免疫球蛋白重链基因论文_石彬,马嘉欣,涂文静,吴皓明,陈先恋

导读:本文包含了免疫球蛋白重链基因论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:免疫球蛋白,基因,抗体,多样性,斯坦,北京鸭,弧菌。

免疫球蛋白重链基因论文文献综述

石彬,马嘉欣,涂文静,吴皓明,陈先恋[1](2019)在《人免疫球蛋白重链可变区基因的特征分析》一文中研究指出目的:分析五类免疫球蛋白重链可变区基因的特征.方法:收集IMGT/LIGM-DB数据库中人类五类Ig重链可变区的基因序列,利用IMGT/HighV-QUEST分析其基因取用、V区AA变化、CDR3氨基酸长度和构成以及连接多样性.结果:IgM、IgG和IgE均较多地取用IGHJ4、IGHV1-69和IGHV5-51,且在IgM、IgG、IgA与IgE中可观察到几个相似的优势V-J配对.IgD具有较高的V区突变,主要体现在FR3区的高突变(AA变化值为7.2±2.4),而IgM的每个结构域的突变均明显低于其他类Ig.此外,IgD具有较高P插入发生率和插入核苷酸数明显多于其他四类Ig.结论:本研究从基因特征上描绘了人类五类Ig相互间的相似性与差异性,这些结果可为抗体工程领域提供重要参考数据.(本文来源于《聊城大学学报(自然科学版)》期刊2019年04期)

刘卫刚,韩坤煌,谢芳靖,邹鹏飞,张子平[2](2018)在《大黄鱼免疫球蛋白M重链基因全长cDNA序列的克隆与表达》一文中研究指出从本实验室自建的大黄鱼表达标签数据库中获取了大黄鱼免疫球蛋白M重链(LcIgMH)基因片段,并以此设计SMART-RACE引物,最终得到1917 bp的全长c DNA序列。经分析发现其含6 bp的5'非编码区(5'UTR)、176 bp的3'UTR以及1738 bp的开放阅读框(ORF);预测的ORF共编码584个氨基酸,蛋白质分子量为65. 2 ku,等电点为5. 84;利用Singal P 4. 1 Server发现其5'端含有信号肽(1-19 aa);Blast P Server的结果显示,其与红笛鲷的IgMH序列一致性最高,达到64%;利用IMGT/Domain Gap Align进行重链可变区与恒定区预测,发现含有1个重链可变区与4个重链恒定区,同时,预测还发现可变区含有典型的3个高变区与4个骨架区结构。实时荧光定量PCR结果显示该基因在头肾与脾脏中大量表达,并显着高于其他各组织,同时雌雄鱼LcIgMH在各组织中表达量均无显着性差异,表明LcIgMH表达与性别无关。注射副溶血弧菌进行感染4 d后,脾脏内LcIgMH表达量最高,并且与对照组之间存在显着性差异(P <0. 05),但感染后第8天的表达水平已与对照组无显着性差异(P> 0. 05),显示LcIgMH与大黄鱼的免疫应答反应相关。(本文来源于《集美大学学报(自然科学版)》期刊2018年06期)

