两个马铃薯Y病毒黑龙江马铃薯分离物株系鉴定

两个马铃薯Y病毒黑龙江马铃薯分离物株系鉴定

论文摘要

为明确分离自黑龙江省克山县马铃薯上的2个病毒分离物KS4和KS7的分类地位,通过RTPCR扩增、克隆获得其基因组序列,利用重组分析程序包和最大似然法分别进行重组分析和系统发育分析。结果显示,分离物KS4和KS7的开放阅读框均有9 186个核苷酸,编码3 061个氨基酸,分离物KS4的核苷酸和氨基酸序列均与马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)分离物Mb112一致率最高,分别为96.9%和98.4%;分离物KS7的核苷酸序列与PVY分离物12-94一致率最高,为97.4%,其氨基酸序列与PVY分离物SYR-Ⅱ-Be1一致率最高,为97.8%。重组分析表明,分离物KS4和KS7均为分离物N-605和Oz的重组体,其中KS4基因组5′-端的2 392个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz;KS7基因组的第800~2 227个核苷酸和第5 637~8 950个核苷酸来自分离物N-605,其余核苷酸来自分离物Oz。系统发育分析发现,分离物KS4被聚类到N:O株系(PVYN:O),分离物KS7被聚类到NTN株系(PVYNTN)b型。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 马铃薯植株总RNA提取及病毒基因组扩增
  •     1.2.2 PVY分离物的基因组特征及序列一致率分析
  •     1.2.3 PVY分离物KS4和KS7基因组重组分析
  •     1.2.4 PVY分离物KS4和KS7的系统发育分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PVY分离物KS4和KS7的基因组特征
  •   2.2 PVY分离物KS4和KS7的核苷酸和氨基酸一致率
  •   2.3 PVY分离物KS4和KS7的重组类型
  •   2.4 PVY分离物KS4和KS7的系统发育分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 程林发,张凤桐,姜瀚林,白艳菊,耿超,李向东

    关键词: 马铃薯病毒,一致率,重组,系统发育分析

    来源: 植物保护学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 植物保护

    单位: 山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室,黑龙江省农业科学院

    基金: 国家自然科学基金(31571984,31720103912),泰山学者建设工程(TS201712023)

    分类号: S435.32

    DOI: 10.13802/j.cnki.zwbhxb.2019.2018207

    页码: 1186-1194

    总页数: 9

    文件大小: 2388K

    下载量: 108

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