大数据下激活和抑制人左脑基于不同物质结合的外泌体认知的新网络

论文摘要

本文从GEO GDS2678构建的441个在人类左脑相比于黑猩猩左脑显著性高表达的基因(SAM算法(倍数变化≥2))组成的总CC数据库之中,原创构建了对应的激活或者抑制分子的CC数据库,并进一步分别构建USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2的激活或抑制两两正相关分子库。根据GRNInfer并整合DAVID和MAS 3.0构建上述分子的人左脑直接激活或抑制的上下游反馈分子和知识网络。结果显示USP14,AK3P1,BAG5,HERC2P3,ARF6以及STAT2来自于人左脑并与认知相关,均含外泌体。其中USP14下游激活网络包括细胞质、线粒体、细胞基质、质膜、细胞质核周区、膜、溶酶体膜、质膜整体成分、膜的整体成分和溶酶体,以此提出并验证USP14网络通过除核外的病毒受体激活基于外泌体的认知;AK3P1下游激活网络包含细胞质、细胞核、细胞基质、线粒体、核质和膜,以此提出并验证AK3P1网络通过蛋白质、ATP和poly(A)RNA结合激活基于外泌体的认知;BAG5上游激活网络则含细胞核、核质、细胞质、细胞质基质、膜,从而提出并验证基于外泌体的认知通过蛋白质和DNA结合激活BAG5网络;HERC2P3上游激活网络含细胞核、核质、细胞质、膜、细胞质基质和细胞核,以此提出并验证基于外泌体的认识通过除核仁外的RNA结合激活HERC2P3网络;ARF6下游抑制网络则含细胞质基质、细胞核、细胞质、质膜、膜和肌动蛋白细胞骨架,以此提出并验证ARF6网络通过除细胞内膜外的蛋白结合抑制基于外泌体的认知;STAT2上游抑制网络含细胞质基质、细胞质、线粒体以及膜的整体成分,以此提出并验证基于外泌体的认知通过细胞质ATP和金属离子结合抑制STAT2网络。

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文章来源

类型: 硕士论文

作者: 史玉涵

导师: 王琳

关键词: 人左脑,不同物质结合,外泌体认知,激活和抑制网络,大数据

来源: 北京邮电大学

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,信息科技

专业: 生物学,基础医学,计算机软件及计算机应用

单位: 北京邮电大学

分类号: R338;TP311.13

总页数: 62

文件大小: 3281K

下载量: 38

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