导读:本文包含了同源四倍体论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:四倍,多倍体,黑皮,水稻,冬瓜,花粉,草棉。
同源四倍体论文文献综述
李翔,于航,吴锦文,Muhammad,Qasim,Shahid,刘向东[1]（2019）在《全基因组DNA多态性、甲基化和转录组分析揭示同源四倍体水稻花粉低育性的潜在原因》一文中研究指出【研究背景】同源四倍体水稻是一种具有高生物产量的新种质,然而,低育性是限制其在生产上直接利用的主要原因。减数分裂基因在有性生殖中至关重要,此类基因的序列变异及表达模式改变会导致减数分裂异常。研究表明,减数分裂相关mi RNAs的差异表达与同源四倍体水稻的花粉不育性关系密切。但是,同源四倍体水稻低育性的全基因组变异和甲基化分析仍未见报道。因此,本研究利用高测量测序对同源四倍体水稻的花粉发育过程进行全基因组和甲基化,并结合转录组进行联合分析,以阐明同源四倍体水稻低育性原因;【材料与方法】供试材料为同源四倍体水稻02428-4x和二倍体原种02428-2x,选取四叶期叶片,以CTAB方法提取高质量DNA进行重测序分析。根据花药大小挑选处于减数分裂间期,减数分裂期以及单核小孢子期的花药进行转录组测序分析。减数分裂期的花药同时进行甲基化免疫共沉淀测序分析;【结果与分析】重测序分析发现,与二倍体原种相比,同源四倍体水稻02428-4x共存在1003个SVs,25个CNVs,34416个SNPs和6993个InDels,在这些插入缺失突变位点中,仅有8个基因涉及纯合突变。甲基化免疫共沉淀测序分析发现,与二倍体水稻比较,02428-4x在全基因组甲基化水平上发生巨大变化,其中有11367和41117个区域分别差异高甲基化和低甲基化表达,进一步分析发现涉及转座子基因的7153个区域发生低甲基化表达现象。低甲基化转座子可诱发转座子高度转录,使转座子在同源四倍体水稻花粉母细胞减数分裂中的水平失衡,导致基因组不稳定性。在02428-4x的花粉减数分裂过程中,共检测到313个和352个基因在此时期特异表达上调和下调,其中下调基因富集在转录因子活性的途径。这些减数分裂差异基因中有6个存在CNV,包括4个上调的基因发生拷贝数获得现象,如LOC_Os11g38620。进一步与前人研究结果比对发现122个基因可能与同源四倍体水稻花粉低育性相关。在这122个基因中,98个存在差异甲基化并且发现差异表达,包括CYP703A3和OsABCG26等花粉发育重要基因。通过定量PCR验证,这两个基因的确在同源四倍体水稻02428-4x的花粉减数分裂过程较二倍体原种下调表达,与花粉败育紧密相关;【结论】以上结果认为,同源四倍体水稻的低育性不仅与花粉发育相关基因的差异表达有关,基因序列的变异和差异甲基化也会对其育性造成影响。表明同源四倍体水稻花粉败育的复杂性,可能受多因素影响所造成的。(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27）
关秋竹,孙清荣,孙洪雁[2]（2019）在《西洋梨二倍体及同源四倍体的转录组差异分析》一文中研究指出通过RNA-Seq技术对同源四倍性的西洋梨及其二倍体亲本进行转录组测序及比较,拟揭示西洋梨同源多倍体形成过程基因的转录水平的改变,为深入理解西洋梨四倍体的表型变异、重要性状关键调控基因的克隆和西洋梨基因工程育种提供参考。试材为田间网室内5年生二倍体梨‘丰产’(Pyrus communis L.‘Fertility’)及其同源四倍体株系。叶片组织总RNA提取利用天根生物科技有限公式(北京)的多糖多酚植物总RNA提取试剂盒,用生物分析仪(Bioanalyser 2100,Agilent,美国)检测样本总RNA浓度及质量。