程学谦[3](2018)在《小鼠免疫球蛋白基因γ1-C_H1外显子敲除表达重链抗体的研究》一文中研究指出免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig),又常被称为抗体,是机体抵御外界病原微生物入侵最重要的免疫分子之一。经典的免疫球蛋白由两条重链和两条轻链共同组成,仅由重链构成而不结合轻链的免疫球蛋白被称为重链抗体(Heavy chain only antibody)。重链抗体在正常情况下被认为是不正常的抗体类型,而在驼科动物及一些鱼类如鲨鱼、银鲛中,却天然存在重链抗体类型。驼科动物中的重链抗体相比较于经典抗体,具有明显的结构特点和在抗原结合方面的优势,所以近年来在实验室研究、试剂诊断和抗体药物研发等多个领域得到了广泛的应用。目前几乎所有重链抗体都来源于驼科动物,但驼科动物的饲养和免疫操作在很大程度上限制了重链抗体的广泛应用。基于此原因,我们试图利用遗传修饰小鼠来表达重链抗体。由于天然重链抗体都缺乏重链恒定区第一个结构域(CH1结构域),本论文通过删除小鼠中表达量最高的IgG1型抗体编码基因γ1的CH1外显子,在不修饰小鼠抗体可变区的情况下,研究小鼠是否能表达有功能的IgG1型重链抗体,为重链抗体的获得和应用提供新的思路和方法。本研究首先通过构建基因打靶载体,在小鼠ES细胞中,以neo基因定点替换掉了小鼠内源的γ 1-CH1外显子。通过PCR和Southern Blot的方法对于ES细胞基因型进行了鉴定,将打靶成功的小鼠ES细胞显微注射到小鼠囊胚中,得到以neo基因替换小鼠γ 1-CH1外显子的129Sv/JNeo+/Neo+小鼠品系。随后的研究发现该品系小鼠并不能正常表达分泌型的IgG1型抗体。因此通过Cre-loxP系统,对于外源neo基因进行了删除,得到了删除内源γ 1-CH1外显子而并不携带neo基因的HG1小鼠品系。进一步通过PCR和Southern Blot的方法对于HG1小鼠基因型进行了确证。通过RT-PCR的方法,对于HG1小鼠中γ1基因转录进行检测,发现其可以正常转录。随后的q-PCR实验表明γ1基因在HG1小鼠中转录水平较低,约为野生型小鼠中γ1基因转录水平的1/4。Western Blot实验检测到HG1小鼠血清中存在分泌型IgG1型抗体,通过特异性结合轻链的Protein L磁珠处理血清,证实了在HG1小鼠血清中的IgG1型抗体为预期的重链抗体类型。通过对小鼠脾脏和骨髓中B细胞流式分析检测发现,HG1小鼠骨髓中祖B细胞所占相对比例为32.91 ±3.54%,比野生型小鼠中显着提高(22.28± 1.76%,p<0.05);前B细胞所占相对比例为66.33 ±3.71%,比野生型小鼠中显着降低(77.24 ± 1.8%,p<0.05);未成熟B细胞和成熟B细胞在HG1小鼠中和野生型小鼠中所占比例类似,统计学意义上没有显着的差异。脾脏中浆细胞所占比例在HG1小鼠中极显着提高(p<0.0001)。但是表达IgG1型抗体的浆细胞比例在HG1小鼠中显着降低(p<0.001)。对于HG1小鼠中重链抗体的可变区序列分析发现,重链抗体偏好使用一些可变区家族如IGHV1家族,同时重链抗体结合抗原的关键区域CDR3也倾向于使用更长的氨基酸长度。ELISA测定小鼠血清中各种免疫球蛋白种类和亚型的含量发现,相比较于野生型小鼠,IgG1型重链抗体在HG1小鼠中表达量显着降低,约为野生型小鼠中IgG1型抗体表达量的1/3(p<0.01)。其它免疫球蛋白种类和亚型表达水平呈现出不同程度的升高。通过抗原OVA的免疫实验,发现HG1小鼠中IgG1型重链抗体能够产生免疫反应,产生抗原特异性的IgG1型重链抗体。但是相比较野生型小鼠来看,HG1小鼠中免疫后抗原特异性重链抗体滴度较低,仅为200,928.3 U/mL,而野生型小鼠中这一数据高达3,212,742 U/mL,也说明HG1小鼠中重链抗体的免疫应答能力较弱。随后利用OVA抗原免疫后的HG1小鼠建立了重链抗体可变区的噬菌体文库,通过亲和筛选得到了 12条特异性的重链抗体可变区序列。以结合抗原的关键区域CDR3氨基酸序列作为筛选依据,选取其中5条序列进行了原核表达得到5株纳米抗体,分别为8#,10#,18#,35#,42#。对于这5株纳米抗体,通过ELISA实验检测了其对于抗原OVA的结合能力,发现只有10#和35#呈现出一定程度的抗原结合能力,其中10#结合能力最强。随后以生物膜层干涉技术,对于10#纳米抗体和抗原OVA的解离曲线进行测定,发现10#纳米抗体可以较好的结合抗原OVA纯品,但相比较于商品化抗体标准,其特异性和亲和力仍存在差距。综上所述,我以小鼠为研究对象,通过删除小鼠内源γ1-CH1外显子,得到了稳定表达IgG1型重链抗体的HG1小鼠品系。通过对于HG1小鼠品系的研究,发现其表达的IgG1型重链抗体能够产生较弱的免疫反应。随后通过噬菌体展示技术,从HG1小鼠中得到了特异性识别抗原OVA的纳米抗体。但与常规单克隆抗体相比,这些纳米抗体表现出较弱的抗原特异性和亲和力。本研究证实了利用遗传修饰小鼠表达有功能重链抗体的可能性,为重链抗体的来源及应用提供了一条新的思路和方法。(本文来源于《中国农业大学》期刊2018-04-01)

