导读:本文包含了儿丁质酶基因论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,基因组,家族,霉菌,小麦,家蝇,信息学。
儿丁质酶基因论文文献综述
徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽[1]（2019）在《小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析》一文中研究指出对小麦几丁质酶基因家族成员进行鉴定,并对其基因结构、保守基序、染色体分布、系统进化及禾谷镰刀菌胁迫下的表达水平进行分析,为进一步研究几丁质酶基因在小麦应答各种生物胁迫中的作用和在抗病分子育种中的应用奠定基础。结果表明,从小麦基因组中共鉴定到159个几丁质酶基因,分布在21条染色体上;小麦几丁质酶基因家族成员分为5类,隶属于GH-18和GH-19两个亚家族。GH-18亚家族包括Ⅲ、Ⅴ类,分别含有34、48个基因;GH-19亚家族包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ类,分别包含52、13、12个基因。同一亚家族的成员聚类在同一分支上,并且具有相似的外显子-内含子基因结构和保守基序。在被禾谷镰刀菌侵染后,4个小麦品系中几丁质酶基因家族一些成员的表达均显着上调。(本文来源于《河南农业科学》期刊2019年11期）
宋柳,吕建建,王磊,孙东方,刘萍[2]（2019）在《叁疣梭子蟹几丁质酶基因(PtCht6)的克隆及其在免疫中的功能分析》一文中研究指出几丁质酶(chitinase)在甲壳动物的蜕皮、消化和免疫等很多生物学过程中发挥重要功能,为深入探讨几丁质酶的免疫防御机制,本实验利用RACE技术克隆了叁疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)PtCht6基因。该基因cDNA全长2736bp,开放阅读框(ORF)2103bp,编码700个氨基酸,具有几丁质酶GH18家族典型特征。利用实时荧光定量技术分析PtCht6在叁疣梭子蟹不同组织、不同蜕皮阶段、不同病原感染以及低盐胁迫(11)下的表达特征,结果显示:PtCht6在各组织中均有表达且在肝胰腺中的表达量最高;在不同蜕皮时期的肝胰腺中,其表达量由蜕皮后期(A/B)、蜕皮间期(C)、蜕皮前期(D)依次递减(P<0.05);人工感染WSSV和副溶血弧菌后.PtCht6的表达量在肝胰腺中分别于12h、72h达到最大值,在血细胞中均于12h达到最大值,且相较于对照组,整体显着上调表达(P<0.05);低盐胁迫能够显着抑制该基因的表达,最高抑制73倍(P<0.05)。同时发现,低盐环境下感染WSSV后,该基因达到峰值的时间明显延迟(至少延迟12h.P<0.05)。该研究结果预示PtCht6作为免疫因子参与叁疣梭子蟹的病原防御,且低盐胁迫在一定程度上抑制了该基因的免疫功能。(本文来源于《海洋与湖沼》期刊2019年05期）
杨晋明,王铭,杜建中[3]（2019）在《转几丁质酶基因甜瓜植株的获得及生物学鉴定》一文中研究指出以农杆菌介导法将水稻几丁质酶基因导入甜瓜品种"雪脆蜜2号",PCR检测发现目的基因业已导入甜瓜植株,Southern blot杂交分析证明目的基因已整合到转基因甜瓜植株的染色组上,即获得了甜瓜转基因植株;田间抗病的生物学鉴定结果证明转基因植株提高了对白粉病的抗性,同对照比较,抗性提高2～4级,转基因甜瓜植株的其它农艺性状与阴性对照基本一致。结论为通过转基因技术能够筛选和培育出高抗白粉病的甜瓜新品种。(本文来源于《中国农业文摘-农业工程》期刊2019年05期）
