导读:本文包含了基因组进化论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因组,基因,病毒,登革热,小麦,乌拉尔,生物。
基因组进化论文文献综述
答嵘,王伟[1]（2019）在《柯萨奇病毒B5基因组进化存在结构蛋白编码区VP4的重组》一文中研究指出目的重组是肠道病毒进化的重要机制,大多数重组事件发生在包括P2和P3的肠道病毒的非编码区中,但是在埃可病毒30株中首次发现了作为蛋白质编码区的VP4区域中的重组,本研究旨在探讨柯萨奇病毒B5(CVB5)中是否存在类似的重组事件。方法从GenBank中检索CVB5的核苷酸序列,分别在5′UTR和VP1区域中进行系统发育分析。此外,跨越5′UTR-VP4-5′VP2的部分基因组用于检测重组并使用序列相似性作图(Similarity plot)来分析重组体。结果 5′UTR和VP1系统发育树显示5′UTR和VP1之间有4个病毒株位于不同簇中,表明这些病毒株中存在重组事件。Similarity plot分析表明,CVB5AY875692的5′UTR-VP4-5′VP2区域存在交叉,序列分析证明VP4区域存在重组位点。结论 CVB5在VP4区域具有重组事件,表明结构蛋白编码区亦可作为CVB5重组的候选基因位点。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2019年23期）
刘玥,陈守坤,王成微,李家伟,李海峰[2]（2019）在《水稻MYB-MYC基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析》一文中研究指出为了挖掘水稻MYB-MYC基因的功能,通过生物信息学手段对水稻MYB-MYC基因家族进行基因组水平的鉴定,并对其系统进化及表达模式进行分析。本研究在水稻中鉴定到17个MYB-MYC基因,根据系统进化树将它们划分为2个亚家族,不同亚组具有特异的保守基序和基因结构。通过对水稻MYB-MYC基因复制事件的分析发现水稻MYB-MYC基因共产生6个基因复制。此外,转录组数据分析发现水稻MYB-MYC基因在不同组织都存在表达且响应不同非生物胁迫。本试验为水稻MYB-MYC基因功能的研究提供了初步的理论基础。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年11期）
赵靓,白彩霞,王小朋,杨侃侃,张达[3]（2019）在《猪细小病毒6型全基因组克隆及遗传进化分析》一文中研究指出对猪细小病毒6型(PPV6)安徽分离株PPV6 AH进行全基因组序列克隆,并进行遗传进化树构建及同源性分析。将病毒基因分10段进行PCR扩增并测序,用SeqMan进行拼接,获得全基因组序列。将PPV6 AH株与GenBank中PPV6其他毒株进行遗传进化分析。结果显示,PPV6 AH基因组全长6 180 bp,与其他国内外15株PPV6全基因的核苷酸序列同源性达到97.1%～99.5%。基于PPV6全基因、NS1及Cap基因构建的遗传进化树显示PPV6 AH株与PPV6 BJ、BJ2、SC及JS株有着共同的进化起源。NS1基因第708、996、1 932核苷酸位点发生突变;Cap基因在第1 205、1 211、1 582、1 614核苷酸位点发生突变;Cap蛋白氨基酸在第402和404位点发生突变。本研究首次报道PPV6在安徽省猪群中存在,该研究结果为安徽地区PPV6的分子遗传进化特征提供了一定的参考。(本文来源于《江苏农业学报》期刊2019年05期）
任敏,屈勇刚,魏其,宋敏,谷思颖[4]（2019）在《新疆首次检测到猪圆环病毒3型及其全基因组进化分析》一文中研究指出为了解新疆某规模化猪场猪圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV-3)的流行现状、分子生物学特征和遗传演化规律,试验应用巢式PCR技术对新疆某规模化猪场的45份血液样本进行PCV-3基因检测和测序;利用TempliPhi 100 amplification Kit对检测到的PCV-3阳性样本进行全基因组扩增,将扩增得到的基因组片段克隆到Trans-T1载体中,经测序、拼接获得PCV-3基因组全长序列;利用MEGA 6. 0. 6和MegAlign软件对其全基因组进行遗传进化分析和同源性比较。结果表明:在新疆地区首次检测到PCV-3,且该猪场PCV-3的阳性率为20%(9/45),并获得PCV-3全基因组序列,长度为2 000 bp,命名为PCV-3/CN/Xinjiang-11/2018;与美国株PCV-3-US-SD 2016处于同一进化分支,属于3b亚群;与国内PCV-3/Pig/CN/Hebei20170320的同源性最高(99. 4%),与PCV-3-CN/Fujian-820-2016和PCV-3-CN/Fujian-318-2017的同源性最低(97. 8%),与国外美国株PCV-3-US-SD 2016的同源性最高(99. 1%)。说明新疆地区猪场已经存在PCV-3,应该引起养猪业的重视。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年21期）