合格的RNA由北京诺禾致源公司完成cDNA文库的构建及转录组测序。设置3次生物学重复。对获得的原始数据进行生物信息学分析,以padj <0.05为标准筛选差异基因;使用在线分析系统Plant Met Gen MAP对差异基因进行生物功能(GO)和代谢通路(Pathway)分析。从分析结果中随机选择12个差异表达基因利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对测序结果进行验证。每个样本均获得了超过2100万的高质量的Reads,其中超过87.79%高质量Reads注释到参考基因组。对转录组数据差异表达进行分析,筛选得到600个差异表达基因,其中229个基因上调表达,371个下调。GO分析表明四倍体与二倍体的差异表达基因主要集中在生物过程(Biological process)和分子功能(Molecularfunction)两个功能区,对细胞组分(Cellularcomponent)功能区基因的调控作用不大。Pathway分析显示西洋梨四倍体与二倍体在雌激素信号通路(Estrogen signaling pathway)、内质网蛋白质加工(Protein processing in endoplasmic reticulum)、NOD样受体信号通路(NOD-like receptor signaling pathway)、抗原处理和表示信号通路(Antigen processing and presentation)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Aktsignalingpathway)、单萜类生物合成(Monoterpenoid biosynthesis)、硫代谢(Sulfurmetabolism)、半胱氨酸和蛋氨酸代谢(Cysteineandmethionine metabolism)、硒复合代谢(Selenocompound metabolism)、类黄酮生物合成(Flavonoid biosynthesis)、昼夜节律(Circadianrhythm)、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢(Alanine,aspartateandglutamate metabolism)等途径差异显着,推测这些代谢途径中差异基因的表达变化可能与西洋梨同源四倍体在表型和生理上的变化有关。最终,qRT-PCR分析表明转录组测序结果是可靠的。转录组测序获得大量生物信息学信息,为进一步研究同源四倍体西洋梨功能基因奠定了基础。此外,西洋梨二倍体及其同源多倍体的基因表达谱能够为植物多倍体化研究提供有价值的资料。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21）
武娅歌,赵建华,宋晓飞,李晓丽,孙成振[3]（2019）在《欧洲温室型黄瓜同源四倍体新种质的创制与鉴定》一文中研究指出为构建黄瓜同源四倍体诱导技术体系,创制新种质,以3个秋水仙素浓度(0.1、0.2、0.3 g/L)3个处理次数(3、5、7次)对二倍体欧洲温室型黄瓜(2n=2x=14)幼苗生长点进行处理,通过植株形态鉴定与气孔鉴定、DNA相对含量鉴定和细胞学鉴定等方法,筛选诱变植株并鉴定倍性。研究发现,以2、3 g/L秋水仙素处理5次诱导效果较好,获得了欧洲温室型黄瓜同源四倍体(2n=4x=28)和非整倍体(2n=4x=26)。与二倍体亲本相比,同源四倍体黄瓜子叶大小、叶片大小、主茎粗、雌雄花大小、保卫细胞大小和保卫细胞内叶单位面积绿体数目等均呈极显着增加,但气孔密度极显着减少。本研究获得了欧洲温室型黄瓜同源多倍体新种质,为黄瓜种质创新与欧洲温室型新品种选育奠定了基础。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年18期）