陶小买,曾丽娜,贾化可,张婷婷,任建国[4]（2019）在《短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究》一文中研究指出采用生物信息学方法分析短短芽孢杆菌GZDF3菌株几丁质酶BBChi4基因,以GZDF3菌株全基因组DNA为模版设计特异性引物,通过PCR扩增出BBChi4基因的全序列并对其测序验证。将测序验证无误的基因序列连接到原核表达载体(pET-28a),构建重组表达载体pET-28a-BBchi4,转入大肠杆菌BL21进行诱导表达,利用打孔法对诱导表达产物进行抑菌活性研究。生物信息学分析显示BBChi4基因全长为2 181 bp,编码726个氨基酸,分子量大小为77.69 kD,等电点为4.83,属于酸性几丁质酶。破碎重组表达菌体上清液SDS-PAGE电泳显示,重组蛋白质分子量大约为78 kD,与生物信息学预测结果一致。诱导表达最佳参数为1 mmol/L IPTG,30℃诱导4 h。破碎重组表达菌体上清液对半夏致病真菌(尖孢镰刀菌)有较强的拮抗作用。重组表达载体pET-28a-BBchi4的成功构建及表达为深入研究几丁质酶的功能提供科学依据。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年08期）
刘利娟,刘裕峰,杨帅,刘应高[5]（2019）在《川西云杉几丁质酶基因PlCHI的克隆、表达与生物信息学分析》一文中研究指出以川西云杉(Picea likiangensis var. balfouriana (Rehd. et Wils.) Hillier ex Slsvin)为材料,利用RTPCR技术,克隆获得几丁质酶基因Pl CHI的cDNA全长序列,并对该基因的序列特征及基因表达情况进行分析。结果显示,Pl CHI的开放阅读框长1017 bp,共编码338个氨基酸;蛋白序列结构域分析结果表明,Pl CHI为ClassⅠ类几丁质酶,属19家族,兼具溶菌酶活性;该序列与其他植物几丁质酶的蛋白序列相似性较高。系统发育分析结果显示,川西云杉Pl CHI序列与北美云杉(Picea sitchensis (Bong.) Corr.)、黑松(Pinus thunbergii Parl.)等松科植物亲缘关系最近。进一步将Pl CHI重组质粒转入大肠杆菌BL21(DE3)中,表达出约45 k D的蛋白,主要以包涵体形式存在,且在25℃下采用0.2 mmol/L的IPTG诱导4 h时蛋白的表达量最佳。(本文来源于《植物科学学报》期刊2019年04期）
苏佩佩,赵欣宇,李妍,马慧玲,杨隆兵[6]（2019）在《家蝇几丁质酶MDCht2基因的序列分析、克隆与表达模式分析》一文中研究指出目的从家蝇的基因组库中筛选几丁质酶2(MDCht2)基因,进行cDNA克隆及分子特性分析,对其时空表达模式进行初步探索。方法从家蝇基因组数据库中筛选MDCht2基因,以该基因的cDNA为模板进行PCR扩增,采用生物信息学相关软件对MDCht2基因及其编码蛋白质的基本理化性质、信号肽、蛋白质结构等进行分析,预测蛋白质功能。取家蝇不同生活史时期(卵,1龄幼虫,2龄幼虫,3龄幼虫,蛹,雌雄成虫)及3龄幼虫不同组织(体壁,气管,马氏管,唾液腺,脂肪体,肠道)标本,采用实时荧光定量PCR检测MDCht2基因表达情况。结果 MDCht2基因cDNA全长1 932 bp,ORF框全长1 530 bp,编码509个氨基酸,理论相对分子质量为57.8×10~3,pI 5.67,属于亲水性的酸性蛋白,有信号肽,功能结构域位于第37～385位氨基酸间,无几丁质结合域。二级结构分析显示存在无规则卷曲(Cc),α螺旋(Hh),β折叠(Ee)3种类型。PCR扩增得到MDCht2基因长为1 530 bp的序列片段。实时荧光定量PCR检测家蝇MDCht2基因在蛹期的表达量较卵期上调6.477 01倍(P<0.01),3龄幼虫表达量上调2.655 25倍(P<0.01),1龄幼虫的表达量上调2.475 01倍(P<0.05),表达水平排列顺序为蛹>3龄幼虫>1龄幼虫>2龄幼虫>卵>雄成虫>雌成虫。以体壁为参照,MDCht2基因在家蝇气管中的表达量较高,气管中的表达量较体壁上调1.816 51倍(P<0.01),表达水平为气管>体壁>唾液腺>脂肪体>肠道>马氏管。结论成功克隆了家蝇的MDCht2基因并初步探索了其时空表达模式,即MDCht2基因在蛹期及气管组织高表达,为MDCht2的功能研究奠定了基础。(本文来源于《中国病原生物学杂志》期刊2019年06期）