韩芬[4](2018)在《丹参酮ⅡA对HCY诱导增殖血管平滑肌细胞ERS相关基因免疫球蛋白重链结合蛋白表达的影响》一文中研究指出目的探究丹参酮ⅡA对同型半胱氨酸(HCY)诱导增殖血管平滑肌细胞(VSMC)内质网应激(ERS)相关基因免疫球蛋白重链结合蛋白(Bip)表达的影响。方法通过HCY诱导构建兔VSMC增殖模型,给予瑞舒伐他汀或不同浓度的丹参酮ⅡA进行培养,采用实时荧光定量PCR测定实验兔Bip mRNA基因表达。结果模型组Bip mRNA表达(3.27±0.30)高于空白对照组(0.13±0.35),差异具有统计学意义(P<0.05);丹参酮ⅡA组0.5 mg/L剂量的Bip mRNA表达(4.53±0.60)、1.0 mg/L剂量的Bip mRNA表达(12.71±0.27)、瑞舒伐他汀组Bip mRNA表达(8.80±0.21)均高于模型组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论丹参酮ⅡA对HCY诱导增殖VSMC ERS相关基因Bip表达具有明显作用。(本文来源于《中国实用医药》期刊2018年07期)

韩滨岳[5](2017)在《鸟类免疫球蛋白重链基因的进化分析》一文中研究指出免疫球蛋白(imunoglobulin,Ig)是有颌类脊椎动物适应性免疫系统中的关键分子。作为其中最古老的Ig类型,IgD(由δ因编码)被认为存在于除鸟类之外的其他所有有颌类脊椎动物中。长久以来,大家普遍认为鸟类只表达IgM、IgA、IgY叁种Ig重链类型,缺失了在其他物种中都保守存在的IgD。但以前对鸟类Ig基因的研究主要集中在少数物种上,受技术手段的影响,部分结论可能并不准确、全面。因此本研究利用高通量技术手段全面分析了非洲鸵鸟(Struthiocamelus)、鸸鹋(Dromaius novaetollandiae)、珍珠鸟(Taeniopygia guttata)等几种代表性鸟类表达的Ig类型,首次在鸟类中发现了δ因及IgM和IgY的亚型分化。非洲鸵鸟代表着现存最原始的鸟类,同爬行类动物亲缘关系很近,因此在进化生物学研究上具有重要价值。本研究首先以非洲鸵鸟为研究对象,对其表达的Ig基因类型进行了全面分析。提取非洲鸵鸟脾脏、法氏囊、小肠组织RNA样品进行转录组测序,对转录组测序数据和华大基因测得的非洲鸵鸟基因组测序数据进行分析,经BLAST搜索及后续详细的序列比对发现非洲鸵鸟中存在叁种新的 Ig 类型:IgD、IgM2 和 IgY2。通过 3' RACE(rapid amplification of cDNA ends)和5' RACE相结合的方法扩增得到δ基因序列全长,并选用多个物种Ig基因的氨基酸序列构建系统发育树,分析了这些基因的进化特点。采用Northern Blotting和荧光定量PCR在RNA水平上验证了δ基因的表达模式及在不同组织中的表达特点。通过构建BAC(bacterial artificial chromosome)文库并筛选相应BAC克隆、基因组步移和长片段PCR扩增等方法绘制了非洲鸵鸟重链基因位点部分结构图:μ1-δ-α-μ2。为探讨δ基因在鸟类中是否普遍存在,本研究对已有的48种鸟类基因组数据进行逐一搜索,在18种鸟类中发现了δ因片段序列,表明δ基因在鸟类中是广泛存在的。此外,IgM和IgY分别存在2种亚型这一现象也是在鸟类中首次发现。为进一步深入探讨δ基因以及IgM和IgY亚型分化在其他鸟类中的情况,本研究选择了鸸鹋和珍珠鸟这两个物种验证上述相关实验结果。鸸鹋与非洲鸵鸟同属于平胸总目,也是进化上较为古老的鸟类。研究结果表明鸸鹋表达的免疫球蛋白类型同非洲鸵鸟一致,共有IgM1、IgM2、IgD、IgA、IgY1和IgY2六种类型。珍珠鸟属于雀形目,而雀形目是鸟类中物种种类最为丰富、数量最为庞大的一类。分析结果表明珍珠鸟同鸡、鸭一致,只表达IgM、IgA和IgY叁种免疫球蛋白,不表达IgD,在该物种中也未发现IgM和IgY亚型分化现象。综上所述,本研究首次在鸟类中发现了 IgD编码基因。虽然个别鸟类物种丢失了该基因,但该基因仍然广泛存在于大部分鸟类中。此外,本研究还在鸟类中发现了 IgM和IgY亚型基因分化现象,且进化分析表明IgM和IgY的亚型分化发生在现存鸟类物种分化之前。这些结果表明现代鸟类的共同祖先表达IgM1、IgM2、IgD、IgA、IgY1和IgY2六种免疫球蛋白类型。对于IgM而言,较古老的鸟类(如非洲鸵鸟、鸸鹋)同时保留了 IgM1和IgM2,其他鸟类则丢失了 IgM2编码基因,仅表达IgM1;对IgY而言,一部分鸟类(如非洲鸵鸟、鸸鹋、鸽子)同时表达IgY1和IgY2,另外一部分鸟类(如珍珠鸟、企鹅)仅表达IgY1,其他鸟类(如鸡、鸭、鹅)仅表达IgY2。这些研究结果对于理解免疫球蛋白基因在有颌类脊椎动物尤其是鸟类中的进化模式具有重要意义。(本文来源于《中国农业大学》期刊2017-06-01)