万正林,周艳霞,武鹏,邓俭英,李立志[4]（2019）在《同源四倍体及其原二倍体黑皮冬瓜光合光响应模型筛选》一文中研究指出为了筛选出最适合黑皮冬瓜Benincasa hispida (Thunb.) Cogn.的光合光响应模型,为其育种提供理论依据,以同源四倍体及其原二倍体黑皮冬瓜为试验材料,对8种经典的光合光响应模型适用性进行了比较分析。结果表明:二次多项式能够表现出光抑制情况,但在拟合过程中出现暗呼吸速率为正值、光补偿点为负值及无法解释当光强达到饱和后光合速率快速下降的问题;直角双曲线、非直角双曲线及指数函数Ⅰ、指数函数Ⅱ无法直接求取光饱和点、光补偿点,结合常用的光饱和点的计算方法得到的光饱和点与实测值均存在较大的偏差,且指数函数Ⅱ在计算光饱和点时表现出明显的人为性,也无法拟合光抑制情况,但4种模型拟合得到的光补偿点均与实测值相差不大;指数修正模型因系数β为负值,无法求取四倍体黑皮冬瓜材料的光饱和点和最大净光合速率,且拟合得到的四倍体黑皮冬瓜的光补偿点明显低于实测值;直角双曲线修正模型计算得到的暗呼吸速率及二倍体黑皮冬瓜的光饱和点明显低于实测值,但获得的四倍体及其二倍体的最大净光合速率与实测值最接近,说明其在拟合最大净光合速率上有优势;整体上分段函数计算得到的黑皮冬瓜的各光合参数与实测值最为接近,与实测值的平均相对误差最小,也能很好的拟合发生光抑制部分的光响应曲线。分段函数拟合同源四倍体及其原二倍体黑皮冬瓜光合光响应曲线效果较其他模型效果好,分段函数模型为黑皮冬瓜最适合的光合光响应模型。(本文来源于《热带作物学报》期刊2019年10期）
李昱樱,申状状,荣二花,郑赟,吴玉香[5]（2019）在《草棉同源四倍体的诱导与鉴定》一文中研究指出[目的]本研究旨在将二倍体草棉加倍成同源四倍体,获得能够结铃并且育性稳定的同源四倍体,这对于棉花的种质创新和下一步远缘杂交遗传育种具有重要意义。[方法]以二倍体草棉(Gossypium herbaceum L.)为材料,采用改良初生分生组织处理法对其进行多倍体诱变,并对获得的草棉突变型进行形态学、细胞遗传学和流式细胞仪倍性鉴定。[结果]形态性状表明:突变型与野生型相比具有较强的生长势,植株矮壮,叶片颜色浓绿,且叶片皱缩、增厚,茎干较野生型粗,统计分析表明突变型与野生型存在显着差异(P<0.05)。流式细胞仪测定结果显示:突变型的峰值位于400,而野生型峰值位于200,表明突变型DNA含量为野生型的二倍。细胞学结果表明:野生型染色体数为26,突变型染色体数为52,直观证明突变型为四倍体。气孔统计分析表明:突变型和野生型的叶片下表皮气孔密度、保卫细胞长度也存在显着差异,突变型气孔密度比野生型降低25.29%,突变型保卫细胞比野生型长度增加32.86%。[结论]本研究获得的草棉突变型为同源四倍体,为棉花遗传育种研究和种质创新提供了有价值的材料。(本文来源于《山西农业大学学报(自然科学版)》期刊2019年06期）
李萌,郭烨,刘松珊,庞晓明,李颖岳[6]（2019）在《二倍体及其同源四倍体酸枣的生理特征和转录组分析》一文中研究指出【目的】研究酸枣基因组复制后分子水平的变异机制,为深入探讨枣树多倍体性状、关键调控基因的克隆及基因工程育种提供参考。【方法】本实验以二倍体及其同源四倍体酸枣为研究材料,比较了二者的叶片相对含水量、叶绿素含量、可溶性糖含量以及可溶性蛋白质含量,对两种材料进行了转录组测序,并参考GO Ontology、KEGG等数据库对差异基因和转录因子进行功能分类与富集分析。【结果】四倍体的叶绿素含量、可溶性糖含量和可溶性蛋白质含量均显着高于二倍体植株,叶片相对含水量在两种材料中没有显着差异。二倍体与四倍体酸枣共1 329个基因具有显着差异,GO功能分析表明这些差异基因主要参与生长发育和胁迫耐受相关功能。