李惠敏,李璐璐,陈玉梅,李佳慧[7]（2019）在《罗汉果几丁质酶基因家族的生物信息学分析》一文中研究指出几丁质酶是一类在植物抵抗病原真菌等过程中具有重要作用的蛋白质,为探讨几丁质酶在罗汉果抗根结线虫病中的调控作用,本研究基于南方根结线虫侵染下的罗汉果幼苗根系的转录组测序结果,采用生物信息学技术对筛选到的15个罗汉果几丁质酶基因进行分析。结果表明,15个罗汉果几丁质相关蛋白基因编码的氨基酸序列其N段均有一段信号肽,亚细胞定位在胞外;分子量从27 kDa到37 KDa不等;多数为酸性蛋白。基于氨基酸保守结构域和系统发育关系分析,15个罗汉果几丁质酶分属于GH18和GH19两大家族中的3个组别(Ⅰ、Ⅲ和Ⅳ)的成员,GH18家族成员叁级结构预测具有典型的(α/β)_8桶状结构,而GH19家族成员叁级结构预测只有α螺旋结构域。这些分析结果可为今后深入研究罗汉果几丁质酶的生物学功能和调控机制提供一定的理论依据,为罗汉果抗根结线虫病育种提供参考。(本文来源于《生物信息学》期刊2019年03期）
覃可,桑维钧,陈孝玉龙,李昊熙,杨茂发[8]（2019）在《烟草拮抗链霉菌FT05W基因组测序与几丁质酶家族基因鉴定》一文中研究指出链霉菌FT05W是一株对烟草黑胫病等土传真菌病害具有良好拮抗作用的生防放线菌。本研究利用Miseq PE300高通量测序平台对链霉菌FT05W基因组进行序列测定,共获得6914188个reads,通过SPAdes软件对序列进行拼接共得1836个contigs,其基因组全长为7699129 bp, GC比为71%,其中编码基因序列长度为6037181 bp,预测出7434个蛋白编码基因(GenBank登录号:NZ_QGMR00000000),预测编码7323个蛋白。获得的基因注释信息为今后深入开展其在烟草上的生物防治机理研究奠定了重要的基础,有助于推动烟草生防链霉菌功能基因的挖掘与利用,为烟草生防链霉菌FT05W的进一步开发与应用提供理论依据。利用MEGA 6.06构建链霉菌FT05W的几丁质酶家族基因系统发育树,共鉴定出7个几丁质酶家族基因,其中6个为18家族几丁质酶基因,1个为19家族基因。(本文来源于《中国生物防治学报》期刊2019年03期）
覃可[9]（2019）在《两株生防链霉菌全基因组测序分析及几丁质酶家族基因鉴定》一文中研究指出链霉菌FT05W(Streptomyces sp.FT05W)和ZEA17I(Streptomyces sp.ZEA17I)是两株对烟草黑胫病等土传真菌病害具有良好拮抗作用的生防放线菌。为了明确其系统进化关系,本研究应用了多位点序列分析的方法,对16S rDNA,gyrB、rpoB、atpD和recA五个基因进行扩增测序,利用上述基因序列与56个参考链霉菌菌株序列构建系统发育树。结果显示链霉菌FT05W在亲缘关系上与S.griseoplaus近缘;链霉菌ZEA17I是与S.griseobrunneus近缘。为了进一步探索两个菌株的生物学功能,本研究分别利用Miseq PE300和Illumina Hiseq测序平台对链霉菌FT05W、ZEA17I进行全基因组测序。结果表明,从链霉菌FT05W中共获得6914188个reads,平均序列长度为301 bp;其中reads1 91.60%的碱基序列测序质量值都高于20(Q20),reads1 82.94%的碱基序列测序质量值都高于30(Q30),reads283.99%的碱基序列测序质量值都高于20(Q20),reads2 72.00%的碱基序列测序质量值都高于30(Q30);reads1 N碱基的数目为130 bp,reads2 N碱基的数目为74 bp;reads1的GC含量为63.99%,reads2的GC含量为64.79%;通过SPAdes软件对序列进行拼接共得1836个contigs,其基因组全长为7699129 bp,预测出7434个蛋白编码基因(GenBank登录号:NZ_QGMR00000000)。