17种分类算法在牛肝菌种类鉴别研究中的应用

17种分类算法在牛肝菌种类鉴别研究中的应用

论文摘要

由于部分毒菌与野生食用菌形态和生物学特征相似,农民仅凭经验采集,难免将两者混淆,从而导致严重的食品安全事故。云南省作为国内野生食用菌产量最高、出口量最大的省份,野生食用菌产业发展为云南农村经济发展做出了突出贡献,对不同种类野生食用菌进行快速鉴别,有利于野生食用菌产业的健康发展;分析食用菌亲缘关系,对食用菌育种工作具有积极作用。七种牛肝菌样品,采自云南及周边七个产地,利用FTIR光谱仪分别采集菌柄和菌盖红外指纹图谱,基于低级与中级数据融合策略,将预处理后的菌柄和菌盖FTIR光谱数据进行融合,结合Decision Trees,Discriminant Analysis,Logistic Regression Classifiers,Support Vector Machines,Nearest Neighbor Classifiers和Ensemble Classifiers中的17种算法,分别建立菌柄、菌盖、低级数据融合和中级数据融合模型,每个分类模型连续进行10次运算,通过比较训练集分类正确率平均值,确定牛肝菌种类鉴别最佳分类算法。中级数据融合数据集进行系统聚类分析(HCA),对推测不同种类牛肝菌样品的亲缘关系进行鉴定。结果显示:(1)菌柄、菌盖和低级数据融合模型最佳分类算法均为Linear Discriminant,训练集分类正确率分别为92.8%,96.4%和97.6%。中级数据融合模型最佳分类算法为Subspace Discriminant,训练集分类正确率为100%;(2)菌柄、菌盖、低级数据融合和中级数据融合最佳分类模型,全部样品分类正确率平均值分别为93.61%,95.54%,96.99%和99.88%,中级数据融合模型优于其他三种模型,表明中级数据模型可以将相似度较高的样品区分开,且减少了产地对种类鉴别的影响;(3)中级数据融合模型数据集进行HCA,华丽牛肝菌和美味牛肝菌聚类距离最小,表明这两种牛肝菌化学信息较相似,亲缘关系较近;(4)华丽牛肝菌与皱盖疣柄牛肝菌聚类临界值距离最大,表明样品化学信息差异较大,亲缘关系较远。综上表明,基于中级融合策略将不同部位FTIR光谱数据融合,结合Subspace Discriminant与HCA,可以准确鉴别不同种类牛肝菌和快速推测样品亲缘关系,可作为野生食用菌种类鉴别与亲缘关系推测的一种新方法。

论文目录

  • 引言
  • 1 实验部分
  •   1.1 样品
  •   1.2 仪器与试剂
  •   1.3 样品处理及FTIR光谱采集
  •   1.4 光谱数据预处理
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 FTIR光谱分析
  •   2.2 分类算法的选择
  •   2.3 不同模型最佳分类算法比较
  •   2.4 系统聚类分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张钰,李杰庆,李涛,刘鸿高,王元忠

    关键词: 牛肝菌,种类鉴别,不同部位,数据融合

    来源: 光谱学与光谱分析 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 化学,轻工业手工业

    单位: 云南农业大学农学与生物技术学院,云南省农业科学院药用植物研究所,玉溪师范学院资源环境学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31660591,21667031),云南省教育厅科学研究基金项目(2016ZZX106),云南省高校食用菌资源开发与利用重点实验室建设项目资助

    分类号: O657.33;TS219

    页码: 448-453

    总页数: 6

    文件大小: 515K

    下载量: 189

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