KEGG通路分析显示,大部分差异基因富集在碳水化合物代谢、氨基酸代谢和信号传递过程,其中16个关键基因参与糖和氨基酸的代谢与转运过程,如SPS2、GAE6和PGDH3,这些基因在四倍体中具有较高的表达量;23个基因参与激素信号传导通路,其中与生长素传导、应答相关的基因如ARG7,GH3.6和IAA26在四倍体植株中表达量较高,而与油菜素内酯合成酶(CYP)、乙烯不敏感蛋白(EIN)相关的基因在四倍体植株中表达量较低。在对二倍体与四倍体差异转录因子的分析中发现,四倍体MYB转录因子家族基因表达量高于二倍体。【结论】四倍体叶片叶绿素含量高是植株叶色加深的原因之一,可溶性糖、可溶性蛋白质含量高为四倍体叶片变大、茎加粗提供了更多能源物质。参与糖、氨基酸代谢和激素合成、信号传导的关键基因在二倍体与四倍体中差异表达,可能与四倍体植株体内能源物质含量高、生长势强的性状相关;具有渗透调节功能的基因在四倍体中表达量较高暗示着四倍体可能具有较强的抗性。进一步对差异转录因子的分析表明,MYB转录因子在二倍体与四倍体植株中的差异表达可能会导致植物在生长发育、形态建成和抗逆过程中的差异,但二者的具体差异性状还需进一步的实验研究。(本文来源于《北京林业大学学报》期刊2019年07期）
万正林,武鹏,周艳霞,邓俭英,李立志[7]（2019）在《同源四倍体及起源二倍体黑皮冬瓜营养品质与耐贮性比较》一文中研究指出以同源四倍体及起源二倍体黑皮冬瓜果肉为试验材料,测定其在采收期及经过常温贮藏30 d后的含水量、干物质含量、维生素C含量、可溶性蛋白含量、可溶性总糖含量、果肉硬度及肉质致密性等指标,比较二者的营养品质及耐贮性差异。结果表明,同源四倍体黑皮冬瓜果肉在采收期及常温贮藏30 d后的干物质含量、维生素C含量、可溶性蛋白含量、可溶性总糖含量、果肉硬度、肉质致密性显着或极显着高于起源二倍体黑皮冬瓜,含水量显着或极显着低于起源二倍体黑皮冬瓜;随黑皮冬瓜倍性的增加,采收期时冬瓜果肉中的粗纤维含量相对较高,但对食用品质影响不大。因此,同源四倍体黑皮冬瓜的营养品质及耐贮性明显优于起源二倍体,可作为商品品种直接用于生产或作为育种中间材料以培育品质更加优良的新品种。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年08期）
单折[8]（2019）在《同源四倍体水稻的花粉、胚囊发育特征及双受精过程研究》一文中研究指出水稻是重要的粮食作物之一,有关水稻的研究一直未曾停歇,获取高产量和高品质的水稻品种,一直是科学家坚持不懈追求的目标。普通水稻的育种已遇到瓶颈。有育种学家发现水稻染色体加倍后产生的剂量效应具有提高水稻产量、品质的潜力。本文以不同倍性水稻为材料,对它们的农艺性状和生殖发育特性进行了研究,以期为多倍体水稻的育种提供理论依据。本研究以5份二倍体水稻和通过秋水仙素对其进行染色体加倍得到的后代性状稳定的相应的同源四倍体水稻为试验材料,对其株高、穗长、剑叶长、剑叶宽、穗实粒数、结实率、籽粒长、籽粒宽和千粒重等农艺性状进行差异性比较分析,并通过激光共聚焦显微镜对不同倍性水稻的花粉育性和花粉发育特征、胚囊育性和胚囊发育特征、花粉管的生长动态和双受精过程等进行了观察研究。主要研究结果如下:1.不同倍性水稻在农艺性状上存在显着性的差异。水稻的株高在染色体加倍后都呈现降低趋势,且不同倍性水稻之间达到极显着差异。紫米4x的降低幅度最大,降幅为40.40%。穗长的变化趋势并不统一,但不同倍性水稻之间达到显着或极显着差异。剑叶长的变化趋势并不统一,只有圭6304x和紫粳4x的剑叶长随着染色体加倍是增加的,并且达到了显着性差异。剑叶宽的变化趋势是统一的,都呈现增加趋势。同源四倍体水稻穗实粒数和结实率明显小于二倍体水稻,且达到了极显着差异。