论文摘要
为明确分离自黑龙江省克山县马铃薯上的2个病毒分离物KS4和KS7的分类地位,通过RTPCR扩增、克隆获得其基因组序列,利用重组分析程序包和最大似然法分别进行重组分析和系统发育分析。结果显示,分离物KS4和KS7的开放阅读框均有9 186个核苷酸,编码3 061个氨基酸,分离物KS4的核苷酸和氨基酸序列均与马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)分离物Mb112一致率最高,分别为96.9%和98.4%;分离物KS7的核苷酸序列与PVY分离物12-94一致率最高,为97.4%,其氨基酸序列与PVY分离物SYR-Ⅱ-Be1一致率最高,为97.8%。重组分析表明,分离物KS4和KS7均为分离物N-605和Oz的重组体,其中KS4基因组5′-端的2 392个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz;KS7基因组的第800~2 227个核苷酸和第5 637~8 950个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz。系统发育分析发现,分离物KS4被聚类到N:O株系(PVYN:O),分离物KS7被聚类到NTN株系(PVYNTN)b型。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 程林发,张凤桐,姜瀚林,白艳菊,耿超,李向东
关键词: 马铃薯病毒,一致率,重组,系统发育分析
来源: 植物保护学报 2019年06期
年度: 2019
分类: 农业科技
专业: 植物保护
单位: 山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室,黑龙江省农业科学院
基金: 国家自然科学基金(31571984,31720103912),泰山学者建设工程(TS201712023)
分类号: S435.32
DOI: 10.13802/j.cnki.zwbhxb.2019.2018207
页码: 1186-1194
总页数: 9
文件大小: 2388K
下载量: 108
相关论文文献
- [1].辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析[J]. 植物保护 2017(02)
- [2].甘蔗花叶病毒第Ⅳ组分离物RT-PCR检测体系的建立及应用[J]. 植物病理学报 2017(04)
- [3].小西葫芦黄花叶病毒辽宁分离物的鉴定与序列分析[J]. 福建农林大学学报(自然科学版) 2017(05)
- [4].小西葫芦黄花叶病毒石河子分离物的分子变异[J]. 石河子大学学报(自然科学版) 2015(06)
- [5].黄瓜绿斑驳花叶病毒海南分离物基因组测定与毒源分析[J]. 植物保护 2014(06)
- [6].甜菜西方黄化病毒两个山东辣椒分离物全基因组扩增及序列分析[J]. 植物病理学报 2020(05)
- [7].瓜类褪绿黄化病毒山东分离物全基因组序列扩增及分析[J]. 植物保护学报 2019(06)
- [8].黄瓜花叶病毒贵州辣椒分离物外壳蛋白基因序列分析[J]. 南方农业学报 2020(01)
- [9].甘蔗花叶病毒福州分离物全基因组克隆及种群分析[J]. 植物病理学报 2016(06)
- [10].甘蔗花叶病毒2个山东分离物的全基因组序列分析[J]. 植物病理学报 2017(03)
- [11].烟草丛顶病毒云南不同分离物全基因组序列测定与分析[J]. 云南农业大学学报(自然科学) 2017(03)
- [12].李属坏死环斑病毒新疆分离物运动蛋白基因片段的克隆与序列分析[J]. 植物保护学报 2015(04)
- [13].人体分离物的法律属性及其权利归属[J]. 法制与社会 2014(05)
- [14].侵染丝瓜的黄瓜绿斑驳花叶病毒山东分离物分子鉴定[J]. 山东农业科学 2014(08)
- [15].黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物的分子鉴定[J]. 广东农业科学 2011(20)
- [16].香蕉束顶病毒海口分离物基因组的克隆及序列分析[J]. 植物病理学报 2010(01)
- [17].黄瓜绿斑驳花叶病毒的分子检测及云南分离物的序列分析[J]. 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2010(03)
- [18].芜菁花叶病毒四川分离物外壳蛋白基因的克隆及序列分析[J]. 四川大学学报(自然科学版) 2010(03)
- [19].辣椒轻斑驳病毒凤城分离物的鉴定、全基因测序及系统进化分析[J]. 植物保护 2017(02)
- [20].黄瓜绿斑驳花叶病毒山西西瓜分离物外壳蛋白基因序列分析[J]. 植物保护 2015(02)
- [21].昆明番茄斑萎病毒不同分离物N基因遗传多样性分析[J]. 西南农业学报 2013(01)
- [22].花生青枯菌红安分离物的鉴定[J]. 中国油料作物学报 2010(01)
- [23].油菜花叶病毒山西地黄分离物的全基因组序列测定与分析[J]. 植物病理学报 2016(05)
- [24].烟草脉带花叶病毒云南分离物全基因序列分析[J]. 中国烟草科学 2015(05)
- [25].基于外壳蛋白核酸序列的中国黄瓜绿斑驳花叶病毒分离物起源分析[J]. 江西农业大学学报 2008(04)
- [26].建兰花叶病毒贵州分离物的分子鉴定[J]. 植物检疫 2014(05)
- [27].小麦黄花叶病毒河南驻马店分离物的鉴定与全序列分析[J]. 华北农学报 2010(02)
- [28].南瓜蚜传黄化病毒湖北和云南分离物的部分序列分析[J]. 植物病理学报 2008(01)
- [29].侵染葫芦的黄瓜绿斑驳花叶病毒广西分离物分子鉴定[J]. 植物保护 2008(01)
- [30].瓜类褪绿黄化病毒新疆分离物基因组分析[J]. 植物病理学报 2017(06)