另外,链霉菌ZEA17I共共获得5915444个reads,平均序列长度和链霉菌FT05W近似;其中reads1 89.98%的碱基序列测序质量值都高于20(Q20),reads1 78.71%的碱基序列测序质量值都高于30(Q30),reads2 73.26%的碱基序列测序质量值都高于20(Q20),reads2 57.93%的碱基序列测序质量值都高于30(Q30);reads1 N碱基的数目为36 bp,reads2 N碱基的数目为571 bp;reads1的GC含量为66.93%,reads2的GC含量为68.46%;通过SPAdes软件的拼接,得到1956个contigs,基因组全长为7526731bp,预测出6881个蛋白编码基因(GenBank登录号:NZ_QGMS01000000)。了解全基因组序列不仅对基因功能研究有着很大的促进作用,而且还能为物种间的相互作用、比较基因组学等更多的生物基础研究提供相关信息,此外,通过全基因组测序促进了生防链霉菌菌基因功能与生物学特性相关研究。此外,本研究还从对两个基因组进行了基因组注释、基因功能分类、比较基因组学、构建数据库等相关生物信息学分析。其中,在链霉菌FT05W中共鉴定出8个几丁质酶家族基因,其中ChiD、ChiO、ChiP为新发现基因,链霉菌ZEA17I中鉴定出10个几丁质酶家族基因,其中ChiD、ChiI、ChiQ、ChiT为新发现基因。利用Mega 6.0构建出的相关几丁质酶家族基因的系统发育树表明,链霉菌FT05W有6个18家族几丁质酶基因,2个19家族基因;链霉菌ZEA17I有9个18家族几丁质酶基因,1个19家族基因。几丁质酶能够分解真菌细胞壁的几丁质,为链霉菌防控植物病害的重要机理之一。随后,利用Protparam等多种软件对链霉菌FT05W、ZEA17I的几丁质酶家族基因进行了进一步的生物信息学分析。最后,对链霉菌FT05W中几丁质酶家族基因ChiA、ChiB、ChiC、ChiD、ChiN、ChiO、ChiP进行了实时荧光定量分析,6个18家族基因的相对表达水平均高于19家族基因,其中ChiD的相对表达量最高。最后,以天蓝色链霉菌msiK、dasD及ChiR基因作为参考,从基因组序列中查找链霉菌FT05W的的几丁质酶候选调控因子,确认了misK基因的存在,并且进行了misK基因敲除载体的尝试,为后续调控因子的调控效率研究奠定了一定的理论基础。(本文来源于《贵州大学》期刊2019-06-01）
林颢丞[10]（2019）在《小麦条锈菌几丁质酶基因Pst_23943的功能分析》一文中研究指出小麦(Triticum aestivum L.)是我国最重要的粮食作物之一。小麦条锈菌(Puccinia striiformis f.sp.tritici)是活体营养专性寄生真菌,其引起的小麦条锈病是威胁小麦生产及粮食安全的流行性真菌病害。小麦条锈菌变异频繁且发生迅速的特点是导致抗病品种抗性不断丧失,引发病害不断流行的主要原因。由于不能离体培养,缺乏可靠转化体系也使得条锈菌致病基因功能研究相对滞后。几丁质是构成真菌细胞壁的主要物质及关键组件,在自然界中含量巨大具有许多功能,其中包括在细胞分裂与极性生长期间保持细胞的机械稳定性,并且在侵染过程中初步接触寄主。绝大多数真菌几丁质酶属于GH18糖苷水解酶超家族并且在多个生长时期包括细胞壁降解和修饰的过程中发挥作用,例如孢子萌发,尖端生长和菌丝分枝,孢子分化,自溶和重寄生。为了抵御病原体,植物已经形成了复杂的免疫系统,包括识别病原体相关分子模式的质膜受体,例如来源于真菌细胞壁的几丁质,植物会在接触后产生防御反应。因此,对小麦识别病原体相关分子模式的研究对小麦条锈病的致病机理起着至关重要的作用。根据本实验室的基因组与转录组数据,发现几丁质酶基因Pst_23943在小麦条锈菌的芽管萌发及吸器母细胞形成时期上调表达明显。因此,采用PCR扩增技术得到了Pst_23943完整序列,再通过blast比对,预测到其属于GH18糖苷水解酶超家族。通过对其进行小麦原生质体定位发现,该基因定位于小麦的细胞质中;在小麦与条锈菌的亲和互作实验中发现,瞬时沉默基因Pst_23943后,侵染后期产孢量明显降低;qRT-PCR定量分析发现,小麦中的防御酶系在侵染过程中有大量表达的情况出现。