美洲大蠊microRNA的初步研究

美洲大蠊microRNA的初步研究

论文摘要

美洲大蠊Periplaneta americana是一种世界性的卫生害虫,但其提取物有较高的药用价值。本研究对饲养的雌雄美洲大蠊成虫进行microRNA测序,分别在雄性和雌性中得到12 155 616条和9 847 263条序列。序列长度主要为18~23 nt,且在22 nt和29 nt处有2个峰值。将所得序列与数据库(NCBI、Rfam)进行比对注释,最终在雄性成虫中鉴定到57种已知的microRNA和152种潜在的新microRNA,在雌性成虫中鉴定到53种已知的microRNA和94种潜在的新microRNA。差异表达分析发现只有一种microRNA:miR-750在雌雄之间差异表达,其在雌虫中表达量显著高于雄虫。本研究首次在基因组水平研究了美洲大蠊microRNA的组成并对其功能进行了预测,为其后续研究奠定了基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品准备与小RNA的文库构建和测序
  •   1.2 数据处理
  •   1.3 预测靶基因及KEGG通路分析
  •   1.4 已知mi RNA的差异表达
  • 2 结果
  •   2.1 测序数据、长度分布和其他小RNA的注释
  •   2.2 mi RNA及靶基因预测和KEGG通路分析
  •   2.3 已知的mi RNA在雌雄美洲大蠊中的差异表达
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 宝钲,杨茗羽,张修月,岳碧松,范振鑫

    关键词: 美洲大蠊,差异表达

    来源: 四川动物 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院,药用美洲大蠊四川省重点实验室

    基金: 好医生助研项目

    分类号: Q963

    页码: 47-55

    总页数: 9

    文件大小: 1430K

    下载量: 124

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