夏虎,陆风辉,李文强,唐英,晟俊杰[6](2016)在《团头鲂免疫球蛋白mIgD重链基因的克隆与表达分析》一文中研究指出团头鲂免疫球蛋白mIgD重链基因cDNA(GenBank accession no.KC894947)全长3313bp,其中开放阅读框2832 bp,5′非编区119 bp,3′非编区362 bp,开放阅读框编码943个氨基酸,包括一个可变区(V),一个Cμ1区,七个恒定区(Cδ1-Cδ7)和一个转膜区(TM)。对团头鲂mIgD重链基因进行同源性比对,结果发现团头鲂mIgD重链基因序列与草鱼和鲤的相似性最高,分别达到81%和67%。实时定量PCR分析表明,在胚胎发育阶段,从未受精卵到16细胞期,mIgD重链基因mRNA的表达量逐渐降低,从囊胚期开始,mIgD重链基因mRNA的表达量显着的升高。在性成熟与性未熟的团头鲂中,mIgD重链基因mRNA在头肾中的表达量最高。性未熟团头鲂mIgD重链基因mRNA在体肾、脾、肝、肠、鳃和脑中的表达量对性成熟团头鲂对应的组织要高。(本文来源于《2016年中国水产学会学术年会论文摘要集》期刊2016-11-02)

李岩,董焕声,赵要风,潘庆杰[7](2016)在《巴布亚企鹅免疫球蛋白重链基因分析》一文中研究指出引言/目的免疫球蛋白是适应性免疫系统独特的标志性分子,广泛存在于有颌类脊椎动物中。鸟类作为脊椎动物进化过程中的重要环节,关于鸟类免疫球蛋白的报道也仅局限于鸡形目、雁形目和鸵鸟目的少数几个物种。目前的研究发现,鸟类只表达μ、α和v三种类型的免疫球蛋白重链基因,尚未从鸟类中发现δ基因的存在。本实验以巴布亚企鹅为研究对象,对其免疫球蛋白重链基因进行克隆分析,为更好的理解免疫球蛋白基因在鸟类中的进化提供新的素材。(本文来源于《中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十八届学术研讨会暨中日韩第四届动物繁殖学术交流会论文集》期刊2016-08-18)

