴学文,彭武林,黄润红,饶友生.珍珠鸟(Taeniopygiaguttata)Z染色体基因表达的密码子用法[J].江西农业大学学报.2013
[7].逯凯,张灿,刘文华,邹玲,任慧英.多价噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37基因密码子用法分析[C].中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第八届全国会员代表大会暨第十五次学术研讨会论文集.2013
[8].邢朝斌,曹蕾,周秘,修乐山.刺五加叶绿体基因组密码子的用法分析[J].中国中药杂志.2013
[9].倪志华.药用植物人参和叁七的密码子用法分析[J].唐山师范学院学报.2012
[10].李鼎立,宋健坤,王然.不同种类梨密码子用法的初步分析[C].梨科研与生产进展（五）.2011
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