甜樱桃品种中新多态性SSR的鉴定、指纹图谱构建及聚类分析

甜樱桃品种中新多态性SSR的鉴定、指纹图谱构建及聚类分析

论文摘要

【目的】应对迅速增加的甜樱桃品种及其分子鉴定需求,储备一批新多态性SSR,并获得其在甜樱桃品种中的基因型数据。【方法】从甜樱桃基因组测序开发的SSR库中,根据重复单元和重复次数在8条染色体上一共选择了96个SSR。用ABI3730,鉴定出其中9个SSR在4个代表甜樱桃品种中具有多态性。另外从305个李属SSR中又鉴定出9个多态性SSR。用S基因和多态性SSR排除了52个品种122个单株中S基因型不正确和混杂的品种或单株,然后用多态性信息比价高的11个SSR(其中包括8个新SSR)和S基因标记,构建了48个甜樱桃品种的指纹图谱库,并获得了可以区分48个品种的最少标记组合。【结果】聚类分析表明,48个甜樱桃品种组成了短低温组、中国组、北美组和东欧组。聚类分析结果可以和品种间亲缘关系及地域来源互相验证。【结论】鉴定了3个从未报道的甜樱桃品种的S基因型,验证了一种可以有效获得多态性SSR的途径,提供了9个新的多态性SSR及其等位基因大小,用12个分子标记构建了48个甜樱桃品种指纹图谱。本文提供的新SSR及其构建的甜樱桃品种指纹图谱真实可靠。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 DNA提取
  •   1.3 多态SSR引物筛选
  •   1.4 甜樱桃品种指纹图谱构建和聚类分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 多态性SSR引物及其片段大小
  •   2.2 甜樱桃品种的指纹图谱构建和聚类分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王晶,张开春,张晓明,闫国华,周宇,段续伟,陈玲

    关键词: 甜樱桃,指纹图谱,基因型

    来源: 果树学报 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 园艺

    单位: 北京市林业果树科学研究院,农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京市落叶果树工程技术研究中心

    基金: 北京市农林科学院协同创新专项(KJCX201910),北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20161504,KJCX20170111),国家自然科学基金(31601726)

    分类号: S662.5

    DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20190134

    页码: 1619-1629

    总页数: 11

    文件大小: 1165K

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