同源四倍体水稻的千粒重有明显的优势,高于其相对应的二倍体水稻。在水稻的粒长、粒宽两个性状中,四倍体水稻与二倍体水稻相比,大部分都呈现上升趋势且达到极显着差异,只有双胚苗4x在宽度水平上是降低的。由此可见,不同倍性水稻之间的农艺性状存在着明显的差异。2.对同源四倍体水稻和相应的二倍体水稻的花粉发育过程观察表明,不同倍性水稻的花粉发育过程一致。在同源四倍体水稻减数分裂时期,观察到多种的异常现象,如纤维素壁未完全降解、子细胞分裂不同步、形成T型四分体等,这可能是导致后期花粉败育的原因。在同源四倍体水稻雄配子发生过程中,出现细胞质不同形式的浓缩、无核的空花粉粒、细胞壁褶皱等异常情况。同源四倍体水稻在成熟花粉时期产生了更高频率的败育花粉,花粉败育率高达51.74%左右。通过对正常花粉粒直径统计发现,同源四倍体水稻花粉粒直径明显高于二倍体水稻,且达到了极显着差异。花粉粒直径的增大可能与染色体加倍有关。染色体加倍后,同源四倍体水稻出现了一定比率的双萌发孔甚至叁萌发孔现象,二倍体水稻未出现双萌发孔现象。3.对不同倍性水稻的胚囊形成过程观察,不同倍性水稻的胚囊形成过程一致。其中,在胚囊成熟期,二倍体水稻的正常胚囊所占比例较高,正常胚囊的频率在93.45%-98.32%,而同源四倍体水稻正常胚囊的频率仅有50.12%-75.62%,约有24.38%-49.88%的胚囊在发育过程中发生异常(如卵器退化、雌性生殖单位结构退化和反足细胞团异常等)。4.在不同倍性水稻的双受精作用过程中,观察到不同倍性水稻的双受精过程是一致的,但由于同源四倍体水稻花粉粒在柱头上萌发比较慢,花粉管在其花柱中的伸入速度比较迟缓,进而花粉管进入胚囊、双受精完成、合子和初生胚乳核完成第一次分裂的时间与二倍体水稻相比都会比较迟。花粉管在柱状上萌发出现了一定比率的异常情况,包括花粉管异常膨大,双花粉管萌发等。本研究通过对同源四倍体及其对应二倍体水稻观察研究发现,染色体加倍后,其农艺性状与二倍体相比有很大差异。同源四倍体水稻的粒长、粒宽和千粒重明显优于相应二倍体水稻,但结实率明显下降。不同倍性水稻的花粉发育及胚囊发育过程一致。但同源四倍体水稻在成熟花粉时期产生了更高频率的败育花粉及异常胚囊。另外,同源四倍体水稻受精过程中,受精过程会比二倍体水稻延迟,甚至花粉管萌发过程中出现异常膨大。以上原因很可能是导致同源四倍体水稻结实率低下的直接原因。需要特别提出的是,在四倍体水稻花粉发育过程中发现了一定比率的双萌发孔甚至叁萌发孔现象,在受精过程中,有的花粉会从双萌发孔萌发出两个花粉管,有的从双萌发孔只有一条花粉管萌发。有关多萌发孔现象及其萌发机理有待进一步的研究。(本文来源于《郑州大学》期刊2019-04-01）
刘琪文[9]（2019）在《源于远缘杂交的同源四倍体鱼育性及HPG轴相关基因的表达研究》一文中研究指出远缘杂交不仅能增加杂交后代的遗传变异,还能获得不同倍性的后代。红鲫(Carassius auratus red var.)(2n=100,♀)与团头鲂(Megalobrama amblycephala)(2n=48,♂)远缘杂交培育出两性可育的同源四倍体鱼,通过多代自交后形成了世界首例两性可育的同源四倍体鱼品系(F_2~F_(13))。鱼类的性腺发育与配子成熟主要受到脑—垂体—性腺轴(HPG)为核心的神经和内分泌系统调控。促性腺激素释放激素(GnRH)、促性腺激素(GtH)和促性腺激素受体(GTHR)作为HPG轴上的主要信号分子参与整个调控过程,共同促进性腺发育成熟。同源四倍体鱼源于红鲫的全基因组复制,育性与红鲫一样均为一年性成熟。本研究采用组织学、分子生物学和免疫荧光技术,首次对源于远缘杂交的同源四倍体鱼育性及其HPG轴相关基因Gnrh2、Fshβ、Lhβ、Fshr和Lhr的基因结构及表达特征进行了分析。主要内容及结果如下:1.