马力[8](2016)在《荷斯坦奶牛免疫球蛋白重链基因位点结构及其多样性形成机制的研究》一文中研究指出免疫球蛋白(Immunoglobulin, Ig)是适应性免疫最重要的效应分子之一,其中跨膜型IgM又是B淋巴细胞发育的关键受体分子。在人和小鼠中,IgM编码基因的突变会导致B细胞的缺失,从而引起严重的免疫缺陷。以前的研究发现牛免疫球蛋白重链基因有着非常独特的特点——基因组中存在着两个有功能的免疫球蛋白重链基因位点,分别位于21号和11号染色体上,它们各有一个编码IgM的μ基因。免疫球蛋白基因表达过程中存在等位排斥现象,即一条染色体上免疫球蛋白基因的成功表达会使对应的同源染色体上的基因片段的重组关闭,因此牛两个位点上的μ基因如何协调表达以保证B细胞的正常发育和每个B细胞的单一抗原特异性是一个令人困扰的问题。此外,与人和小鼠相比,牛免疫球蛋白重链可变区基因片段数目非常有限,它如何利用很少的可变区基因片段产生足够多的抗体多样性是另外一个值得探讨的重要问题。本研究通过尼龙膜原位杂交方法对荷斯坦奶牛RP42-BAC文库进行了全面的筛选并获得了30个包含牛重链基因的BAC克隆。利用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization, FISH)实验确定牛基因组中只存在一个免疫球蛋白重链基因位点并位于21号染色体上,而在11号染色体上不存在有功能的重链基因位点。基于对7个BAC克隆的全长测序和长片段PCR实验,我们获得了包括部分V区在内的免疫球蛋白重链基因位点结构信息,所测得的基因组片段按如下顺序排列:5'-VHn-DHn-JHn-μ1-(ψδ-ψV-DHn)3-JHn-μ2-δ-γ3-γ1-γ2-δ-α-3'。本研究发现两个有功能的μ基因线性排列在同一重链基因位点上,因此并不存在等位排斥问题。这两个μ基因除了可以通过VDJ重组独立表达外,μ2基因也可以通过CSR机制(class swit ch recombination, CSR)进行表达。表达分析显示荷斯坦奶牛在整个发育阶段的几乎各个器官组织中都主要表达IgM2(μ2)亚型。分析IgM1和IgM2的重链可变区序列发现二者在阳性/阴性选择以及物理化学性质上并无显着差异。在长约284 Kb的部分V区序列中仅发现了12个有功能的VH基因片段,它们属于同一家族而且具有很高的同源性(>89%)。在四个DH位点中共发现23个DH片段,16个具有重组功能,其中有一个超长的DH片段,其编码长度达到149 bp。VDJ重组分析证明IgMl和IgM2对于DH,JH片段的使用都有着极强的偏好性,这导致VH-DH-JH的组合多样性更加有限。通过与人和小鼠可变区CDR3H cDNA序列的比较,发现牛CDR3H的长度变化范围非常广(3-60+aa),而N,P核苷酸加入情况与小鼠类似,推测牛免疫球蛋白显着的连接多样性的产生更依赖由外切酶的剪切作用导致的CDR3H长度和序列变化的多态性。cDNA序列分析发现有功能的超长CDR3H只存在于IgM2亚型,且全部由DH8片段参与编码,但分析基因组中VDJ重组产物发现通过超长N,P核苷酸的加入,部分其他DH片段也可以参与超长CDR3H的产生。另外由于参与编码牛IgM2 CDR3H的DH片段长度普遍较长,IgM2CDR3H的平均长度也明显长于人,小鼠以及牛IgM1。牛主要依赖半胱氨酸形成的二硫键稳定CDR3H的空间结构和产生空间多样性,这在超长CDR3H中体现得更加明显。综上所述,我们证明牛基因组中只有一个免疫球蛋白重链基因位点,并获得了较为完整的结构信息。虽然牛的两个μ基因都具有功能,但在各个组织和不同发育时期主要表达μ2基因。牛主要通过增加连接多样性程度和CDR3H平均长度来弥补因为可变区基因片段数目有限造成的VDJ重组多样性的不足。此外,牛超长CDR3H主要是通过DH8基因片段参与重组产生,理论上也可以通过超长N,P核苷酸的插入形成。本研究为理解牛免疫球蛋白重链基因的多样性产生机制以及牛两个μ基因的协同表达的问题提供了明确的线索和证据。(本文来源于《中国农业大学》期刊2016-06-01)

