狗枣猕猴桃AkSAP蛋白的生物信息学分析

论文摘要

为研究狗枣猕猴桃锌指蛋白（AkSAP）的功能,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明,AkSAP的cDNA全长为2 089 bp,编码区（CDS）为1 431 bp,编码蛋白为由477个氨基酸构成的非稳定亲水蛋白,属于SAP蛋白家族成员（ID:10488483）,主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,包含锌指蛋白特有的SAP结构域,与其他17种植物的SAP氨基酸序列进行对比,与中华猕猴桃变种亲缘关系较近。

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类型: 期刊论文

作者: 刘丹,李然红,陈鑫,王立凤

关键词: 狗枣猕猴桃,锌指蛋白,生物信息学

来源: 河南农业科学 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 园艺

单位: 牡丹江师范学院

基金: 黑龙江省教育厅项目(1354MSYYB006,1354MSYYB007,1354ZD005),牡丹江师范学院科研项目(QN2019005,YB2019005),黑龙江药用植物开发与利用研究项目(1353PT007),黑龙江省大学生创新创业训练计划项目(201910233007)

分类号: S663.4

DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.12.015

页码: 103-108

总页数: 6

文件大小: 1616K

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标签：狗枣猕猴桃论文;  锌指蛋白论文;  生物信息学论文;