通过组织学切片,对同源四倍体鱼和红鲫繁殖期垂体结构及不同发育时期的性腺结构进行了比较分析,结果表明同源四倍体鱼的垂体和性腺组织具有正常结构,而且同源四倍体鱼与其原始母本红鲫性腺发育基本同步。这一研究从细胞水平上阐述了同源四倍体鱼具有良好的育性基础。2.Gnrh2、Fshβ、Lhβ、Fshr和Lhr基因cDNA部分序列克隆及遗传分析结果表明,Fshβ、Lhβ和Fshr基因编码区序列在两种鱼中的相似度为100%,而Gnrh2和Lhr基因存在明显的碱基位点突变。这一研究表明,Fshβ、Lhβ和Fshr基因的编码区序列在同源四倍体鱼和红鲫中具有高度的保守性,而Gnrh2和Lhr基因在同源四倍体化后表现出明显的基因结构分化。这种变化可能为二倍体化的染色体配对提供物质基础,有利于同源四倍体鱼育性的恢复。3.通过RT-PCR比较分析Gnrh2、Fshβ、Lhβ、Fshr和Lhr基因在同源四倍体鱼不同组织中的表达情况发现,Gnrh2基因不仅在脑中有表达,在垂体、卵巢和精巢中也检测到表达;Fshβ和Lhβ基因只在垂体中检测到表达;Fshr和Lhr基因在精巢和卵巢中检测到表达。这一表达情况与红鲫中表达结果相似。通过Real-time PCR比较分析了Gnrh2、Fshβ、Lhβ、Fshr和Lhr基因在两种鱼的繁殖期和非繁殖期的表达量水平情况,发现这五个基因在同源四倍体鱼中的表达水平比在红鲫中高。实验结果说明同源多倍体化后,这五个基因的主要表达特征没有发生明显变化,但基因表达水平产生显着差异,而这种表达水平的改变可能与同源四倍体鱼的育性恢复有关。4.通过免疫荧光实验观察了Fshr和Lhr在同源四倍体鱼和红鲫性腺中的定位,发现Fshr和Lhr在同源四倍体鱼的卵巢颗粒细胞和滤泡细胞中都能检测到信号,在精巢Sertoli细胞和Leydig细胞也都能检测到信号。而且Fshr和Lhr在同源四倍体鱼中的结果与红鲫一致,进一步说明了同源四倍体化后的鲫鱼中生殖发育相关基因Fshr和Lhr的表达特征没有发生明显变化。(本文来源于《湖南师范大学》期刊2019-03-01）
魏跃,王栋,王媛花,贾思振,颜志明[10]（2019）在《同源四倍体矮牵牛的核型分析及有丝分裂观察》一文中研究指出探明同源四倍体矮牵牛细胞学特性,为观赏花卉的细胞学研究提供新途径。以四倍体矮牵牛幼嫩柱头为材料,采用常规压片法进行核型分析和有丝分裂观察。结果表明:四倍体矮牵牛核型公式为K(2n)=4x=28=16m+12sm(4SAT),染色体相对长度组成为2n=28=12M1+16M2,核型分类为2A型,属于较原始类型;四倍体有丝分裂过程中少量细胞存在微核仁、同源染色体配对、赤道板外染色体、落后及丢失染色体、染色体桥、染色体凝集粘合和非整倍体等异常现象。(本文来源于《贵州农业科学》期刊2019年02期）
同源四倍体论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
通过RNA-Seq技术对同源四倍性的西洋梨及其二倍体亲本进行转录组测序及比较,拟揭示西洋梨同源多倍体形成过程基因的转录水平的改变,为深入理解西洋梨四倍体的表型变异、重要性状关键调控基因的克隆和西洋梨基因工程育种提供参考。试材为田间网室内5年生二倍体梨‘丰产’(Pyrus communis L.‘Fertility’)及其同源四倍体株系。叶片组织总RNA提取利用天根生物科技有限公式(北京)的多糖多酚植物总RNA提取试剂盒,用生物分析仪(Bioanalyser 2100,Agilent,美国)检测样本总RNA浓度及质量。合格的RNA由北京诺禾致源公司完成cDNA文库的构建及转录组测序。设置3次生物学重复。对获得的原始数据进行生物信息学分析,以padj <0.05为标准筛选差异基因;使用在线分析系统Plant Met Gen MAP对差异基因进行生物功能(GO)和代谢通路(Pathway)分析。