金婉霞[5]（2019）在《十年内对所有真核生物完成基因测序》一文中研究指出“地球上的真核生物虽然肉眼无法可见，却足足有1200万至1500万种，堪比天上的繁星。”在昨天举行的未来国际大科学论坛上，进化基因学家哈里斯·李文以一组数据开场。随后，他话锋一转：生物学发展了300多年，可科学家只记录了这些“小东西”中的10%，而其中进(本文来源于《文汇报》期刊2019-10-31）
黄一伟,张斯钰,湛志飞,曾舸,黄超洋[6]（2019）在《2009-2018年湖南省甲型H1N1亚型流感病毒监测结果及其全基因组进化分析》一文中研究指出目的分析2009—2018年湖南省流感哨点医院甲型H1N1亚型流感监测结果,对分离病毒全基因组进化情况和分子特征进行分析。方法在全省14个市州的23家哨点医院开展流感监测工作,每周每家哨点医院门诊采集5～20份流感样病例的咽拭子标本进行核酸检测和/或病毒分离。对分离的毒株全基因测序,使用BEAST软件贝叶斯方法构建基因进化树,序列与疫苗株进行比较。结果 2009—2018年湖南省流感监测哨点医院共采集流感样病例标本190 289份,其中甲型H1N1流感阳性8 014份,阳性率为4.21%。时间分布共有7个较明显的流行高峰,峰值以2009年最高。1～5岁(占25.13%)和5～15岁(占32.83%)年龄组所占比重较多,人群男女性别比为1.23∶1。对分离的60株甲型H1N1亚型流感病毒进行同源性分析,与疫苗株相比全基因组序列的同源性在97.2%～99.9%之间。贝叶斯基因进化树呈现阶梯状生长。推断最早的公共祖先出现在2 009.177年,平均进化速率为2.695×10~(-3)个替换·位点~(-1)·年~(-1)。贝叶斯天际线模型分析甲型H1N1流感的种群动态2009—2018年间基本维持稳定。表面蛋白选择压力分析dN/dS值为0.201与0.219。表面蛋白血凝素分子的主要变异位点为L8M、S91R、S160G、S181T、A214T、I312V。2株病毒神经氨酸酶分子出现H275Y耐药位点的突变。结论 2009—2018年湖南省每年甲型H1N1流感阳性率和甲型H1N1流感所占流感比例各不相同,流行高峰出现在冬季,病例以儿童和少年为主,病毒基因持续变异,种群动态稳定。(本文来源于《疾病监测》期刊2019年10期）
田建华,马珍元,张新枝,王雪刚,黄呈辉[7]（2019）在《深圳市登革1型病毒株全基因组特征及系统进化分析》一文中研究指出目的对深圳市2014年登革病毒1型(DENV-1)流行株进行全基因序列测定,分析其分子病毒学特征,探讨其可能来源。方法采集2例登革热患者急性期血清标本,用BHK-21细胞培养分离病毒,RT-PCR进行病毒血清型别鉴定,并用RT-PCR进一步扩增全基因组序列,测序后进行同源性比较、系统进化树分析和遗传变异分析。结果 2例深圳DENV-1分离株进行全基因组测序结果显示同源性为100.0%,其基因组全长均为10 735 bp,编码3 329个氨基酸,与新加坡DENV-1流行株核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为99.3%和99.7%。全基因组序列系统进化分析显示,深圳DENV-1株为基因Ⅰ型,与Fujian2004、Zhuhai2007和Singpore2008的亲缘关系较近,均在同一进化分支上。与广州DENV-1株GZ/80相比,深圳2014年DENV-1分离株发生了碱基变异430个,氨基酸变异42个,5’UTR存在1处点突变,3’UTR序列共有8处位点发生变异。结论 2014年深圳市DENV-1株可能来源于东南亚一带。病毒在进化过程中出现一些位点变异,这些变异的生物学意义有待进一步研究。(本文来源于《热带医学杂志》期刊2019年09期）
