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湖北兴山大型子囊菌物种多样性和分子系统学研究

2020-12-08阅读(174)

湖北兴山大型子囊菌物种多样性和分子系统学研究

论文摘要

对于特定地区进行生物多样性调查研究,是开展生物多样性保护、物种生存状态评价和合理开发利用物种资源的重要基础性工作。大型子囊菌作为生物多样性的重要组成类群之一,对于特定区域的系统性调查研究却不多见。本研究对湖北省兴山县的大型子囊菌资源进行实地调查和评估,并根据获得的基因数据开展分子系统学研究,初步探究其遗传进化关系。本研究在兴山县6个乡镇20个地点进行调查和采集,横跨春夏秋三季,覆盖5种林型。采集共获得416份标本,隶属于4纲5目21科51属。鉴定到种的标本共339份,隶属于4纲5目20科48属96种,并编写兴山县大型子囊菌物种名录,鉴定到属、未鉴定到种的标本有77份。发现湖北省新记录40种;食用菌有10种,药用菌10种,食药兼用菌有4种,有毒菌有3种;土生、木生和虫生物种分别有44、43和10种。物种组成分析发现,物种数量最多的属为盘菌属Peziza,盘菌属Peziza是该县优势属。对兴山大型子囊菌地理分布分析发现,兴山县大型子囊菌物种发生多集中于海拔8001600 m、具有典型的亚热带常绿落叶阔叶混交林的区域,最具有代表性的地点是龙门河、万朝山和榛子乡等生态林地。本次研究测序了所有大型子囊菌材料的rDNA-ITS和LSU序列。结合NCBI公共数据库中的信息,采用贝叶斯法和最大似然法,构建兴山县大型子囊菌大部分类群的系统发育树,对盘菌属Peziza采用贝叶斯法、最大似然法、最大简约法进行系统发育学分析,甜盘菌Peziza succosa进行遗传多样性分析。结果表明,兴山县大型子囊菌生命之树支持或佐证了子囊菌一些单元的分类处理意见;盘菌属的系统发育学分析发现,兴山县盘菌属物种较为丰富;甜盘菌的遗传多样性研究发现,兴山县各地理区域基因流动频繁。本次研究结果补充了湖北省大型子囊菌资源信息,丰富了基因数据信息,充分认识了兴山县的大型子囊菌多样性,有利于兴山县大型子囊菌的科学保护和合理应用。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 符号说明
  • 第一章 文献综述
  •   1.1 大型子囊菌与生物多样性
  •   1.2 大型子囊菌物种多样性研究进展
  •   1.3 大型子囊菌分子系统学研究进展
  •   1.4 湖北省大型子囊菌研究进展
  •   1.5 湖北省兴山县大型子囊菌生长环境
  •   1.6 大型子囊菌的遗传多样性
  •   1.7 本研究的目的和技术路线
  • 第二章 兴山县大型子囊菌物种多样性
  •   2.1 实验材料
  •   2.2 实验设备与仪器
  •     2.2.1 野外调查所需试剂、仪器和工具
  •     2.2.2 实验室观察所需试剂、仪器或工具
  •   2.3 实验方法
  •     2.3.1 野外调查采集
  •     2.3.2 标本处理和保存
  •     2.3.3 分类和鉴定
  •   2.4 实验结果
  •     2.4.1 组成成分分析
  •     2.4.2 湖北省新记录种
  •     2.4.3 物种经济价值
  •     2.4.4 受威胁程度
  •     2.4.5 兴山县地理分布
  •     2.4.6 营养类型
  •     2.4.7 生长季节
  •   2.5 讨论
  • 第三章 兴山县大型子囊菌分子系统学研究
  •   3.1 实验材料
  •   3.2 实验设备与仪器
  •     3.2.1 试剂
  •     3.2.2 主要仪器
  •     3.2.3 所需试剂及培养基
  •   3.3 实验方法
  •     3.3.1 提取基因组DNA方法
  •     3.3.2 DNA质量检测方法
  •     3.3.3 rDNA扩增方法
  •     3.3.4 PCR扩增产物质量检测
  •     3.3.5 测序质量鉴定方法
  •     3.3.6 克隆测序方法
  •   3.4 系统发育分析方法
  •     3.4.1 序列拼接
  •     3.4.2 序列比对
  •     3.4.3 模糊比对序列处理
  •     3.4.4 替换饱和检验
  •     3.4.5 进化模型的选择
  •     3.4.6 建树及软件选择方法
  •     3.4.7 系统树编辑和修饰
  •   3.5 遗传多样性分析方法
  •   3.6 研究结果
  •     3.6.1 兴山县大型子囊菌系统发育树
  •     3.6.2 兴山县盘菌属系统发育学研究
  •     3.6.3 甜盘菌遗传多样性研究
  •   3.7 讨论
  •     3.7.1 兴山县大型子囊菌系统发育树
  •     3.7.2 兴山县盘菌属系统发育学研究
  •     3.7.3 甜盘菌遗传多样性研究
  • 第四章 全文总结
  • 附图
  • 参考文献
  • 在读期间发表的学术论文及研究成果
  • 致谢

    • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 王睿

    导师: 陈双林

    关键词: 兴山县,大型子囊菌,物种多样性,系统发育,遗传多样性

    来源: 南京师范大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 南京师范大学

    分类号: Q949.32

    DOI: 10.27245/d.cnki.gnjsu.2019.001067

    总页数: 88

    文件大小: 6973K

    下载量: 99

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