马乳酒样乳杆菌ZW3多位点序列分型

论文摘要

该研究采用多位点序列分型方法将马乳酒样乳杆菌ZW3与其他同种或近源乳杆菌菌株进行细致的分类鉴定,同时确定马乳酒样乳杆菌ZW3特定的生物遗传标签,使用多位点序列分型方法对马乳酒样乳杆菌ZW3菌株与9株同种或近源乳杆菌一起进行多位点序列分型研究。该研究选取了7个管家基因(rpo A、Hsp60、Leu S、rps B、gly K、pyr G、fus A)对这10株同种或近源乳杆菌菌株进行分型,最终得到8个序列型,马乳酒样乳杆菌ZW3单独拥有一个序列型ST8。这7个基因中,除pyr G外其余6个基因存在连锁不平衡现象,发生过轻微的基因重组现象,发生的变异通常为中性选择。马乳酒样乳杆菌ZW3与马乳酒样乳杆菌an3、shan3、shan4、shan5之间的遗传距离很近,与另外5株菌之间的遗传距离较远。该研究中选取的这7个管家基因可以将马乳酒样乳杆菌ZW3与其他同种或近源乳杆菌菌株进行区别,马乳酒样乳杆菌ZW3菌株的识别有助于在商业制品中确定其特定的益生功能。

论文目录

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 样品及来源

1.1.2 培养基

1.1.3 主要试剂

1.1.4 仪器与设备

1.1.5 引物

1.2 确定菌株序列型（ST型）

1.2.1 菌株活化及16S rRNA鉴定

1.2.2 PCR扩增MLST目的基因片段

1.2.3 确定菌株序列型（ST型）

1.3 等位基因和菌株遗传进化分析

1.3.1 等位基因多样性、连锁平衡、重组分析

1.3.2 不同菌株的聚类分析

2 结果与分析

2.1 菌株鉴定结果

2.2 PCR扩增MLST片段

2.3 菌株ST分型结果

2.4 等位基因多样性分析

2.5 等位基因的连锁平衡分析

2.6 等位基因的重组分析

2.7 不同ST型的eBURST分析

2.8 不同ST型和不同菌株的聚类分析

3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 段晓微,张阳,邢竹青,王艳萍,耿伟涛

关键词: 马乳酒样乳杆菌,开菲尔乳杆菌,多位点序列分型,管家基因,遗传进化

来源: 食品与发酵工业 2019年22期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 天津科技大学食品工程与生物技术学院,天津中医药大学健康科学与工程学院

分类号: TS261.1

DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.020962

页码: 60-67

总页数: 8

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马乳酒样乳杆菌ZW3多位点序列分型

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