从分析结果中随机选择12个差异表达基因利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对测序结果进行验证。每个样本均获得了超过2100万的高质量的Reads,其中超过87.79%高质量Reads注释到参考基因组。对转录组数据差异表达进行分析,筛选得到600个差异表达基因,其中229个基因上调表达,371个下调。GO分析表明四倍体与二倍体的差异表达基因主要集中在生物过程(Biological process)和分子功能(Molecularfunction)两个功能区,对细胞组分(Cellularcomponent)功能区基因的调控作用不大。Pathway分析显示西洋梨四倍体与二倍体在雌激素信号通路(Estrogen signaling pathway)、内质网蛋白质加工(Protein processing in endoplasmic reticulum)、NOD样受体信号通路(NOD-like receptor signaling pathway)、抗原处理和表示信号通路(Antigen processing and presentation)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Aktsignalingpathway)、单萜类生物合成(Monoterpenoid biosynthesis)、硫代谢(Sulfurmetabolism)、半胱氨酸和蛋氨酸代谢(Cysteineandmethionine metabolism)、硒复合代谢(Selenocompound metabolism)、类黄酮生物合成(Flavonoid biosynthesis)、昼夜节律(Circadianrhythm)、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢(Alanine,aspartateandglutamate metabolism)等途径差异显着,推测这些代谢途径中差异基因的表达变化可能与西洋梨同源四倍体在表型和生理上的变化有关。最终,qRT-PCR分析表明转录组测序结果是可靠的。转录组测序获得大量生物信息学信息,为进一步研究同源四倍体西洋梨功能基因奠定了基础。此外,西洋梨二倍体及其同源多倍体的基因表达谱能够为植物多倍体化研究提供有价值的资料。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
同源四倍体论文参考文献
[1].李翔,于航,吴锦文,Muhammad,Qasim,Shahid,刘向东.全基因组DNA多态性、甲基化和转录组分析揭示同源四倍体水稻花粉低育性的潜在原因[C].2019年中国作物学会学术年会论文摘要集.2019
[2].关秋竹,孙清荣,孙洪雁.西洋梨二倍体及同源四倍体的转录组差异分析[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019
[3].武娅歌,赵建华,宋晓飞,李晓丽,孙成振.欧洲温室型黄瓜同源四倍体新种质的创制与鉴定[J].江苏农业科学.2019
[4].万正林,周艳霞,武鹏,邓俭英,李立志.同源四倍体及其原二倍体黑皮冬瓜光合光响应模型筛选[J].热带作物学报.2019
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[6].李萌,郭烨,刘松珊,庞晓明,李颖岳.二倍体及其同源四倍体酸枣的生理特征和转录组分析[J].北京林业大学学报.2019
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