辣椒酸性蔗糖转化酶基因家族鉴定及表达

辣椒酸性蔗糖转化酶基因家族鉴定及表达

论文摘要

为了探究辣椒酸性蔗糖转化酶基因的多样性,本研究根据已公布的辣椒基因组数据信息,利用生物信息学方法对辣椒酸性蔗糖转化酶(Acid invertase)基因家族成员进行鉴定,对其染色体定位、系统发育树关系、表达模式进行分析。结果表明:辣椒含有9个酸性蔗糖转化酶基因成员(CaVIN01~CaVIN02,CaCWIN01~CaCWIN07),2个属于液泡蔗糖转化酶,7个属于细胞壁蔗糖转化酶。其编码氨基酸长度在513~656 aa之间,分子量大小位于58.19~73.31 kD之间,等电点变化在5.49~8.97区间;染色体定位发现,其中8个基因分布于四条染色体上,CaCWIN06的染色体定位是不确定的;系统发育树的构建来自于4个物种:辣椒、番茄、拟南芥和水稻,系统发育树显示酸性蔗糖转化酶分为两类:液泡蔗糖转化酶(vacuolar invertase, VIN)和细胞壁蔗糖转化酶(cell wall invertase, CWIN),其中细胞壁蔗糖转化酶又分为四个亚支(Ⅰ~Ⅳ);基于RNA-seq分析发现,CaVIN02和CaCWIN03在花和果实发育中呈现高表达,其它基因表达量较低;叶片中CaVIN02和CaCWIN07具有较高表达量,其它基因表达量低;进一步研究发现,在激素胁迫下,CaVIN01、CaVIN02、CaCWIN01、CaCWIN02和CaCWIN07受到激素的诱导,而其它基因几乎无变化;高低温胁迫下CaVIN02和CaCWIN03具有明显的表达量,这两个基因受温度诱导最为明显,其它基因无明显表达。这些结果为深入探讨辣椒蔗糖转化酶基因的功能提供数据基础。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 辣椒酸性蔗糖转化酶基因家族的鉴定
  •   1.2 辣椒酸性蔗糖转化酶基因染色体定位
  •   1.3 辣椒、番茄、拟南芥和水稻酸性蔗糖酶基因家族比较
  •   1.4 辣椒酸性蔗糖转化酶基因的表达量
  •   1.5 辣椒酸性蔗糖转化酶基因在不同激素处理下的表模式
  •   1.6 辣椒酸性蔗糖转化酶基因在环境胁迫下的表模式
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 数据库
  •   3.2 辣椒酸性蔗糖转化酶基因家族的鉴定和染色体定位
  •   3.3 辣椒、番茄、拟南芥和水稻酸性蔗糖转化酶基因家族系统发育树
  •   3.4 辣椒酸性蔗糖转化酶基因表达量分析
  •   3.5 辣椒酸性蔗糖转化酶在激素处理下的表达模式
  •   3.6 辣椒酸性蔗糖转化酶在低温和高温胁迫下的表达模式
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 魏华伟,柴松琳,胡克玲,侯金锋,高朋,高优洋,陈友根

    关键词: 辣椒,酸性蔗糖转化酶,表达分析,胁迫响应

    来源: 分子植物育种 2019年15期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,园艺

    单位: 安徽农业大学园艺学院,长江大学园艺园林学院,安徽省园艺作物育种工程实验室

    基金: 安徽省重点研究与开发计划项目(1804e03020325)资助

    分类号: S641.3;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.004900

    页码: 4900-4907

    总页数: 8

    文件大小: 2157K

    下载量: 215

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