尿素和二甲基亚砜诱导DhaA变性的分子动力学模拟

论文摘要

DhaA能够有效降解化学毒剂芥子气,而环境耐受性差影响了其在军事洗消中的应用。虽然已有研究表明定向进化、化学修饰、固定化有利于提高DhaA在尿素、二甲基亚砜(DMSO)溶液中的稳定性,但DhaA在尿素、DMSO下的变性过程尚不清晰。利用分子动力学(MD)模拟方法研究了DhaA在尿素和DMSO两种体系中的变性过程,结果表明尿素分子通过取代水分子与DhaA形成氢键的方式诱导其变性,并且能够与催化位点形成氢键,造成DhaA底物进出口通道长度增加、通道曲率增大、瓶颈尺寸减小;DMSO分子通过范德华作用进入DhaA疏水空腔,从而诱导DhaA变性,使得DhaA通道长度缩短、瓶颈尺寸增大,造成DhaA发生构象变化。该研究结果揭示了DhaA在两种体系中变性过程的区别,能够为DhaA的进一步稳定化提供理论指导。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 郑禾,杨盛江,郑永超,崔燕,郭旋,钟近艺,周健

关键词: 蛋白质变性,尿素,二甲基亚砜,分子动力学模拟

来源: 化工学报 2019年11期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 化学

单位: 国民核生化灾害防护国家重点实验室,华南理工大学化学与化工学院

基金: 国家自然科学基金项目(21776093)

分类号: O643.1

页码: 4337-4345+4518

总页数: 10

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