黄秋葵八氢番茄红素脱氢酶基因的克隆与分析

黄秋葵八氢番茄红素脱氢酶基因的克隆与分析

论文摘要

该研究根据黄秋葵(Hibiscus esculentus L.)转录组测序获得的八氢番茄红素脱氢酶基因(HePDS)序列(GenBank登录号为MG372370)设计引物,克隆验证得到1条HePDS基因全长为2 020 bp cDNA,开放阅读框(ORF)包含1 686个碱基;预测其编码561个氨基酸,理论分子量为62.62 kD,等电点为8.155;编码的蛋白与海岛棉(Gossypium barbadense)、雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)、陆地棉(Gossypium hirsutum)同源蛋白的相似性均在93%以上,均含有1个保守的二核苷酸结合域和1个类胡萝卜素结合域,显示其高度的保守性。荧光定量PCR分析表明,HePDS基因在黄秋葵根、茎、叶、花和果荚中均有表达;叶发育过程以嫩叶中表达最高,果实发育中以花后2 d表达量最高。类胡萝卜素含量随着叶、果实发育逐渐升高,成熟叶的含量最高,果实以花后4 d含量最高,且HePDS基因的表达与类胡萝卜素含量存在密切的相关性。该研究结果为进一步探讨HePDS基因的功能和调控机制,以及采用VIGS和CRISPR/Cas9技术开展黄秋葵基因功能的反向遗传学研究奠定了基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 方 法
  •     1.2.1 转录组数据来源
  •     1.2.2 总RNA提取及cDNA合成
  •     1.2.3 HePDS基因序列的克隆验证
  •     1.2.4 HePDS基因的生物信息学分析
  •     1.2.5 HePDS基因的实时荧光定量分析
  •     1.2.6 类胡萝卜素提取和测定
  • 2 结果与分析
  •   2.1 HePDS基因克隆与验证
  •   2.2 HePDS基因序列的生物信息分析
  •   2.3 HePDS基因的表达分析
  •     2.3.1 在黄秋葵不同品种和组织中的表达
  •     2.3.2 在黄秋葵叶片发育过程中的表达
  •     2.3.3 在黄秋葵果实发育过程中的表达
  •   2.4 黄秋葵类胡萝卜素含量测定
  •     2.4.1 不同品种黄秋葵各组织类胡萝卜素含量差异分析
  •     2.4.2 叶片生长发育过程类胡萝卜素含量差异分析
  •     2.4.3 果实发育过程中类胡萝卜素含量差异分析
  • 3 讨 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李永平,王彬,陈敏氡,刘建汀,朱海生,温庆放

    关键词: 黄秋葵,八氢番茄红素脱氢酶,类胡萝卜素

    来源: 西北植物学报 2019年07期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,园艺

    单位: 福建省农业科学院作物研究所蔬菜研究中心福建省蔬菜工程技术研究中心

    基金: 福建省属公益类科研院所基本科研专项(2019R1026-9),中央引导地方科技发展专项(2018L3005),福建省农业科学院科技创新团队建设项目(STIT2017-1-2),国家大宗蔬菜产业技术体系福州综合试验站(CARS-23-G-53),国家特色蔬菜产业技术体系福州综合试验站(GARS-24-G-07)

    分类号: S649;Q943.2

    页码: 1195-1202

    总页数: 8

    文件大小: 3564K

    下载量: 196

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