通过DNS法实验证实了基因Pst_23943表达出来的活性蛋白可以有效地降解几丁质。综上表明,基因Pst_23943表达出来的活性蛋白能有效地与几丁质酶结合并降解几丁质,并且参与小麦条锈菌致病,帮助条锈菌侵染。为研究小麦条锈菌侵染以及小麦抗病的机制提供了一个新的思路,也为将来研究提高小麦对小麦条锈菌的抗病性提供了一些新的基础。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2019-05-01）
儿丁质酶基因论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
几丁质酶(chitinase)在甲壳动物的蜕皮、消化和免疫等很多生物学过程中发挥重要功能,为深入探讨几丁质酶的免疫防御机制,本实验利用RACE技术克隆了叁疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)PtCht6基因。该基因cDNA全长2736bp,开放阅读框(ORF)2103bp,编码700个氨基酸,具有几丁质酶GH18家族典型特征。利用实时荧光定量技术分析PtCht6在叁疣梭子蟹不同组织、不同蜕皮阶段、不同病原感染以及低盐胁迫(11)下的表达特征,结果显示:PtCht6在各组织中均有表达且在肝胰腺中的表达量最高;在不同蜕皮时期的肝胰腺中,其表达量由蜕皮后期(A/B)、蜕皮间期(C)、蜕皮前期(D)依次递减(P<0.05);人工感染WSSV和副溶血弧菌后.PtCht6的表达量在肝胰腺中分别于12h、72h达到最大值,在血细胞中均于12h达到最大值,且相较于对照组,整体显着上调表达(P<0.05);低盐胁迫能够显着抑制该基因的表达,最高抑制73倍(P<0.05)。同时发现,低盐环境下感染WSSV后,该基因达到峰值的时间明显延迟(至少延迟12h.P<0.05)。该研究结果预示PtCht6作为免疫因子参与叁疣梭子蟹的病原防御,且低盐胁迫在一定程度上抑制了该基因的免疫功能。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
儿丁质酶基因论文参考文献
[1].徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽.小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析[J].河南农业科学.2019
[2].宋柳,吕建建,王磊,孙东方,刘萍.叁疣梭子蟹几丁质酶基因(PtCht6)的克隆及其在免疫中的功能分析[J].海洋与湖沼.2019
[3].杨晋明,王铭,杜建中.转几丁质酶基因甜瓜植株的获得及生物学鉴定[J].中国农业文摘-农业工程.2019
[4].陶小买,曾丽娜,贾化可,张婷婷,任建国.短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究[J].基因组学与应用生物学.2019
[5].刘利娟,刘裕峰,杨帅,刘应高.川西云杉几丁质酶基因PlCHI的克隆、表达与生物信息学分析[J].植物科学学报.2019
[6].苏佩佩,赵欣宇,李妍,马慧玲,杨隆兵.家蝇几丁质酶MDCht2基因的序列分析、克隆与表达模式分析[J].中国病原生物学杂志.2019
[7].李惠敏,李璐璐,陈玉梅,李佳慧.罗汉果几丁质酶基因家族的生物信息学分析[J].生物信息学.2019
[8].覃可,桑维钧,陈孝玉龙,李昊熙,杨茂发.烟草拮抗链霉菌FT05W基因组测序与几丁质酶家族基因鉴定[J].中国生物防治学报.2019
[9].覃可.两株生防链霉菌全基因组测序分析及几丁质酶家族基因鉴定[D].贵州大学.2019
[10].林颢丞.小麦条锈菌几丁质酶基因Pst_23943的功能分析[D].西北农林科技大学.2019
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