管晓星[9](2016)在《北京鸭免疫球蛋白轻链基因胚系结构及多样性产生机制研究》一文中研究指出鸭是水禽类的代表,具有重要的农业经济价值和特殊的免疫学特点,近年来受到越来越多免疫学研究者的关注。免疫球蛋白(immunoglobulin, Ig)是动物适应性免疫系统中的关键分子,目前在几乎所有研究过的鸟类免疫球蛋白轻链(immunoglobulin light chain, IgL)基因位点中,都只有一个功能Vλ基因片段可以参与VJ重组,因此VJ重组引入的序列多样性非常有限。鸟类IgL基因主要依赖基因转换(gene conversion)机制而产生序列多样性,即利用可变区假基因作为序列供体来修饰发生VJ重组的Vλ基因。兔子及一些偶蹄类动物(猪、牛和羊等)的免疫球蛋白基因也能通过基因转换产生多样性,但是人和小鼠免疫球蛋白基因几乎不能发生基因转换。本研究深入解析了北京鸭IgL基因序列,构建了完整的基因位点胚系结构图谱:系统分析了北京鸭IgL基因多样性产生机制的特征,如VJ重组、基因转换、体细胞超突变等。期望通过以上研究,使我们对鸭IgL基因的位点结构和多样性产生机制有更全面深入的认识。我们通过筛选北京鸭基因组细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome, BAC)文库,并对筛选到的覆盖北京鸭完整IgL基因位点的BAC克隆进行全长测序,获得了包含北京鸭轻链基因的约210 kb的基因组序列。通过对该序列的分析,结合Southern blotting及RACE实验结果,最终构建了北京鸭IgL基因位点完整胚系结构图。在北京鸭IgL基因位点中,Cx和Jλ基因为单拷贝,这与鸡等其它鸟类一致;而与其它鸟类不同的是,北京鸭IgL基因位点中共有88个Vλ基因片段,其中9个是功能Vλ基因,79个为假基因。88个Vλ基因可以分为两个家族,而9个功能Vλ基因同源性较高,属于同一家族成员。进化树分析显示,这9个功能Vλ基因与其它鸟类的功能Vλ基冈同源性很高,说明鸭多个功能Vλ基因很可能是进化过程中通过基因复制产生的。我们通过特异PCR及序列分析发现,鸭9个功能Vλ基因均能参与VJ重组过程。相比于鸡等其它鸟类,多个V基因参与VJ重组明显增加了鸭IgL基因重组多样性,但与人和小鼠相比仍然很低。北京鸭VλJλ重组片段中还存在少量N核苷酸和P核苷酸插入。比较北京鸭、人、小鼠和鸡的CDRL3区域的长度和氨基酸使用情况发现,北京鸭CDRL3长序列较多且半胱氨酸含量相对高一些。我们还发现,基因转换在北京鸭IgL基因多样性中起到重要作用(21日龄北京鸭中,Vλ1、Vx9和Vλ19基因转换频率为25.3%,平均替换片段长度为45±41 bp;140日龄北京鸭中为36.5%,平均替换片段长度为86±46 bp),而且北京鸭9个功能Vλ基因中都能发生基因转换,从而可显着提高北京鸭IgL基因多样性。为进一步探究为什么小鼠不能利用基因转换机制米增加免疫球蛋白基因的多样性,我们将上述筛选到的携带有完整北京鸭IgL基因位点的BAC克隆进行修饰并制备了转基因小鼠。阳性转基因小鼠中,外源鸭功能Vλ基因都能参与VJ重组。RNA水平检测显示,各家系小鼠均能正常表达内源小鼠Igλ、Igκ及外源鸭IgL基因。进一步的Western blotting实验表明,转基因小鼠中外源鸭IgL基因在蛋白水平也可以表达。通过基因转换分析发现,外源鸭Vλ6、Vλ9和Vx19基因转换频率仅为2.69%,虽然高于野生型小鼠(小鼠IgG,0.1%),但低于北京鸭自身中Vλ6、Vλ9和Vλ19基因转换频率。由此我们推测,野生型小鼠免疫球蛋白基因不发生基因转换,可能是受其基因结构和体内分子微环境共同影响而造成的。综上所述,我们首次获得了鸭IgL基因位点完整胚系结构图,并对其多样性产生机制如VJ重组、体细胞超突变、基因转换等进行了详细研究分析,为人们理解鸭免疫球蛋白基因的多样性产生机制奠定了基础。(本文来源于《中国农业大学》期刊2016-06-01)