史晓黎,何伊琳,凌宏清[8]（2019）在《小麦A基因组测序与进化研究进展》一文中研究指出小麦是世界上广泛种植的主要粮食作物,养活了全世界35%以上的人口。获取高质量的基因组图谱对于推动小麦基础理论和遗传育种研究至关重要。然而,庞大而复杂的基因组一度使小麦基因组测序被认为是"不可能完成的任务"。随着高通量测序和组装技术的成熟,近年来多个小麦基因组序列图谱陆续发布,序列组装质量日臻完善。仅最近两年就公布了5个不同倍性的小麦参考基因组序列,包括两个二倍体祖先种乌拉尔图小麦(Triticum urartu,AA)和粗山羊草(Aegilops tauschii,DD)、野生和栽培四倍体二粒小麦(T.turgidum ssp.dicoccoides, BBAA)和六倍体普通小麦(T. aestivum, BBAADD)。其中,作为多倍体小麦A亚基因组供体的乌拉尔图小麦基因组测序和分析是由中国科学院遗传与发育生物学研究所牵头完成。本文主要对小麦A基因组的结构解析和进化分析等方面的研究进展进行了综述,以期为相关领域的科研人员提供参考信息,促进小麦的基础和应用研究。(本文来源于《遗传》期刊2019年09期）
肖霜艳,吕殿红,温肖会,翟少伦,魏文康[9]（2019）在《山羊鼻内肿瘤病毒广东株的全基因组序列特征及遗传进化分析》一文中研究指出本研究通过临床初步诊断及RT-PCR技术，确诊了广东省某种羊场存在羊鼻内肿瘤病毒。通过全基因组扩增，得到一株全长为7446bp的ENTV-2毒株，命名为GDYX2019。结合GenBank中已有的ENTV-2、ENTV-1和JSRV毒株，对该毒株进行基因组同源性分析及系统进化树分析可知，GDYX2019与我国陕西、四川、重庆的ENTV-2毒株亲缘关系较近，与ENTV-1、JSRV毒株关系较远。(本文来源于《第十六届（2019）中国羊业发展大会暨庆阳农耕文化节论文集》期刊2019-09-16）
[10]（2019）在《我国科学家揭示香蕉亚基因组进化和功能分歧》一文中研究指出2019年7月15号,中国热带农业科学院热带生物技术研究所金志强、胡伟研究团队在《Nature Plants》上在线发表了题为"Musa balbisiana genome reveals subgenome evolution and functional divergence"的研究论文。该文报道了一种高质量的M. balbisiana基因组装配,为了解水果生物学提供了更多的背景,并有助于开发育种最佳香蕉品种的工具。(本文来源于《中国食品学报》期刊2019年08期）
基因组进化论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为了挖掘水稻MYB-MYC基因的功能,通过生物信息学手段对水稻MYB-MYC基因家族进行基因组水平的鉴定,并对其系统进化及表达模式进行分析。本研究在水稻中鉴定到17个MYB-MYC基因,根据系统进化树将它们划分为2个亚家族,不同亚组具有特异的保守基序和基因结构。通过对水稻MYB-MYC基因复制事件的分析发现水稻MYB-MYC基因共产生6个基因复制。此外,转录组数据分析发现水稻MYB-MYC基因在不同组织都存在表达且响应不同非生物胁迫。本试验为水稻MYB-MYC基因功能的研究提供了初步的理论基础。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因组进化论文参考文献
[1].答嵘,王伟.柯萨奇病毒B5基因组进化存在结构蛋白编码区VP4的重组[J].国际检验医学杂志.2019
[2].刘玥,陈守坤,王成微,李家伟,李海峰.水稻MYB-MYC基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析[J].西北农业学报.2019
[3].赵靓,白彩霞,王小朋,杨侃侃,张达.猪细小病毒6型全基因组克隆及遗传进化分析[J].江苏农业学报.2019
[4].任敏,屈勇刚,魏其,宋敏,谷思颖.新疆首次检测到猪圆环病毒3型及其全基因组进化分析[J].黑龙江畜牧兽医.2019
[5].金婉霞.十年内对所有真核生物完成基因测序[N].文汇报.2019
[6].黄一伟,张斯钰,湛志飞,曾舸,黄超洋.2009-2018年湖南省甲型H1N1亚型流感病毒监测结果及其全基因组进化分析[J].疾病监测.2019
[7].田建华,马珍元,张新枝,王雪刚,黄呈辉.深圳市登革1型病毒株全基因组特征及系统进化分析[J].热带医学杂志.2019
[8].史晓黎,何伊琳,凌宏清.小麦A基因组测序与进化研究进展[J].遗传.2019
[9].肖霜艳,吕殿红,温肖会,翟少伦,魏文康.山羊鼻内肿瘤病毒广东株的全基因组序列特征及遗传进化分析[C].第十六届（2019）中国羊业发展大会暨庆阳农耕文化节论文集.2019
[10]..我国科学家揭示香蕉亚基因组进化和功能分歧[J].中国食品学报.2019
论文知识图