杜丽娟[10](2016)在《山羊胚系免疫球蛋白重链可变区基因座结构及多样性机制分析》一文中研究指出免疫球蛋白是动物获得性免疫系统的重要组成部分,存在于鱼类、两栖类、爬行类、鸟类和哺乳类所有的有颌动物中。目前关于免疫球蛋白的结构和表达机制的认识大多是以人或者小鼠为模型获得的,对这些机制在家养动物中的认识还比较少。山羊是重要家畜之一,以其作为试验模型研究免疫球蛋白的结构和表达特点,一方面可以了解其免疫球蛋白基因表达的分子机制,另一方面也可以为深入理解其抗病机理、开展抗病育种工作提供理论基础。本试验以西农萨能奶山羊作为研究对象,利用公布的山羊基因组数据库,通过体外克隆免疫球蛋白重链重组的可变区序列并与胚系基因比对,探究其基因座结构和多样性机制,获得如下结果:以已克隆的山羊免疫球蛋白可变区序列(NCBI登录号:EU344746-EU344750)作为种子序列在山羊基因组数据库中进行搜索,发现重链可变区VH基因分布在5个基因组Scaffold片段上,共8个基因序列,根据核苷酸相似性分成两个家族,其中第一家族包括3个潜在功能基因、1个开放阅读框片段和2个假基因片段,与绵羊第一基因家族和小鼠第二家族基因亲缘关系较近;第二家族包含2个假基因片段。3个DH片段和6个JH片段位于基因组Scaffold1847上。DH基因呈5’-DH1-DH2-DH3-3’结构排列,全部为功能基因。JH基因以5’-ψJH1-ψJH2-ψJH3-JH1-ψJH4-JH2-3’结构排列,其中JH1和JH2为功能基因,ψJH1、ψJH2、ψJH3和ψJH4是假基因。从山羊脾脏中克隆重链重组的可变区,共得到238个不同的cDNA片段。分析显示:山羊重链对可变区3种基因片段的使用均具有一定的偏好性。在所有克隆中,IGHV1-2片段表达偏好性最强;JH1的使用频率高于JH2。在225个克隆中鉴定出重排的DH片段,偏好使用第叁个开放阅读框;3个DH片段中DH1的表达偏好性最强,其次是DH3片段。在28个克隆中可能存在两个不同DH片段共同连接的情况。CDR3的长度在5~27个(平均长度为11.33)氨基酸残基。所有cDNA序列同3个潜在功能VH片段比对,分析体细胞高突变过程中碱基的替换突变和插入/缺失情况,结果显示:碱基发生转换突变的频率均高于颠换,其中以A→G的突变数目最多,其次为G→A;总体嘌呤发生替换的比例是嘧啶的2倍左右;不同区段的替换数表现为CDR2区高于CDR1,FR3区高于FR1和FR2。碱基的插入/缺失主要在CDRs区,数目多为3或者3的倍数。综上,本研究揭示了山羊免疫球蛋白重链可变区的基因座结构,并阐述了VDJ重组多样性和体细胞高突变机制对于多样化重链可变区表达谱的重要作用。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2016-05-01)

免疫球蛋白重链基因论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

从本实验室自建的大黄鱼表达标签数据库中获取了大黄鱼免疫球蛋白M重链(LcIgMH)基因片段,并以此设计SMART-RACE引物,最终得到1917 bp的全长c DNA序列。经分析发现其含6 bp的5'非编码区(5'UTR)、176 bp的3'UTR以及1738 bp的开放阅读框(ORF);预测的ORF共编码584个氨基酸,蛋白质分子量为65. 2 ku,等电点为5. 84;利用Singal P 4. 1 Server发现其5'端含有信号肽(1-19 aa);Blast P Server的结果显示,其与红笛鲷的IgMH序列一致性最高,达到64%;利用IMGT/Domain Gap Align进行重链可变区与恒定区预测,发现含有1个重链可变区与4个重链恒定区,同时,预测还发现可变区含有典型的3个高变区与4个骨架区结构。实时荧光定量PCR结果显示该基因在头肾与脾脏中大量表达,并显着高于其他各组织,同时雌雄鱼LcIgMH在各组织中表达量均无显着性差异,表明LcIgMH表达与性别无关。注射副溶血弧菌进行感染4 d后,脾脏内LcIgMH表达量最高,并且与对照组之间存在显着性差异(P <0. 05),但感染后第8天的表达水平已与对照组无显着性差异(P> 0. 05),显示LcIgMH与大黄鱼的免疫应答反应相关。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

免疫球蛋白重链基因论文参考文献

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论文知识图

白血病细胞特异性人化scFv片段与...基于脊椎动物免疫球蛋白重链基因正常及易位的BCL2和免疫球蛋白重链4 基于脊椎动物免疫球蛋白重链基因1-4人和小鼠免疫球蛋白重链基因人免疫球蛋白重链基因结构模式...

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免疫球蛋白重链基因论文_石彬,马嘉欣,涂文静,吴皓明,陈先恋
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